chr1 839741 840250 839788 Y NA SAMD11 NA NA NA NA SAMD11 18010 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 840753 841210 840812 Y NA SAMD11 NA NA NA NA SAMD11 17050 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr1 1136667 1137146 1136877 Y HES4,MIB2 SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA SDF4 28265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20 NA NA NA NA AURKAIP1 12543 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 1611804 1612115 1611960 Y NA CDK11B,CDK11A NA NA NA NA CDK11B 23331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 1708824 1709349 1708980 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 547 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 1793829 1793862 1793845 Y CDK11B,CDK11A GNB1 NA NA NA NA GNB1 26633 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.29952391057686 chr1 2231691 2232185 2232046 Y SKI,TNFRSF14 NA NA NA NA NA MORN1 88961 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 2246556 2246763 2246722 Y SKI NA NA NA NA NA MORN1 74383 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 21376 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 22237 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.83961912846149 chr1 3128621 3128847 3128817 Y NA NA NA NA NA NA PRDM16 144889 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 3133891 3134283 3134074 Y PRDM16 NA NA NA NA NA PRDM16 150159 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 3186377 3186508 3186443 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 182482 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 3297180 3297261 3297221 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 71729 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 3463934 3464260 3464145 Y ARHGEF16 NA NA NA NA NA MEGF6 61799 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr1 4342218 4342503 4342420 Y NA NA NA NA NA NA AJAP1 370289 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 6342321 6342466 6342446 Y NA ICMT,GPR153 NA NA NA NA GPR153 23286 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 6760819 6760983 6760901 Y NA DNAJC11 NA NA NA NA DNAJC11 835 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 6779783 6779914 6779849 Y NOL9,DNAJC11 DNAJC11 CAMTA1,DNAJC11 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC11 19799 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 6894689 6894717 6894703 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 51305 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 7207208 7207593 7207350 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 363824 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 7331930 7332127 7331990 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 488546 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 7742006 7742141 7742074 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 87188 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 8198088 8198334 8198235 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-7P 66323 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 8254637 8254907 8254798 Y NA RNU1-7P ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-7P 9750 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 8450820 8451072 8450834 Y RERE,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 74934 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 8469706 8470061 8470001 Y NA NA NA NA NA NA SLC45A1 93820 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 8571636 8571856 8571737 Y SLC45A1,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 195750 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 8690020 8690153 8690087 Y NA NA NA NA NA NA RERE 185549 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 8712702 8713010 8712859 Y NA NA NA NA NA NA RERE 162692 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 8724042 8724475 8724233 Y NA NA NA NA NA NA RERE 151227 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 8810273 8810466 8810370 Y NA NA NA NA NA NA RERE 65236 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 8858188 8858497 8858477 Y NA RERE NA NA NA NA RERE 17205 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 8933581 8933925 8933847 Y NA ENO1 NA NA NA NA ENO1 3383 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 9298798 9298942 9298853 Y NA H6PD NA NA NA NA H6PD 5964 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.52947630163455 chr1 9760502 9760837 9760631 Y NA RP11-558F24.4 NA NA NA NA RP11-558F24.4 14889 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 10245595 10245867 10245731 Y NA KIF1B NA NA NA NA KIF1B 22996 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 10359215 10359483 10359349 Y NA NA NA NA NA NA KIF1B 90352 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 10496880 10497075 10496978 Y KIF1B PGD,APITD1,APITD1-CORT,PEX14,DFFA NA NA NA NA APITD1,APITD1-CORT 8721 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 10816030 10816223 10816138 Y CASZ1 CASZ1 NA NA NA NA CASZ1 38484 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 10927237 10927380 10927309 Y CASZ1 NA PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127 IMR90 Hi-C 24141950 CASZ1 72530 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 11050864 11051128 11051022 Y NA TARDBP C1orf127 IMR90 Hi-C 24141950 TARDBP 19286 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 11410602 11410834 11410718 Y NA NA FBXO2,FBXO44,UBIAD1 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 79339 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA RNU5E-1 2301 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 12217829 12218258 12218109 Y NA TNFRSF1B NA NA NA NA TNFRSF1B 6802 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 14027926 14028325 14027982 Y PRDM2,PRDM2,PRDM2 PRDM2 NA NA NA NA PRDM2 3233 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 14029077 14029879 14029437 Y PRDM2,PRDM2,PRDM2 PRDM2 NA NA NA NA PRDM2 4384 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 14638404 14638703 14638561 Y NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 KAZN 284497 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 14765058 14765382 14765172 Y NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 KAZN 157818 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 15743639 15744318 15744205 Y NA EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 9248 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 15827976 15828116 15828046 Y NA CASP9,DNAJC16 NA NA NA NA CASP9 22913 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 15946733 15946892 15946831 Y EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,DDI2 AGMAT,RP4-680D5.2,CHCHD2P6,DDI2 NA NA NA NA DDI2 4738 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 16292565 16293101 16292653 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 7526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 16670445 16670837 16670642 Y SPEN,C1orf64,FBXO42 FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 6112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 16677236 16677843 16677569 Y ZBTB17,FBXO42 FBXO42 RSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO42 287 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA RNU1-1 SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-1 12489 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.82900021221141 chr1 17020007 17020088 17020064 Y NA EIF1AXP1 NA NA NA NA EIF1AXP1 9457 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.75942869269224 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.06957151951918 chr1 19078001 19078369 19078185 Y NA NA NA NA NA NA ALDH4A1 148906 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 19277155 19277462 19277361 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 3718 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 19703880 19704261 19704067 Y NA NA NA NA NA NA PQLC2 67060 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 21149682 21149798 21149749 Y CAMK2N1,EIF4G3 HP1BP3 NA NA NA NA HP1BP3 37866 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 21194399 21194490 21194445 Y NA NA NA NA NA NA HP1BP3 82583 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 21406931 21406946 21406939 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 8685 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 21476251 21476624 21476546 Y NA EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 24753 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 21611199 21611583 21611510 Y EIF4G3,ECE1,ALPL,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 58414 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 21663991 21664182 21664145 Y EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 5815 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 21664947 21665143 21665070 Y EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 4854 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 22066009 22066225 22066117 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 41874 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 22647063 22647428 22647272 Y NA NA C1QC,C1QB,WNT4,CDC42,C1QA,EPHA8 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 128916 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 23426690 23427100 23426944 Y NA NA NA NA NA NA LUZP1 75201 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 23589856 23590232 23590037 Y NA NA KDM1A,HTR1D,LUZP1,LOC729059,HNRNPR,TCEA3,E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPR 78597 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 24516636 24516983 24516740 Y PNRC2,GRHL3 IL22RA1 MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130 IMR90 Hi-C 24141950 IL22RA1 49025 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 25566195 25566411 25566257 Y TMEM57 SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9202 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 25942744 25943208 25942998 Y EXTL1,MAN1C1 NA NA NA NA NA LDLRAP1 74673 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr1 27021406 27021810 27021509 Y NA ARID1A NA NA NA NA ARID1A 882 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.95459532399033 chr1 27383957 27384315 27384137 Y GPR3 FAM46B C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46B 46630 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 27561705 27561803 27561716 Y NA WDTC1 NA NA NA NA WDTC1 2698 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,CD164L2,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 27772061 27772370 27772216 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 42299 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 27901397 27901604 27901422 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 27338 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 28011929 28012287 28012105 Y NA IFI6,FAM76A STX12,FAM76A,PPP1R8,WASF2,IFI6 IMR90 Hi-C 24141950 IFI6 15200 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 28318645 28318992 28318812 Y FAM76A XKR8 NA NA NA NA XKR8 34672 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr1 28970474 28970729 28970677 Y NA TAF12,RNU11,GMEB1 NA NA NA NA RNU11 2383 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 30503990 30504255 30504120 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 875353 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 31251287 31251533 31251452 Y NA NA LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDC3 128075 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 31483120 31483355 31483250 Y NA NA NA NA NA NA PUM1 53483 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.64445249716339 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr1 31770743 31770927 31770835 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 2901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 31772172 31772177 31772175 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 4330 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 32170830 32171205 32171045 Y NA COL16A1 NA NA NA NA COL16A1 2910 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 32180603 32180986 32180867 Y PEF1,SPOCD1,COL16A1 COL16A1,BAI2 PEF1,COL16A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL16A1 12683 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 32253647 32254040 32253861 Y LCK BAI2 NA NA NA NA BAI2 25153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 32732571 32732683 32732626 Y LCK EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,HDAC1 NA NA NA NA HDAC1 23004 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8B,ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr1 33094923 33095323 33095277 Y NA ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 19181 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 33131314 33131452 33131383 Y NA ZBTB8OS,RBBP4,SYNC NA NA NA NA RBBP4 16571 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 33220297 33220575 33220521 Y NA KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 14811 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 33438571 33438703 33438616 Y KIAA1522,ADC RNF19B NA NA NA NA RNF19B 10285 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 33454783 33455472 33455325 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 26497 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 33500817 33500865 33500842 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA AK2 43732 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 35389087 35389416 35389318 Y DLGAP3 DLGAP3 DLGAP3,ZMYM6NB,LOC653160 IMR90 Hi-C 24141950 DLGAP3 3770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 35394262 35394654 35394275 Y NA DLGAP3 NA NA NA NA DLGAP3 1076 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 36173458 36173573 36173482 Y TEKT2,EIF2C1 C1orf216 NA NA NA NA C1orf216 9500 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 36489072 36489418 36489191 Y NA NA COL8A2,TEKT2,ADPRHL2 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT2 58258 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 37784198 37784531 37784441 Y GRIK3,EPHA10 NA GRIK3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01137 153481 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 38317043 38317898 38317556 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 5394 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 39509536 39509726 39509631 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 19546 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 39629010 39629413 39629213 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 84022 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 40005546 40005959 40005647 Y NA PPIEL,PABPC4 NA NA NA NA PPIEL 16420 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 40006104 40006751 40006634 Y MFSD2A,PABPC4 PPIEL,PABPC4 NA NA NA NA PPIEL 15628 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 40081061 40081282 40081172 Y BMP8A PABPC4,HEYL NA NA NA NA HEYL 22335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 40504860 40505165 40505013 Y ZNF684,ZNF642,DEM1,BMP8B,PPT1,CAP1 CAP1 NA NA NA NA CAP1 955 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 41005233 41005440 41005262 Y RLF RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA ZNF684 10000 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 41495531 41495820 41495676 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 169513 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 41501440 41501773 41501639 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 175422 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 41823971 41824199 41824094 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1395 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 41831444 41831806 41831485 Y SCMH1 FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 5850 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 41981831 41982007 41981926 Y SLFNL1,SLFNL1 NA NA NA NA NA FOXO6 156237 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 42272535 42272820 42272654 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 226776 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 42354251 42354647 42354385 Y RIMKLA,HIVEP3 NA NA NA NA NA HIVEP3 144949 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 42366364 42366624 42366514 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132972 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr1 44232152 44232509 44232262 Y SLC6A9,IPO13,ST3GAL3 NA NA NA NA NA ST3GAL3 62657 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 44354357 44354471 44354414 Y SZT2,KDM4A,ST3GAL3,IPO13 NA NA NA NA NA RP11-7O11.3 55752 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 44419838 44419961 44419903 Y SLC6A9,RNF220,IPO13 RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24 NA NA NA NA IPO13 9227 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24,SLC6A9 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A9 545 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr1 45028023 45028056 45028040 Y NA NA NA NA NA NA TMEM53 110171 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 45286834 45287205 45286951 Y NA RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,RNU5E-6P,PTCH2 NA NA NA NA RNU5E-6P 3165 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 45298718 45299070 45298894 Y NA PLK3,RNU5E-6P,PTCH2 NA NA NA NA PTCH2 7665 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 45376274 45376331 45376304 Y NA CCNB1IP1P1 NA NA NA NA CCNB1IP1P1 45898 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr1 46575103 46575175 46575140 Y PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA PIK3R3 64985 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 46902512 46902655 46902542 Y NA FAAH NA NA NA NA FAAH 44575 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 47055088 47055141 47055115 Y NA MKNK1 NA NA NA NA MKNK1 25374 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 47718105 47718425 47718265 Y NA TAL1 TAL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAL1 22213 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 47729037 47729382 47729210 Y NA TAL1,STIL TAL1 K562 ChIA-PET 22265404 TAL1 33145 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 48935854 48936015 48935919 Y NA SPATA6 NA NA NA NA SPATA6 9 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 49250651 49250822 49250750 Y NA BEND5 NA NA NA NA BEND5 10010 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 50141272 50141561 50141492 Y NA NA NA NA NA NA AGBL4 346024 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 50619908 50620155 50620032 Y NA NA NA NA NA NA AGBL4 132323 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 51034551 51034734 51034643 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA2 147379 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 51198410 51198537 51198468 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 225398 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 51245588 51245972 51245952 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 177963 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 51703075 51703494 51703244 Y OSBPL9 RNF11 NA NA NA NA RNF11 3132 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA EPS15 NA NA NA NA EPS15 47408 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 52088228 52088763 52088412 Y NA OSBPL9 NA NA NA NA OSBPL9 47377 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 52132018 52132585 52132263 Y TXNDC12,EPS15,NRD1,NRD1,OSBPL9 NA NA NA NA NA OSBPL9 91167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 52628189 52628583 52628480 Y NA ZFYVE9,RP4-800M22.2 NA NA NA NA RP4-800M22.2 1491 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 52999324 52999688 52999506 Y NA ZCCHC11 PRPF38A,ORC1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC11 17471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 53092647 53093031 53092839 Y NA GPX7,FAM159A NA NA NA NA FAM159A 3985 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 53369161 53369511 53369336 Y SCP2,ECHDC2 ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA ECHDC2 21373 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 53385696 53386052 53386029 Y NA ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA ECHDC2 4832 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 54237165 54237506 54237336 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 116901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 54260217 54260562 54260390 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93845 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 54286238 54286401 54286368 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 68006 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr1 54713635 54713793 54713710 Y YIPF1 CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 49926 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 54715450 54715803 54715579 Y NA NA NA NA NA NA CYB5RL 51741 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 54810685 54810861 54810859 Y NA NA NA NA NA NA SSBP3 66291 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 54842500 54842749 54842625 Y NA SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 34403 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 54940444 54940824 54940607 Y NA NA TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 63292 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACOT11 51605 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.95459532399033 chr1 55279986 55280085 55280013 Y NA NA NA NA NA NA PARS2 51799 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 55725974 55726130 55726052 Y NA USP24 USP24,LOC100507634,PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 USP24 47188 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 57024882 57025247 57025166 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 83727 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 58020370 58020682 58020526 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 911375 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 59008745 59009101 59008916 Y NA DAB1,OMA1,TACSTD2 NA NA NA NA DAB1 1305 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA JUN 121264 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr1 59395500 59395772 59395634 Y JUN NA FGGY,JUN,LOC100131060 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 147715 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 59608045 59608421 59608204 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 151889 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 59756067 59756566 59756452 Y FGGY FGGY LOC100131060,HSD52,FGGY IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 3744 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 60157078 60157331 60157204 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 396768 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 60944384 60944420 60944402 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 384511 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 61039424 61039611 61039555 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 289320 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 61522505 61523042 61522705 Y NFIA,NFIA,NFIA NA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 193574 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 61543611 61543877 61543752 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 214680 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 62208815 62209373 62208933 Y NA TM2D1,INADL NA NA NA NA INADL 2666 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 62307827 62308113 62307970 Y NA NA NA NA NA NA INADL 101678 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 62948948 62949316 62949132 Y KANK4,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 48980 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 64417224 64417447 64417336 Y ROR1 NA NA NA NA NA CFL1P3 109868 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 64500766 64501176 64500970 Y UBE2U NA NA NA NA NA CFL1P3 193410 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 65421731 65422136 65422135 Y NA JAK1,RP11-182I10.3 NA NA NA NA JAK1 8051 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 66817705 66818086 66817818 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 178980 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 66930584 66930841 66930604 Y NA NA PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 SGIP1 66225 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 67883059 67883215 67883204 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 10883 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 68234822 68235039 68234951 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 62111 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 68945486 68945782 68945636 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 15122 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 70418678 70418852 70418759 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC40 250451 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 7215 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 71413812 71414188 71413950 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB2 130792 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 76645391 76645540 76645467 Y NA NA NA NA NA NA ST6GALNAC3 106987 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA NA NA NA NA NA PIGK 86739 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 78019403 78019530 78019478 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 127574 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 78021710 78022056 78021808 Y AK5,AK5,FAM73A NA NA NA NA NA ZZZ3 125048 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 78026939 78027232 78027062 Y FAM73A NA NA NA NA NA ZZZ3 119872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 78132928 78133068 78133059 Y NA ZZZ3 NA NA NA NA ZZZ3 14036 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 78196845 78197195 78197020 Y NA ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 26342 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 78214350 78214750 78214605 Y NA USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 8787 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 78350506 78350835 78350671 Y FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 1363 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 78441093 78441406 78441347 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 1388 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 79154444 79154658 79154581 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 711585 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 772913 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 80973840 80974001 80973921 Y NA NA NA NA NA NA RP3-445O10.1 698252 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 81240939 81241123 81241017 Y NA NA NA NA NA NA RP3-445O10.1 431130 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.79421445245183 chr1 81344955 81344988 81344971 Y NA NA NA NA NA NA RP3-445O10.1 327265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 81692088 81692450 81692146 Y NA RP3-445O10.1 NA NA NA NA RP3-445O10.1 19835 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 81773648 81773921 81773744 Y NA LPHN2 NA NA NA NA LPHN2 3803 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 81843973 81844266 81844258 Y NA NA NA NA NA NA LPHN2 74128 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 81941853 81942198 81942026 Y NA NA NA NA NA NA LPHN2 172008 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr1 82026431 82026771 82026601 Y NA NA NA NA NA NA ST13P20 158607 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 82103600 82103612 82103605 Y NA NA NA NA NA NA ST13P20 81766 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.72464293293265 chr1 83506477 83506486 83506482 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 818220 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 84120524 84120814 84120773 Y PRKACB NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 203892 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 84844335 84844468 84844402 Y SSX2IP,SSX2IP,GNG5,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B NA NA NA NA NA RPF1 98474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 85241214 85241288 85241250 Y SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3 NA SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 86728 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 85349108 85349420 85349289 Y LPAR3 LPAR3 NA NA NA NA LPAR3 7476 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 85737728 85738105 85737917 Y BCL10 C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 2668 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 85791287 85791404 85791348 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 50514 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 86071867 86071976 86071922 Y NA DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61,ZNHIT6 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 27423 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 87190718 87190974 87190846 Y NA SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 22459 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 87617475 87617831 87617556 Y NA NA NA NA NA NA LMO4 174320 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 87624464 87624629 87624532 Y NA NA NA NA NA NA LMO4 167522 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr1 89743448 89743593 89743519 Y GTF2B,CCBL2,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5 NA NA NA NA NA LRRC8B 244802 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 90022562 90022945 90022840 Y ZNF326,LRRC8D,GBP1,GBP2,GBP4,GBP5,LRRC8C,LRRC8B,LRRC8B LRRC8B NA NA NA NA LRRC8B 34167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 91183313 91183764 91183661 Y BARHL2 NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 131443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr1 91361231 91361653 91361295 Y NA RP4-665J23.1 NA NA NA NA RP4-665J23.1 46024 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 91478571 91478975 91478771 Y ZNF644,ZNF644 ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 6854 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 91793812 91793887 91793849 Y NA NA NA NA NA NA HFM1 74539 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 92183243 92183457 92183382 Y NA NA NA NA NA NA RP11-91I11.1 119515 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 92196214 92196626 92196448 Y TGFBR3 NA HSP90B3P IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91I11.1 132486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 92201825 92202076 92201951 Y NA NA NA NA NA NA RP11-91I11.1 138097 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 92216994 92217085 92217040 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 152807 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 92218581 92218971 92218958 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 150921 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 92725087 92725311 92725273 Y RPAP2,GLMN RPAP2,GLMN NA NA NA NA RPAP2 37211 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 93669062 93669462 93669176 Y NA CCDC18,TMED5 NA NA NA NA TMED5 24777 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 94038553 94038921 94038737 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 126865 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 94701813 94701865 94701839 Y ARHGAP29 ARHGAP29 NA NA NA NA ARHGAP29 36759 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 96939460 96939794 96939627 Y NA EEF1A1P11 NA NA NA NA EEF1A1P11 28974 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 96984329 96984523 96984426 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS5P2 63767 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr1 97199537 97199912 97199566 Y NA PTBP2 NA NA NA NA PTBP2 14316 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 97535901 97536287 97536271 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 350680 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 100555117 100555459 100555393 Y NA SASS6 NA NA NA NA SASS6 41052 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 100678369 100678762 100678562 Y NA DBT NA NA NA NA DBT 34628 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 100703358 100703606 100703422 Y NA DBT,RP11-305E17.6 NA NA NA NA DBT 9784 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 100918231 100918546 100918401 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 109647 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 100966297 100966321 100966309 Y NA NA NA NA NA NA CDC14A 157713 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 101485385 101485713 101485528 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3721 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 103475785 103476234 103476049 Y COL11A1 NA NA NA NA NA COL11A1 95818 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 105668101 105668429 105668265 Y NA NA NA NA NA NA RNPC3 1601788 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 107684770 107685020 107684841 Y NA NTNG1 NA NA NA NA NTNG1 4141 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 107793275 107793534 107793405 Y NTNG1,NTNG1 NA NA NA NA NA NTNG1 112646 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 108338013 108338351 108338182 Y VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 167415 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 108741685 108742156 108741931 Y FAM102B SLC25A24 NA NA NA NA SLC25A24 214 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 108870455 108870699 108870577 Y NA NA SLC25A24 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC25A24 128984 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 109156863 109156955 109156909 Y NA HENMT1 NA NA NA NA HENMT1 45193 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 109159407 109159722 109159520 Y NA HENMT1 NA NA NA NA HENMT1 42426 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 109188271 109188477 109188414 Y NA HENMT1,PRPF38B NA NA NA NA HENMT1 13671 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 109469350 109469540 109469522 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 34566 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 109572587 109572654 109572620 Y NA WDR47,TAF13 NA NA NA NA WDR47 10196 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 110142749 110143055 110142903 Y PSRC1,GNAT2 AMPD2 NA NA NA NA AMPD2 13671 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 110336950 110337403 110337105 Y GSTM2,CSF1 NA CSF1,FAM40A,AHCYL1,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 54566 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 110711375 110711549 110711505 Y PROK1,UBL4B SLC6A17,KCNC4 NA NA NA NA SLC6A17 20267 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 111178912 111179243 111179089 Y RBM15,CD53 KCNA2,KCNA3 KCNA2 K562 ChIA-PET 22265404 KCNA2 6816 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 111209000 111209250 111209208 Y NA KCNA2,KCNA3 NA NA NA NA KCNA3 6405 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 111996023 111996307 111996190 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 6025 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 112438367 112438956 112438733 Y NA NA NA NA NA NA FAM212B 141921 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 113683682 113683919 113683753 Y NA RP11-389O22.4 NA NA NA NA RP11-389O22.4 25697 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 114326143 114326379 114326237 Y HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22 PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1 NA NA NA NA PHTF1 26032 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 114576701 114577036 114576869 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 HIPK1 106887 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 117111804 117112156 117112090 Y TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 CD58 NA NA NA NA CD58 143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 117526174 117526525 117526350 Y NA NA NA NA NA NA TTF2 74400 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 118678137 118678411 118678252 Y NA SPAG17 NA NA NA NA SPAG17 47435 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 118792385 118792801 118792430 Y NA NA NA NA NA NA SPAG17 66539 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 119450998 119451282 119451141 Y NA NA NA NA NA NA TBX15 78897 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 119526348 119526895 119526588 Y NA TBX15 NA NA NA NA TBX15 3284 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 120255895 120256325 120256050 Y ADAM30 NA NA NA NA NA PHGDH 55474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 120275491 120275880 120275569 Y ADAM30 NA NA NA NA NA PHGDH 75070 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 120686768 120686908 120686886 Y ZNF697,NOTCH2 NA NA NA NA NA NOTCH2 76528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 144941125 144941602 144941408 Y NA RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 1070 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 144988079 144988414 144988189 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 45407 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 144993199 144993244 144993232 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 50527 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 145009158 145009716 145009503 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 64470 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 145030583 145030978 145030933 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 43208 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 145036432 145036531 145036463 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 37655 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 145054975 145055306 145055182 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDE4DIP 18880 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 145519496 145519624 145519499 Y NBPF10,TXNIP LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B,ANKRD35 NA NA NA NA PEX11B 5244 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 146753566 146753835 146753733 Y NA CHD1L,FMO5 NA NA NA NA FMO5 40866 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 146999335 146999532 146999436 Y NA BCL9 BCL9 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 11650 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 147011538 147012039 147011713 Y NA BCL9 ACP6 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 356 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.72464293293265 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr1 149029458 149029500 149029498 Y NA NA NA NA NA NA PFN1P12 83155 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 149888481 149888615 149888605 Y NA HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB,SV2A,SF3B4 NA NA NA NA SV2A 1047 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 149910900 149911536 149911461 Y NA SV2A,SF3B4 NA NA NA NA SF3B4 12664 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr1 150592182 150592667 150592572 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 7421 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 150800498 150800843 150800671 Y NA ARNT NA NA NA NA ARNT 46401 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 151168297 151168505 151168391 Y BNIPL,TUFT1,SCNM1 SCNM1,LYSMD1,VPS72 NA NA NA NA PIP5K1A 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 151168916 151169086 151168995 Y NA SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 491 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 151284018 151284391 151284246 Y FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5 NA NA NA NA PI4KB 13800 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 151445792 151446161 151446000 Y C1orf56,RIIAD1,OAZ3 POGZ,CGN RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 POGZ 15851 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 151868154 151868386 151868273 Y NA THEM4 NA NA NA NA THEM4 11898 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 151877533 151877895 151877666 Y THEM4 THEM4 NA NA NA NA THEM4 2389 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 152198460 152198859 152198660 Y NA RP11-107M16.2 NA NA NA NA RP11-107M16.2 22126 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 152878475 152878651 152878603 Y NA NA NA NA NA NA SPRR1A 75906 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 152927734 152927742 152927738 Y C1orf68,LCE1B SPRR1A,SPRR3 LCE3E,IVL,SPRR1A,LCE3A,SPRR2F IMR90 Hi-C 24141950 SPRR1A 26815 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 S100A6,S100A2 NA NA NA NA S100A2 2652 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 153845025 153845089 153845058 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 48362 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 154529043 154529152 154529118 Y NA UBE2Q1,CHRNB2 NA NA NA NA UBE2Q1 352 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 154579303 154579782 154579555 Y UBAP2L,IL6R,SHC1,ADAR,ADAR UBE2Q1,CHRNB2,ADAR NA NA NA NA ADAR 18693 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.13914303903836 chr1 155568911 155569221 155569066 Y ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676 IMR90 Hi-C 24141950 ASH1L 38313 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 155830201 155830522 155830413 Y ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2 GON4L,SYT11,RIT1 ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907 IMR90 Hi-C 24141950 SYT11 2901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 156249668 156250061 156249953 Y NA BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85 NA NA NA NA SMG5 559 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 156462474 156462813 156462575 Y NA MEF2D NA NA NA NA MEF2D 5807 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 156468556 156468776 156468632 Y MEF2D NA NA NA NA NA MEF2D 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 156719450 156719815 156719708 Y ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 1048 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 158119500 158119689 158119553 Y NA NA LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 KIRREL 158437 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 159158093 159158524 159158429 Y NA CADM3 NA NA NA NA CADM3 18694 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 159793141 159793292 159793217 Y SLAMF8 DUSP23,C1orf204 NA NA NA NA C1orf204 29845 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 160230168 160230604 160230300 Y NA DCAF8,PEX19 NA NA NA NA DCAF8 22316 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 160639828 160639998 160639908 Y NA NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 222772 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 160712184 160712818 160712467 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 149952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 161324130 161324422 161324290 Y NA SDHC NA NA NA NA SDHC 42083 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 161348767 161349231 161349047 Y NDUFS2 NA NA NA NA NA SDHC 66720 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr1 161469487 161469783 161469607 Y HSPA6,ATF6,FCER1G,FCGR2A NA FCGR2A K562 ChIA-PET 22265404 SDHC 187440 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A NA NA NA NA NA FCRLB 188454 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 161502624 161502920 161502837 Y ADAMTS4,PCP4L1,C1orf192,OLFML2B NA NA NA NA NA FCRLB 186433 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA FCRLB 106847 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr1 161847357 161847565 161847361 Y NA NA NA NA NA NA ATF6 113273 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 163598073 163598159 163598113 Y NA NA NA NA NA NA RGS5 308496 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 164289956 164290255 164290071 Y NA HMGB3P6 NA NA NA NA HMGB3P6 33749 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 165635693 165636148 165635824 Y NA MGST3,ALDH9A1 NA NA NA NA ALDH9A1 29952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr1 167424728 167425462 167425239 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 95542 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 167434195 167434584 167434555 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 86420 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 168050664 168051125 168050872 Y SFT2D2 NA NA NA NA NA GPR161 53696 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 168660111 168660285 168660198 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 411833 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 169229816 169229911 169229864 Y NA NA NA NA NA NA NME7 105294 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 169834996 169835276 169835168 Y NA SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 26132 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 169911234 169911623 169911565 Y NA SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 49826 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 171473011 171473311 171473138 Y NA PRRC2C NA NA NA NA PRRC2C 20360 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 171652961 171653360 171653094 Y NA PFN1P1 NA NA NA NA PFN1P1 14882 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 172106187 172106635 172106273 Y NA MIR214,MIR199A2,DNM3OS NA NA NA NA MIR214 140 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 5.28890499432679 chr1 172142638 172142648 172142642 Y DNM3,FASLG MIR214,MIR199A2,DNM3OS NA NA NA NA DNM3OS 30704 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 172150201 172150456 172150219 Y NA MIR214,MIR199A2,DNM3OS NA NA NA NA DNM3OS 38267 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 172291507 172291926 172291559 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 119304 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 172327070 172327187 172327139 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 84043 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 172352690 172352912 172352801 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 58318 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 172369341 172369683 172369640 Y NA PIGC NA NA NA NA PIGC 41547 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr1 172466564 172466703 172466653 Y NA NA DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIGC 55334 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 172878579 172879356 172878831 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 467349 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 173392092 173392451 173392272 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 51954 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 173909740 173909938 173909924 Y RC3H1,ZBTB37 NA NA NA NA NA GAS5 73720 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 173984193 173984403 173984298 Y GPR52,ZBTB37,RC3H1 RC3H1 NA NA NA NA RC3H1 5032 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 174220636 174220943 174220783 Y RABGAP1L NA NA NA NA NA RABGAP1L 94088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 174937322 174937525 174937409 Y KIAA0040,KIAA0040 CACYBP NA NA NA NA CACYBP 28775 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 174974831 174975127 174974979 Y NA CACYBP,MRPS14 NA NA NA NA CACYBP 8531 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 176079011 176079503 176079162 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 95126 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 178298668 178299096 178298877 Y NA NA NA NA NA NA C1orf220 210791 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 178661693 178662025 178661859 Y NA RALGPS2 NA NA NA NA RALGPS2 30275 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 179555221 179555646 179555325 Y TDRD5,TDRD5,TDRD5 NA NA NA NA NA HNRNPA1P54 130771 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 180200315 180200683 180200497 Y LHX4 LHX4 NA NA NA NA LHX4 2894 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 180200686 180200867 180200752 Y NA LHX4 NA NA NA NA LHX4 3265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 180237101 180237317 180237140 Y NA LHX4 NA NA NA NA LHX4 39680 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 180371123 180371295 180371283 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 98794 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 180389473 180389640 180389557 Y NA NA LHX4,LOC100527964 IMR90 Hi-C 24141950 ACBD6 80449 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 180895607 180895967 180895721 Y NA NA NA NA NA NA STX6 94080 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 181046810 181047186 181046999 Y NA MR1,IER5 NA NA NA NA IER5 8452 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr1 181459512 181459699 181459606 Y NA NA NA NA NA NA CACNA1E 79274 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 182162175 182162397 182162293 Y NA NA NA NA NA NA GLUL 196944 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 182854499 182854851 182854644 Y NA DHX9 NA NA NA NA DHX9 47995 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 183855028 183855346 183855094 Y RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 163465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 184005350 184005919 184005662 Y RGL1,GLT25D2 TSEN15 RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 12892 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 184828541 184828899 184828707 Y IVNS1ABP,FAM129A NA NA NA NA NA EDEM3 106494 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 185297372 185297765 185297602 Y FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 12911 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 185308384 185308771 185308525 Y FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 23923 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 185315613 185315702 185315663 Y RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP SWT1 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 31152 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 185771429 185771809 185771446 Y NA NA NA NA NA NA HMCN1 69746 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 186052629 186052877 186052681 Y HMCN1,PDC NA NA NA NA NA TPR 289948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 186069411 186069628 186069551 Y NA NA NA NA NA NA TPR 273197 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 186090860 186091020 186090873 Y HMCN1 NA NA NA NA NA TPR 251805 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 186627866 186627981 186627924 Y PTGS2,PLA2G4A,C1orf27 NA NA NA NA NA PLA2G4A 168104 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 187647524 187647721 187647623 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 851439 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 192876755 192877567 192877143 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 NA NA NA NA NA RGS2 100586 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 192915458 192915787 192915575 Y NA NA NA NA NA NA TROVE2 110765 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 193726401 193726456 193726429 Y NA NA NA NA NA NA B3GALT2 572617 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 196379497 196379989 196379846 Y CFHR3,KCNT2,CFH NA NA NA NA NA KCNT2 196366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 197964894 197965254 197965077 Y NA NA NA NA NA NA LHX9 85857 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 198840125 198840497 198840438 Y NA NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 513772 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 200076437 200076447 200076441 Y NR5A2 NA NA NA NA NA ZNF281 300737 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 200401856 200401944 200401900 Y NA ZNF281 NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 24672 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 200783735 200784105 200783920 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 77049 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 200831452 200831819 200831500 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 124766 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 201139670 201140154 201139905 Y NA TMEM9 KIF21B,IGFN1,LAD1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 201717986 201718364 201718179 Y NA NA IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 77905 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 202997835 202998093 202998001 Y NA TMEM183A,PPFIA4 NA NA NA NA PPFIA4 4209 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 BTG2 NA NA NA NA BTG2 23709 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE NA NA NA NA NA ATP2B4 102204 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 203789427 203789442 203789436 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 26645 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 204043987 204044379 204044133 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 3744 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 204332438 204332553 204332500 Y SOX13,PPP1R15B PLEKHA6,PPP1R15B NA NA NA NA PLEKHA6 12240 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 204653343 204653636 204653438 Y PLEKHA6,TMEM81,NFASC,NFASC,LRRN2,LRRN2 LRRN2 NA NA NA NA LRRN2 482 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 204675739 204675945 204675909 Y NA LRRN2 LRRN2,NFASC K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRRN2 22878 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 205512470 205512827 205512691 Y NA CDK18,RNU2-19P NA NA NA NA RNU2-19P 21017 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 206752030 206752370 206752201 Y RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 31534 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 206963959 206964120 206964038 Y IL10,FAIM3,FAIM3,IL19 NA EIF2D,MAPKAPK2,IL10,IL20 IMR90 Hi-C 24141950 MAPKAPK2 107670 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA RP11-564A8.4 NA NA NA NA RP11-564A8.4 14535 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 207606927 207607187 207607004 Y NA NA PFKFB2,C4BPA,C4BPB,CR1 IMR90 Hi-C 24141950 CD55 114074 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 207921430 207921703 207921565 Y CR1L CD46 CR1L IMR90 Hi-C 24141950 CD46 1699 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 96417 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 209557331 209557442 209557421 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP5G2P1 117763 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 209562668 209562976 209562782 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP5G2P1 123100 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 209989263 209989693 209989489 Y LOC642587,LAMB3,LAMB3,IRF6 C1orf74,IRF6,DIEXF DIEXF,TRAF3IP3 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DIEXF 9659 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 211423824 211424043 211423934 Y NA RCOR3 NA NA NA NA RCOR3 5676 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 211837893 211837920 211837910 Y NA NEK2,RP11-122M14.1 NA NA NA NA NEK2 9040 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 211988342 211989080 211989063 Y PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1 LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 13034 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 212113260 212113497 212113379 Y NA NA NA NA NA NA INTS7 93387 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 212182782 212182853 212182818 Y NA INTS7,DTL,RPL21P28 NA NA NA NA INTS7 24031 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 212256975 212257253 212257095 Y DTL,INTS7 RPL21P28 NA NA NA NA RPL21P28 33604 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.52947630163455 chr1 212854473 212854873 212854553 Y RPS6KC1,ATF3,ATF3 BATF3 NA NA NA NA BATF3 16454 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 212926000 212926318 212926233 Y NA NSL1,TATDN3 NA NA NA NA NSL1 36806 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 214614073 214614284 214614198 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 109508 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 214619335 214619608 214619472 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 104184 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 214712809 214712848 214712830 Y NA PTPN14 NA NA NA NA PTPN14 10944 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 216823711 216823952 216823948 Y ESRRG NA NA NA NA NA ESRRG 485145 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 219262446 219262621 219262479 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 82565 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 219433064 219433395 219433229 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 87878 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 220189685 220189943 220189814 Y NA EPRS NA NA NA NA EPRS 28057 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 220347108 220347461 220347410 Y NA NA NA NA NA NA MORF4L1P1 77451 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 222439708 222439874 222439791 Y NA NA NA NA NA NA RP11-378J18.3 321293 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 222828361 222828786 222828451 Y TLR5 MIA3 NA NA NA NA MIA3 38933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 222830626 222830783 222830705 Y TAF1A,MIA3 MIA3 NA NA NA NA MIA3 41198 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 7.12852412278828 chr1 224545542 224546006 224545661 Y FBXO28,CNIH4 NVL,CNIH4 NA NA NA NA CNIH4 2990 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 224690718 224691054 224690869 Y WDR26 NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 67983 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 225721902 225722011 225721957 Y NA NA NA NA NA NA LBR 107275 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 226014145 226014403 226014226 Y EPHX1,EPHX1 EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 18351 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 226163769 226163979 226163848 Y NA NA NA NA NA NA PYCR2 53791 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A MIXL1 NA NA NA NA MIXL1 25811 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB NA NA NA NA NA C1orf95 156364 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 227499470 227499818 227499796 Y NA CDC42BPA NA NA NA NA CDC42BPA 4357 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 227730002 227730151 227730029 Y NA ZNF678 WNT9A,ZNF678 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF678 19093 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 227751865 227752213 227752044 Y ZNF678 ZNF678 NA NA NA NA ZNF678 2621 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 228273480 228273740 228273633 Y ARF1,ARF1 ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5119 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 228398942 228399222 228399120 Y TRIM17,GJC2 IBA57,C1orf145 NA NA NA NA C1orf145 143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 228633222 228633907 228633608 Y TRIM11,TRIM17,HIST3H2A TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 9653 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 228634060 228634141 228634103 Y TRIM17,HIST3H2A TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 9419 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 228651177 228651630 228651444 Y HIST3H2A,HIST3H2BB TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 RNF187 IMR90 Hi-C 24141950 HIST3H2BA 850 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 228688608 228688902 228688729 Y HIST3H2A HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA RNF187 15846 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr1 229409656 229409997 229409713 Y RAB4A RP5-1061H20.4,RAB4A NA NA NA NA RAB4A 4834 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 229896669 229897041 229896855 Y NA NA GALNT2,PGBD5 IMR90 Hi-C 24141950 URB2 136688 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 230203814 230204638 230204330 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 12278 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 230212552 230213069 230212856 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 21016 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 230258907 230259286 230258969 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 67371 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr1 230563874 230563977 230563915 Y NA NA NA NA NA NA COG2 212258 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 231083969 231084208 231084171 Y NA TTC13,ARV1 NA NA NA NA TTC13 28413 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 231799080 231799260 231799182 Y EXOC8 DISC1 NA NA NA NA DISC1 38519 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 231944869 231945038 231944953 Y EXOC8 NA NA NA NA NA DISC1 184308 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 232073278 232073500 232073389 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 312717 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 232362022 232362384 232362201 Y NA NA SIPA1L2,TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 DISC1 601461 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 232725638 232725888 232725699 Y SIPA1L2 NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 240045 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.29952391057686 chr1 234548581 234548830 234548706 Y NA RP5-827C21.4 NA NA NA NA RP5-827C21.4 41242 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 234812067 234812214 234812141 Y NA NA LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 68796 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 235267591 235267744 235267678 Y NA SNORA14B,TOMM20 NA NA NA NA SNORA14B 21508 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 235460869 235461278 235461096 Y RBM34,ARID4B,ARID4B GGPS1,ARID4B NA NA NA NA GGPS1 27387 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 235644219 235644255 235644237 Y NA B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 21526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 236323296 236323699 236323519 Y LYST,GPR137B,LGALS8 GPR137B NA NA NA NA GPR137B 19464 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 236453462 236453477 236453470 Y NA ERO1LB ERO1LB,GPR137B,EDARADD MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ERO1LB 10143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 236698906 236699167 236699014 Y EDARADD,MTR LGALS8 NA NA NA NA LGALS8 19606 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 236856658 236857048 236856853 Y ACTN2 ACTN2 NA NA NA NA ACTN2 8904 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 237645107 237645291 237645199 Y RYR2 NA NA NA NA NA RYR2 441602 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 241297873 241298260 241298234 Y NA NA NA NA NA NA RP11-435F13.2 137779 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 241781298 241781471 241781421 Y NA CHML NA NA NA NA CHML 15761 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 242609605 242610011 242609798 Y PLD5,PLD5 NA NA NA NA NA PLD5 75987 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 243447752 243447803 243447788 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 30432 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 243451071 243451374 243451087 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 33751 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 243654647 243654885 243654744 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 237327 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 243894639 243895081 243894755 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 117300 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 243995795 243995860 243995825 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 16521 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS,C1orf101 NA NA NA NA ADSS 384 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 244894306 244894456 244894354 Y C1orf100,C1orf101 NA PPPDE1,C1orf101 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPU-AS1 122343 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr1 245057262 245057513 245057307 Y NA HNRNPU-AS1,HNRNPU EFCAB2,HNRNPU,C1orf101,COX20,SMYD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPU 31418 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 245162358 245162654 245162559 Y NA EFCAB2 NA NA NA NA EFCAB2 31351 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 246038342 246038749 246038555 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 629865 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 246086594 246086610 246086602 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 582004 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 246297322 246297388 246297355 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 371226 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 246432471 246432772 246432681 Y SMYD3,CNST NA NA NA NA NA SMYD3 235842 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 246469940 246470214 246470139 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 198400 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 246588477 246588670 246588563 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 79944 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 246591935 246592203 246592010 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 76411 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 246948292 246948613 246948340 Y NA NA NA NA NA NA SCCPDH 62943 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr1 247038123 247038250 247038187 Y NA NA NA NA NA NA AHCTF1 55030 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 247125260 247125664 247125417 Y NLRP3,NLRP3,AHCTF1 AHCTF1,ZNF695 NA NA NA NA AHCTF1 31980 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 247295865 247296225 247296038 Y ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 30191 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 37125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr1 247507326 247507475 247507401 Y NA ZNF496 ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF496 14178 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 247537279 247537425 247537333 Y NA ZNF496 AHCTF1,ZNF496 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF496 44131 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 500969 501047 501008 Y ZMYND11 NA NA NA NA NA DIP2C 232636 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 516106 516519 516355 Y ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,DIP2C NA NA NA NA NA DIP2C 217164 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 729218 729515 729367 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 4168 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 830510 830663 830589 Y NA NA DIP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 DIP2C 96827 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 1100843 1101035 1100898 Y NA IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 7365 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 2473129 2473236 2473183 Y NA NA NA NA NA NA PFKP 633289 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 4218877 4219029 4218964 Y NA NA KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 65075 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 4386754 4387085 4386858 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 102650 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 4910442 4910783 4910685 Y NA AKR1C1 NA NA NA NA AKR1C1 22013 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 5707430 5707726 5707563 Y NA ASB13,FAM208B NA NA NA NA ASB13 872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 6128477 6128873 6128542 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,IL2RA,RBM17,RBM17 RBM17 RBM17,FBXO18,IL15RA,IL2RA IMR90 Hi-C 24141950 RBM17 77 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 6162113 6162335 6162224 Y NA RBM17,PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 22546 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 6190431 6190630 6190601 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 5550 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 6242613 6242903 6242648 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 57732 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 6341993 6342400 6342249 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,PRKCQ NA NA NA NA NA PFKFB3 157112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 6970148 6970192 6970158 Y SFMBT2,SFMBT2 NA LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCQ 349885 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 7526564 7526721 7526650 Y SFMBT2,SFMBT2,TAF3,KIN NA NA NA NA NA KIN 301269 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 7902237 7902611 7902424 Y NA TAF3 NA NA NA NA TAF3 43770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 8076305 8076718 8076501 Y ITIH5 RP11-379F12.4,GATA3 NA NA NA NA RP11-379F12.4 14786 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 11652835 11653073 11652954 Y CELF2,USP6NL USP6NL NA NA NA NA USP6NL 1082 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 11856360 11856525 11856473 Y NA NA NA NA NA NA ECHDC3 73995 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 11969895 11970071 11969983 Y NA PROSER2-AS1 NA NA NA NA PROSER2-AS1 35196 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 12195131 12195251 12195172 Y CAMK1D SEC61A2,CDC123,NUDT5 NA NA NA NA SEC61A2 25495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 12375218 12375432 12375325 Y CAMK1D CAMK1D CAMK1D,OPTN,CCDC3,CDC123 IMR90 Hi-C 24141950 CAMK1D 14049 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 12503684 12504010 12503723 Y CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 114203 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 13200624 13201003 13200885 Y NA MCM10 NA NA NA NA MCM10 551 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 13388296 13388525 13388411 Y NA PHYH NA NA NA NA SEPHS1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 13391797 13392252 13392084 Y SEPHS1 PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 3500 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 13692317 13692641 13692563 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 65390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 172933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 14931162 14931541 14931180 Y NA SUV39H2 NA NA NA NA SUV39H2 12343 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 15158719 15159034 15158939 Y NA ACBD7,RPP38,NMT2 NA NA NA NA RPP38 21540 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 15165954 15166084 15166019 Y NA ACBD7,RPP38,NMT2 NA NA NA NA RPP38 28775 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 15238092 15238482 15238159 Y NA NMT2 NA NA NA NA NMT2 29400 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 15278281 15278573 15278465 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 69589 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 15306901 15307170 15307036 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 98209 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 17010242 17010673 17010572 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 152715 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 17010683 17011063 17010996 Y VIM NA NA NA NA NA RSU1 153156 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 17034715 17035049 17034848 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 177188 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr10 17037933 17038521 17038161 Y VIM,TRDMT1,ST8SIA6 NA NA NA NA NA RSU1 180406 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 17046094 17046522 17046399 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 188567 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 17067559 17067950 17067759 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 174103 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 17134567 17134821 17134694 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 107232 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 17248953 17248971 17248962 Y TRDMT1,VIM TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3 TRDMT1,CUBN,VIM K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRDMT1 6900 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 17280857 17281170 17281014 Y TRDMT1,VIM TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3 NA NA NA NA RP11-124N14.3 6025 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 17456684 17457055 17456726 Y NA ST8SIA6-AS1,ST8SIA6 NA NA NA NA ST8SIA6-AS1 29749 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 17470783 17471060 17470983 Y TRDMT1,STAM,ST8SIA6 ST8SIA6-AS1,ST8SIA6 NA NA NA NA ST8SIA6 23269 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 17652629 17652974 17652802 Y NA PTPLA,STAM NA NA NA NA PTPLA 4402 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 20249117 20249390 20249254 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 1211726 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 21243289 21243672 21243624 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 217444 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 21389618 21389984 21389801 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 71132 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 21390009 21390197 21390106 Y MLLT10,MLLT10,C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 70919 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-275N1.1 77370 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 21789044 21789221 21789061 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 31873 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 21799318 21799715 21799601 Y C10orf113 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 21379 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 21809167 21809536 21809441 Y C10orf114,C10orf140 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 11558 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr10 21824374 21824606 21824490 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 3280 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 21991974 21992366 21992143 Y NA NA NA NA NA NA MLLT10 170880 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 22201596 22201935 22201928 Y EBLN1 RN7SKP37 NA NA NA NA RN7SKP37 18137 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 22625615 22626028 22625937 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 6371 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 2418 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA SPAG6 92932 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr10 22890368 22890535 22890414 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 110949 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 22970665 22970972 22970902 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 30512 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 24417752 24418035 24417894 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 592562 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 24772710 24773084 24772822 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 237513 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 24925603 24925785 24925693 Y ARHGAP21 NA NA NA NA NA ARHGAP21 84812 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 26191189 26191209 26191199 Y NA NA NA NA NA NA APBB1IP 533923 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 27354652 27354729 27354695 Y NA ANKRD26 NA NA NA NA ANKRD26 32692 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr10 27814920 27815352 27814981 Y MASTL,ACBD5,RAB18 RAB18 NA NA NA NA RAB18 23723 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 28891962 28892254 28892152 Y NA NA NA NA NA NA BAMBI 72017 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 28957755 28957993 28957831 Y BAMBI BAMBI BAMBI K562 ChIA-PET 22265404 BAMBI 6278 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr10 29195098 29195451 29195275 Y NA NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 230827 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 29420684 29421072 29420878 Y NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC IMR90 Hi-C 24141950 PTCHD3P1 275259 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 29421778 29421876 29421872 Y NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC IMR90 Hi-C 24141950 PTCHD3P1 274455 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr10 29887787 29888175 29887987 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 191456 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 29922205 29922549 29922392 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 225874 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 31192523 31192722 31192556 Y NA NA NA NA NA NA ZNF438 126144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 31293680 31294164 31294019 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 24702 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr10 31875754 31875909 31875804 Y NA NA ZNF438,ARHGAP12,ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 268378 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr10 32215994 32216410 32215998 Y NA ARHGAP12 NA NA NA NA ARHGAP12 252 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 32316515 32316560 32316538 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 26799 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 34039422 34039739 34039581 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 416232 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 34700087 34700433 34700328 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 250596 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 34907489 34907514 34907502 Y NA RP11-8L18.3 NA NA NA NA RP11-8L18.3 43515 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 34924725 34924738 34924731 Y NA RP11-8L18.3 NA NA NA NA RP11-8L18.3 26291 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 35059349 35059608 35059479 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 42645 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 35070002 35070125 35070067 Y CREM PARD3 NA NA NA NA PARD3 32128 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 35098240 35098611 35098558 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 3642 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 35431185 35431238 35431212 Y NA CREM NA NA NA NA CREM 17466 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 35932153 35932694 35932189 Y FZD8 MIR4683,FZD8 NA NA NA NA FZD8 3791 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 38264185 38264489 38264470 Y ZNF37A,ZNF248,ZNF25 ZNF25,ZNF33A NA NA NA NA ZNF25 624 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr10 38418230 38418599 38418292 Y NA ZNF37A NA NA NA NA ZNF37A 36966 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 42800348 42800675 42800512 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 165013 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 43248764 43248842 43248800 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 27407 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 43600895 43601120 43601049 Y RASGEF1A RET,CSGALNACT2 NA NA NA NA RET 30420 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr10 43817898 43817965 43817923 Y NA NA ZNF487P IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPF 84649 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 43818292 43818511 43818402 Y NA NA ZNF487P IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPF 84103 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 44185196 44185271 44185205 Y NA ZNF32 NA NA NA NA ZNF32 42892 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 44185624 44185942 44185694 Y NA ZNF32 NA NA NA NA ZNF32 43320 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 45374285 45374680 45374305 Y NA NA NA NA NA NA RASSF4 78175 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA RASSF4 17621 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 45491341 45491670 45491510 Y C10orf10 RASSF4,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA ZNF22 2253 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 45914844 45915133 45915015 Y NA NA NA NA NA NA MARCH8 173221 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 47008240 47008359 47008300 Y GPRIN2 NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 58768 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 47031609 47031850 47031726 Y NA NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 82137 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 48591812 48592143 48591972 Y ZNF488 NA SYT15 IMR90 Hi-C 24141950 GDF10 154836 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 49542005 49542407 49542075 Y NA MAPK8 ARHGAP22,MAPK8 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 29307 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 49598208 49598504 49598305 Y NA NA MAPK8,ARHGAP22 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 85510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 49745028 49745223 49745126 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP22 117087 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 50243711 50244078 50243895 Y NA NA NA NA NA NA VSTM4 77476 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 52081951 52082279 52082036 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 59213 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 52083052 52083210 52083101 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 60314 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 52085013 52085461 52085351 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 62275 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 52217733 52218081 52217894 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 164842 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 52261858 52262194 52262143 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 120729 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 54422889 54423026 54422939 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 350833 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 54774491 54774616 54774570 Y MBL2 NA NA NA NA NA DKK1 702435 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 60674120 60674133 60674127 Y BICC1 NA NA NA NA NA PHYHIPL 260217 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 61580750 61581126 61580938 Y NA NA NA NA NA NA CCDC6 83288 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 61632760 61633170 61633000 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 31244 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 61645173 61645419 61645305 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 18995 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 61665210 61665415 61665365 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 796 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 63176238 63176614 63176426 Y TMEM26 TMEM26 NA NA NA NA TMEM26 34594 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 63702592 63703184 63702855 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 43533 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 63703432 63703559 63703511 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 44373 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 63752119 63752912 63752632 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 93060 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 63803306 63803648 63803427 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 144247 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 63823957 63824187 63824054 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 164898 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 64445329 64445644 64445487 Y ADO NA NA NA NA NA ADO 116872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 64982889 64983009 64982950 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 91839 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 65026237 65026642 65026597 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 135187 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 65097775 65098183 65098051 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 86874 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 65125268 65125651 65125502 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 59406 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 65282188 65282459 65282345 Y JMJD1C,JMJD1C REEP3 NA NA NA NA REEP3 3065 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 65388414 65388608 65388512 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 109291 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr10 66069131 66069337 66069175 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 408126 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 66294853 66295258 66294869 Y NA NA NA NA NA NA ANXA2P3 288071 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 68137896 68138170 68138033 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM3 545594 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 68755189 68755293 68755241 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA LRRTM3 71425 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 68768720 68769021 68768921 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA LRRTM3 84956 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 68802112 68802301 68802189 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA LRRTM3 118348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 68843787 68844099 68844033 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM3 160023 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 69523317 69523417 69523404 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA3 69390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr10 69822197 69822546 69822385 Y NA HERC4 NA NA NA NA HERC4 10559 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 70811970 70812239 70812007 Y DDX21,VPS26A,SRGN NA KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 65483 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 71662112 71662205 71662157 Y H2AFY2 NA NA NA NA NA H2AFY2 148347 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 71840822 71841222 71841056 Y NA H2AFY2,AIFM2 NA NA NA NA H2AFY2 30270 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr10 72165059 72165574 72165379 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA EIF4EBP2 2924 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B NA NA NA NA UNC5B 3461 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 73489038 73489396 73489204 Y PSAP,C10orf54 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 41859 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 73530522 73531091 73530726 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 164 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 73568339 73568950 73568859 Y NA C10orf54,PSAP NA NA NA NA C10orf54 37084 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 73605642 73606023 73605974 Y DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP NA NA NA NA PSAP 3103 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 73725868 73726411 73726297 Y C10orf105,CHST3 CHST3 NA NA NA NA CHST3 3745 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 73744363 73744592 73744410 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 22240 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 73946489 73946835 73946688 Y NA ANAPC16,ASCC1 NA NA NA NA ANAPC16 26952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 74289425 74289733 74289722 Y NA NA NA NA NA NA MICU1 94166 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 74836640 74837022 74836864 Y NA P4HA1,NUDT13 NA NA NA NA P4HA1 17710 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 75408900 75409185 75408963 Y CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54 AGAP5 NA NA NA NA AGAP5 46454 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 75805462 75805520 75805491 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 49590 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 75931649 75931916 75931783 Y NA AP3M1,ADK NA NA NA NA ADK 22689 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 76682814 76683108 76682864 Y NA NA NA NA NA NA KAT6B 99474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 76866248 76866511 76866390 Y NA SAMD8 NA NA NA NA SAMD8 8904 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 76985148 76985510 76985329 Y NA VDAC2,COMTD1 NA NA NA NA COMTD1 8278 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 77164585 77164731 77164659 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4921 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr10 77189888 77190112 77189953 Y NA ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 30224 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 77300831 77301201 77300915 Y NA NA KCNMA1,C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 57797 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 77548245 77548262 77548254 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 189247 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 79147874 79148082 79147903 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 248271 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 79166166 79166289 79166224 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 230064 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 79526031 79526385 79526077 Y NA NA KCNMA1,POLR3A,DLG5 IMR90 Hi-C 24141950 KCNMA1 129678 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 79538272 79538371 79538344 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 141919 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 79545596 79545879 79545660 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 138499 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 79670022 79670276 79670149 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 14102 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr10 80166856 80166996 80166943 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 375338 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 80772530 80772579 80772555 Y PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 54213 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 81946319 81946704 81946639 Y ANXA11 ANXA11 NA NA NA NA ANXA11 16624 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 81960969 81961796 81961521 Y SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 1532 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 81962798 81963579 81963388 Y SH2D4B,ANXA11 EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 82056403 82056420 82056412 Y SH2D4B DYDC2 NA NA NA NA DYDC2 46081 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 82253401 82253904 82253623 Y NA TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 41479 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 82260440 82261008 82260524 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 48518 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 85937530 85937952 85937586 Y NA GHITM,C10orf99,CDHR1 NA NA NA NA C10orf99 6036 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 88004394 88004782 88004588 Y NA NA NA NA NA NA GRID1 119468 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA GRID1 WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 GRID1 35761 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.52947630163455 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 88571811 88572082 88571947 Y NA NA NA NA NA NA BMPR1A 57404 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 89508472 89508835 89508628 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 66850 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 89836681 89836877 89836779 Y NA NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 133422 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 91020368 91020477 91020401 Y IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2 NA NA NA NA NA CH25H 55297 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 92676361 92676755 92676735 Y NA RPP30 NA NA NA NA RPP30 46888 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 92923893 92924265 92924064 Y NA NA RPP30,NUDT9P1,PCGF5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 53643 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 93254153 93254526 93254340 Y NA NA NA NA NA NA HECTD2 86057 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 19936 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.83961912846149 chr10 94353992 94354203 94354151 Y MARCH5 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 2949 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 94608884 94609046 94608952 Y NA EXOC6 NA NA NA NA EXOC6 19949 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 95128871 95128891 95128880 Y CYP26C1 NA NA NA NA NA RP11-624L12.1 86556 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 96282867 96283106 96282931 Y TBC1D12 HELLS NA NA NA NA HELLS 20441 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 RP11-310E22.4 C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-310E22.4 45240 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr10 97120063 97120328 97120194 Y SORBS1 NA NA NA NA NA PDLIM1 71282 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 97809134 97809259 97809196 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 7983 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 98464941 98465141 98465037 Y LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1 RPL13AP5 NA NA NA NA RPL13AP5 42904 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 98956083 98956405 98956104 Y C10orf62 SLIT1 NA NA NA NA SLIT1 12406 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 99401742 99402052 99401841 Y C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 10398 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 101170653 101170798 101170732 Y SLC25A28 GOT1,RP11-441O15.3 NA NA NA NA GOT1 17583 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 101677861 101678026 101677917 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 89650 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 101736797 101737134 101736959 Y BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP DNMBP NA NA NA NA DNMBP 30542 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 102284995 102285353 102285150 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1476 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 102488726 102488983 102488821 Y NA NA PAX2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM178A 181343 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 103708018 103708327 103708173 Y NA NA NA NA NA NA C10orf76 105623 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 103733720 103734121 103734043 Y NA NA LOC100289509,MGEA5,KCNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf76 79829 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.02416684350951 chr10 104406463 104406725 104406695 Y NFKB2,NFKB2,TRIM8 TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 4210 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 104504643 104504897 104504711 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 32348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 104545681 104545915 104545784 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32 NA NA NA NA NA C10orf32 66065 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 104903006 104903392 104903228 Y C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 47664 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 108695824 108695948 108695886 Y NA NA NA NA NA NA YWHAZP5 1251744 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 112010766 112010816 112010791 Y NA MXI1 SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 MXI1 45403 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 112261043 112261328 112261185 Y SHOC2,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 5447 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 112674359 112675211 112674854 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 1821 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 114385835 114385842 114385839 Y GPAM,TECTB NA NA NA NA NA VTI1A 181079 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 114823270 114823456 114823363 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 115261 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 114853789 114854299 114853993 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 145780 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 114859283 114859636 114859547 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 151274 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 115923622 115923898 115923760 Y C10orf81 MIR2110,C10orf118 NA NA NA NA MIR2110 8040 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA ABLIM1 187173 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 116300910 116301495 116301299 Y FAM160B1,C10orf118,ABLIM1 NA NA NA NA NA ABLIM1 141267 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 118034123 118034494 118034359 Y GFRA1,GFRA1,GFRA1 GFRA1 NA NA NA NA GFRA1 3144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 118656077 118656284 118656258 Y NA ENO4,RP11-539I5.1 NA NA NA NA RP11-539I5.1 48361 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 118743836 118743980 118743960 Y PNLIP,PNLIPRP1,PNLIPRP2,HSPA12A,KCNK18,VAX1,KIAA1598 NA NA NA NA NA RP11-539I5.1 136120 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 86195 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 119256221 119256343 119256282 Y KIAA1598,KCNK18,EMX2 EMX2OS NA NA NA NA EMX2OS 46236 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 119294820 119294982 119294904 Y EMX2 EMX2OS NA NA NA NA EMX2OS 7597 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 119300827 119301053 119300919 Y VAX1,EMX2 EMX2OS NA NA NA NA EMX2OS 1526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 120482173 120482528 120482344 Y NA NA NA NA NA NA NANOS1 304700 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 120692616 120692979 120692798 Y NA NA NA NA NA NA NANOS1 94249 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 120968752 120969030 120968753 Y EIF3A,GRK5 SFXN4,PRDX3 NA NA NA NA PRDX3 32407 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 123900074 123900243 123900143 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 153385 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 124613518 124613778 124613722 Y NA FAM24B,RP11-564D11.3 NA NA NA NA FAM24B 23379 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 125730230 125730378 125730329 Y NA NA NA NA NA NA CHST15 120828 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 126251501 126251899 126251725 Y METTL10 NA NA NA NA NA RPS10P18 74354 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 126329893 126330183 126330084 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 100655 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 126337254 126337585 126337480 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 93253 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 126429723 126430192 126430042 Y FAM53B FAM53B,METTL10 NA NA NA NA FAM53B 646 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 126768245 126768621 126768433 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 79118 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 127535706 127535819 127535763 Y MMP21 UROS,BCCIP,DHX32,FANK1 NA NA NA NA BCCIP 25591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 127574091 127574564 127574346 Y NA DHX32,FANK1 NA NA NA NA DHX32 8441 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 127576052 127576450 127576389 Y NA DHX32,FANK1 NA NA NA NA DHX32 6555 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 127583558 127583978 127583747 Y MMP21 DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 450 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 128595349 128595449 128595411 Y DOCK1 DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 3371 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 128995351 128995518 128995467 Y NA FAM196A NA NA NA NA FAM196A 2929 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 129675535 129675645 129675590 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 247004 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 129799058 129799270 129799164 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 123379 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 129851192 129851341 129851267 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 71308 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 129893841 129894010 129893942 Y NA MKI67 NA NA NA NA MKI67 28639 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 130017279 130017540 130017352 Y PTPRE NA EBF3,MGMT,LOC387723,GLRX3,CTAGE7P IMR90 Hi-C 24141950 MKI67 94630 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 131688064 131688242 131688188 Y EBF3 NA NA NA NA NA EBF3 71863 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 132099901 132100191 132100002 Y NA NA NA NA NA NA GLRX3 167238 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 133763722 133764008 133763747 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 29427 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 133776164 133776302 133776237 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 17133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 133793049 133793425 133793362 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 10 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr10 134266616 134267060 134266753 Y LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92 NA NA NA NA NA PWWP2B 57944 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr10 135119353 135119734 135119518 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2,CALY NA NA NA NA ZNF511 245 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 135329777 135330170 135329974 Y NA NA LOC619207,SYCE1 IMR90 Hi-C 24141950 SYCE1 50706 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr10 135342737 135342867 135342819 Y KNDC1,PRAP1,C10orf125,ECHS1,CYP2E1 SYCE1 NA NA NA NA SYCE1 38009 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr11 341474 341670 341587 Y NA IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 RIC8A,SIRT3,BET1L,IFITM3,IFITM1,IFITM5,PSMD13,IFITM2,NLRP6,ATHL1,PTDSS2,SIGIRR,ANO9,B4GALNT4,PKP3,RNH1 IMR90 Hi-C 24141950 IFITM3 15937 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 368352 368730 368427 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR NA NA NA NA B4GALNT4 556 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 926738 926879 926801 Y BRSK2,CEND1,AP2A2 CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 3844 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 1241085 1241212 1241149 Y NA NA NA NA NA NA TOLLIP 87672 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 1404403 1404794 1404637 Y DUSP8,BRSK2 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 1412454 1412793 1412702 Y NA BRSK2 NA NA NA NA BRSK2 3325 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 1803283 1803679 1803344 Y TOLLIP,TNNI2,LSP1 RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39 MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2,IGF2-AS1,INS-IGF2,KRTAP5-4,SYT8 IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 RPL36AP39 8104 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 2082720 2083054 2082737 Y NA NA MOB2,IGF2-AS1,IGF2,INS-IGF2,LSP1,TH,MIR4686 IMR90,K562,GM12878,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 H19 62020 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 2598295 2598461 2598377 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 120763 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 2643075 2643474 2643317 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 75750 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 3443739 3443990 3443855 Y NA ZNF195 NA NA NA NA ZNF195 45291 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 5953770 5953923 5953776 Y NA TRIM5 NA NA NA NA TRIM5 3926 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 6699628 6699937 6699850 Y OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2 DCHS1,MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 2695 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 7915712 7915896 7915804 Y OR10A3,OR10A6 NA NA NA NA NA EIF3F 73902 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 8756335 8756571 8756455 Y ST5,ASCL3 NA NA NA NA NA RPL27A 54377 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 9185386 9185638 9185566 Y NA NA NA NA NA NA DENND5A 99299 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 9250767 9251109 9250945 Y NA DENND5A NA NA NA NA DENND5A 33828 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7,SNORA23 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 9770028 9770265 9770206 Y WEE1,SWAP70 NA NA NA NA NA SWAP70 86404 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 9781782 9782109 9781859 Y NA NA NA NA NA NA SWAP70 98158 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 9786985 9787566 9787311 Y NA NA NA NA NA NA SWAP70 103361 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 10246954 10247167 10247061 Y NA NA NA NA NA NA SBF2 66587 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 10634601 10634999 10634904 Y MRVI1,MRVI1,MRVI1 NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 73782 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 11899555 11899888 11899585 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 38585 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 12824175 12824668 12824395 Y TEAD1 NA NA NA NA NA TEAD1 130206 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 13468446 13468721 13468666 Y NA BTBD10 NA NA NA NA BTBD10 14123 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 17099866 17100401 17100030 Y NA SNORD14A,RPS13 NA NA NA NA RPS13 2532 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 17164162 17164523 17164517 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C2A 63007 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA,LDHC,LDHAL6A NA NA NA NA LDHC 5256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 18546072 18546398 18546234 Y SPTY2D1,TSG101 RP11-613F22.5,TSG101 NA NA NA NA TSG101 381 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 27350498 27350718 27350608 Y BDNF CCDC34 NA NA NA NA CCDC34 32697 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 27682701 27682852 27682777 Y NA NA NA NA NA NA RP11-587D21.1 81474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 28776161 28776492 28776325 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 648306 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 30494476 30494761 30494619 Y NA NA NA NA NA NA MPPED2 111658 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 30510063 30510254 30510126 Y FSHB,MPPED2,MPPED2 NA NA NA NA NA MPPED2 96165 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 30629233 30629255 30629244 Y NA MPPED2 NA NA NA NA MPPED2 22814 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 30911120 30911365 30911243 Y NA NA NA NA NA NA MPPED2 304701 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 31165521 31165554 31165538 Y IMMP1L,ELP4,DNAJC24 NA NA NA NA NA DCDC1 223803 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr11 31317361 31317619 31317485 Y NA NA NA NA NA NA DCDC1 71738 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr11 31450770 31450827 31450799 Y PAX6,PAX6,IMMP1L,ELP4,DNAJC24 NA NA NA NA NA DNAJC24 61383 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 31489332 31489346 31489341 Y NA IMMP1L,ELP4 NA NA NA NA IMMP1L 39846 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 31693471 31693827 31693649 Y NA NA NA NA NA NA RCN1 138112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 31819497 31819881 31819763 Y NA RCN1,PAX6 NA NA NA NA RCN1 12058 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr11 31835564 31835985 31835634 Y NA RCN1,PAX6 NA NA NA NA PAX6 1524 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr11 32093292 32093302 32093297 Y PAX6 NA RCN1,ELP4,IMMP1L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PAX6 255783 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 33096691 33097088 33096864 Y NA TCP11L1 NA NA NA NA TCP11L1 37728 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 33181656 33182005 33181958 Y NA NA NA NA NA NA CSTF3 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 33313001 33313236 33313097 Y NA HIPK3 NA NA NA NA HIPK3 36783 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr11 33468371 33468737 33468467 Y NA NA C11orf41,LOC338739 IMR90 Hi-C 24141950 HIPK3 192153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 34084271 34084310 34084291 Y NA CAPRIN1,NAT10 NA NA NA NA CAPRIN1 13041 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 35029453 35029465 35029458 Y NA NA NA NA NA NA APIP 93407 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 35053022 35053283 35053109 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 104296 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 35073607 35073921 35073887 Y NA NA NA NA NA NA RP4-607I7.1 83658 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 35186946 35187176 35187019 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 28529 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 35204984 35205337 35205050 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 46567 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 35309902 35310085 35310021 Y CD44 NA NA NA NA NA SLC1A2 129525 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 36173587 36173879 36173626 Y NA NA NA NA NA NA COMMD9 135120 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 36331203 36331536 36331365 Y PRR5L COMMD9 NA NA NA NA COMMD9 22204 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 36406780 36407137 36406963 Y TRAF6,PRR5L NA NA NA NA NA COMMD9 97781 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 36660531 36660819 36660677 Y NA C11orf74 NA NA NA NA C11orf74 46480 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 37350813 37350846 37350830 Y NA NA NA NA NA NA C11orf74 736762 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 40223760 40223865 40223814 Y LRRC4C NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 1334119 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 40252450 40252490 40252470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 1305494 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 41419040 41419236 41419231 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 138748 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 43360196 43360553 43360375 Y TTC17 API5,TTC17 NA NA NA NA TTC17 17929 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 43596990 43597530 43597260 Y NA HSD17B12 NA NA NA NA HSD17B12 21004 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 44032395 44032638 44032519 Y C11orf96 NA ALKBH3,LOC100507300 IMR90 Hi-C 24141950 ACCS 52837 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 44239965 44240168 44240067 Y NA NA NA NA NA NA ALX4 89548 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 103265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.18454771504802 chr11 46058881 46059222 46059206 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 81763 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 46094625 46094954 46094790 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 46031 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr11 47208524 47208884 47208580 Y PACSIN3,PACSIN3,NR1H3 ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 NA NA NA NA PACSIN3 2530 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 47252770 47253009 47252890 Y NA PACSIN3,DDB2,ACP2,MADD NA NA NA NA ACP2 15448 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 47867685 47867881 47867783 Y OR4X1 NUP160 NA NA NA NA NUP160 226 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 48004294 48004631 48004323 Y CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 4181 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 48102794 48103200 48102989 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 102681 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 56970712 56970886 56970799 Y UBE2L6 NA NA NA NA NA TNKS1BP1 119540 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 56991738 56991923 56991831 Y UBE2L6,P2RX3,LRRC55,APLNR NA NA NA NA NA TNKS1BP1 98503 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 57406709 57407290 57406997 Y OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6 SERPING1,AP000662.4,CLP1,YPEL4,ZDHHC5 NA NA NA NA AP000662.4 3212 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 58292918 58293075 58292951 Y LPXN NA NA NA NA NA ZFP91 51509 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 58544837 58545130 58544994 Y MPEG1,OR5B21,LPXN,LPXN NA NA NA NA NA ZFP91-CNTF 200192 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 59331910 59331948 59331929 Y OR5AN1,OR4D6,OR4D11 OSBP NA NA NA NA OSBP 49669 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 59537612 59537828 59537719 Y PATL1,STX3 MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 38517 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 61074897 61075402 61075197 Y CD6 DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 23280 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 61319246 61319400 61319342 Y NA LRRC10B,SYT7 NA NA NA NA SYT7 27220 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 61602064 61602538 61602257 Y INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 7274 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 61780516 61780626 61780618 Y NA FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47384 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 61880097 61880151 61880125 Y FADS2,FADS3,RAB3IL1 INCENP FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INCENP 9294 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 62225896 62226091 62226018 Y FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1 NA NA NA NA NA SCGB1A1 55321 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 62272728 62273223 62272788 Y ROM1 RP11-864I4.4,AHNAK NA NA NA NA RP11-864I4.4 38248 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 62310227 62311393 62310863 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 78 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr11 63795964 63796221 63796065 Y NA OTUB1,RP11-21A7A.2 NA NA NA NA RP11-21A7A.2 5221 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr11 64363562 64364093 64364079 Y NA NA NA NA NA NA NRXN2 124567 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 65121352 65121551 65121543 Y NA CDC42EP2,DPF2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8 NA NA NA NA TIGD3 1114 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr11 65246279 65246484 65246387 Y SCYL1,LTBP3,EFEMP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 16749 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 65261988 65262329 65262152 Y FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 904 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 9.65800042442283 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2C 50795 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 65849089 65849462 65849117 Y KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1 GAL3ST3,SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 13255 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 65903912 65904457 65904250 Y NA NA NA NA NA NA PACS1 68078 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 65949541 65949768 65949655 Y NA NA NA NA NA NA KLC2 72997 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 66494345 66494720 66494567 Y NA C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 15202 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 66511038 66511198 66511076 Y KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2 C11orf80 NA NA NA NA C11orf80 1116 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 66738286 66738892 66738415 Y POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1 PC,SYT12 PC,SYT12,RHOD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PC 14439 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 67105994 67106296 67106145 Y NA SSH3,POLD4,AP003419.11 NA NA NA NA POLD4 16147 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 67138852 67139479 67139267 Y NA POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 67270751 67271055 67270865 Y NA TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2 NA NA NA NA PITPNM1 679 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8,TCIRG1 NA NA NA NA TCIRG1 22551 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 67895703 67896078 67896017 Y CHKA CHKA CHKA,SUV420H1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHKA 8792 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr11 67955066 67955423 67955397 Y TCIRG1,SUV420H1 SUV420H1 NA NA NA NA SUV420H1 23872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr11 68273880 68274272 68274031 Y NA PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 47694 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr11 68387136 68387210 68387173 Y NA NA NA NA NA NA GAL 62037 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 68583527 68583541 68583534 Y MTL5 CPT1A NA NA NA NA CPT1A 26337 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 68596704 68596832 68596771 Y CPT1A CPT1A NA NA NA NA CPT1A 13046 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 68608164 68608616 68608368 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1262 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 68611298 68611611 68611498 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1420 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 68623126 68623609 68623402 Y MTL5,CPT1A CPT1A,MRPL21,IGHMBP2 CPT1A,PPP6R3,MTL5,TPCN2,MRPL21,IGHMBP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPT1A 13248 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 68808319 68808729 68808592 Y IGHMBP2,TPCN2 TPCN2 MTL5,CPT1A,IGHMBP2,MRPL21,MRGPRD,MRGPRF,TPCN2,CCND1,ORAOV1 IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 5636 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 68823741 68823941 68823814 Y IGHMBP2,TPCN2 TPCN2 NA NA NA NA TPCN2 9376 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 68832799 68833131 68832982 Y IGHMBP2,MRGPRD,TPCN2 TPCN2 NA NA NA NA TPCN2 18434 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 68847694 68848091 68847776 Y IGHMBP2,TPCN2 TPCN2 NA NA NA NA TPCN2 33329 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 68908210 68908442 68908360 Y TPCN2 NA FGF4,ORAOV1,TPCN2,CCND1,MYEOV IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPCN2 93845 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 68921150 68921435 68921292 Y NA NA ORAOV1,CCND1,FGF19 IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 106785 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 69078627 69079142 69078814 Y TPCN2 NA NA NA NA NA TPCN2 264262 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 195423 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.41450010610571 chr11 69452524 69453230 69453220 Y CCND1 CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.18454771504802 chr11 69809602 69809958 69809614 Y NA NA ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4 IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 112450 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 70150439 70150493 70150466 Y NA PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 35633 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 70155804 70155966 70155885 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 40998 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 70159213 70159451 70159301 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 44407 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr11 70162610 70162835 70162663 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 47804 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 72431268 72431435 72431330 Y FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 71209 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 72662392 72662530 72662447 Y ARAP1,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT NA ATG16L2 IMR90 Hi-C 24141950 ATG16L2 139039 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 72686902 72687109 72687004 Y RELT,RELT NA NA NA NA NA ATG16L2 163549 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 72854261 72854849 72854638 Y PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2 FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 2955 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 73221521 73221768 73221630 Y PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A NA NA NA NA NA FAM168A 85466 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 74565092 74565468 74565281 Y NA NA NA NA NA NA XRRA1 92777 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 74609863 74609988 74609926 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48257 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 75061558 75062072 75061823 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 685 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 75755875 75756235 75755993 Y UVRAG NA NA NA NA NA WNT11 163545 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 75883349 75883640 75883491 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 36140 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 75946013 75946323 75946187 Y NA WNT11 C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT11 26233 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 76936185 76936353 76936269 Y NA NA NA NA NA NA CAPN5 160206 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 77837663 77837947 77837805 Y NA NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1 NA NA NA NA ALG8 10759 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 79148505 79148822 79148543 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 864586 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 83456088 83456459 83456328 Y DLG2 NA NA NA NA NA CCDC90B 460638 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 85484523 85484565 85484546 Y NA SYTL2 NA NA NA NA SYTL2 35619 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 85702937 85703343 85703240 Y NA NA NA NA NA NA PICALM 75581 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 86631607 86631965 86631913 Y ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4 FZD4,RP11-736K20.6 ME3 IMR90 Hi-C 24141950 FZD4 32468 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 88269213 88269357 88269284 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 200258 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 90016507 90016673 90016590 Y NA RP11-121L10.3 NA NA NA NA RP11-121L10.3 2779 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 90570855 90570933 90570894 Y NA NA NA NA NA NA RP11-121L10.3 557127 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 91957038 91957557 91957289 Y NA NA FAT3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 971573 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 95422082 95422381 95422197 Y FAM76B NA ENDOD1,SESN3 IMR90 Hi-C 24141950 CEP57 98748 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 95525355 95525734 95525518 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 3782 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 102283995 102284326 102284226 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 NA BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 54789 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 102317826 102318238 102318123 Y BIRC3,BIRC2,TMEM123 TMEM123 NA NA NA NA TMEM123 20877 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 102631066 102631384 102631342 Y BIRC2 MMP10,MMP1 NA NA NA NA MMP10 17975 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 102956908 102957200 102957055 Y NA DCUN1D5,DYNC2H1 NA NA NA NA DCUN1D5 3744 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 104128696 104129051 104128955 Y NA NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37O16.8 850311 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 105090888 105091203 105091058 Y CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17 NA NA NA NA NA GRIA4 387518 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr11 105513261 105513284 105513272 Y GRIA4,GRIA4,KIAA1826 GRIA4 NA NA NA NA GRIA4 34540 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 105674568 105674985 105674652 Y KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826 RNU4-55P NA NA NA NA RNU4-55P 18375 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 105949400 105949669 105949535 Y NA AASDHPPT,KBTBD3 NA NA NA NA KBTBD3 2908 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 110326620 110326859 110326678 Y NA FDX1 NA NA NA NA FDX1 28013 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 111195850 111196227 111196025 Y NA NA NA NA NA NA C11orf88 187283 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 111692318 111692670 111692505 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 C11orf1 54989 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 111824557 111824693 111824689 Y NA CRYAB NA NA NA NA CRYAB 32111 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 112016607 112016779 112016693 Y DIXDC1 NA NA NA NA NA SDHD 60980 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 112566717 112567065 112566891 Y NA NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 NCAM1 262932 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 113219738 113219923 113219793 Y NA RP11-839D17.3,TTC12 NA NA NA NA TTC12 36487 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 17089 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr11 114037766 114038216 114037805 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB16 109451 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 116790672 116791048 116790863 Y NA NA APOA4,APOA1,APOC3 IMR90 Hi-C 24141950 AP000936.1 113719 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 116802235 116802679 116802498 Y SIK3,PCSK7 NA NA NA NA NA AP000936.1 102088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 117873419 117873908 117873683 Y NA IL10RA NA NA NA NA IL10RA 18356 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 118783640 118784096 118783954 Y NA MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 4223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA NA TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 142361 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr11 119854784 119854831 119854808 Y NA NA NA NA NA NA TRIM29 199406 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 120218040 120218378 120218085 Y NA TMEM136,ARHGEF12 NA NA NA NA ARHGEF12 12253 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 120895811 120895984 120895886 Y GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA TBCEL NA NA NA NA TBCEL 3030 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 121330249 121330515 121330350 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 9337 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 122586167 122586342 122586202 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 61784 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr11 123293400 123293723 123293427 Y NA AP000783.1 CLMP IMR90 Hi-C 24141950 AP000783.1 5335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 123327975 123328380 123328056 Y NA AP000783.1 CLMP,HSPA8 IMR90 Hi-C 24141950 AP000783.1 28917 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 124458771 124459153 124459140 Y OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1 TBRG1 NA NA NA NA TBRG1 31579 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr11 126001132 126001515 126001324 Y CDON NA CDON IMR90 Hi-C 24141950 CDON 69902 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr11 126286483 126286630 126286572 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 62948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 128194286 128195037 128194757 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 260416 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 128323342 128323695 128323510 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 131758 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 129509159 129509661 129509390 Y BARX2 NA BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 NFRKB 253824 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 129993921 129994394 129994167 Y PRDM10,APLP2 NA NA NA NA NA APLP2 56189 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 131356967 131357237 131357102 Y NA NA NA NA NA NA SNX19 572563 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 132604106 132604440 132604278 Y NA NA NA NA NA NA IGSF9B 1220440 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr11 133920876 133920983 133920947 Y B3GAT1,SPATA19,JAM3 RP11-713P17.3,JAM3 NA NA NA NA JAM3 15837 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr12 298364 298488 298415 Y IQSEC3 NA NA NA NA NA CCDC77 197951 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 905489 905920 905534 Y NA WNK1 NA NA NA NA WNK1 45730 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 1261364 1261638 1261529 Y NA NA NA NA NA NA ERC1 163689 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 1314182 1314497 1314340 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 ERC1 216507 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 2144277 2144357 2144308 Y LRTM2 DCP1B CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B IMR90 Hi-C 24141950 DCP1B 32576 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 2451063 2451405 2451244 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 339362 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 2467815 2468125 2467879 Y NA NA NA NA NA NA CACNA1C-AS1 330241 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 2952217 2952396 2952310 Y NA ITFG2,RP4-816N1.6,FOXM1,TULP3 NA NA NA NA FOXM1 31810 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 3599173 3599880 3599550 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB4B 272105 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 3761240 3761323 3761284 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB4B 110662 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 3948349 3948613 3948479 Y NA PARP11 NA NA NA NA PARP11 31995 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.4492858658653 chr12 4378284 4379414 4378568 Y PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5 CCND2,C12orf5 PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 1524 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 4928945 4929191 4929008 Y NA KCNA6 NA NA NA NA KCNA6 12603 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 6013764 6014121 6013944 Y VWF ANO2 NA NA NA NA ANO2 39277 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 6387822 6388153 6388049 Y NA PLEKHG6 VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG6 29449 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 6616640 6616858 6616680 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH NA NA NA NA SCARNA10 530 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 6622889 6622901 6622895 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH NA NA NA NA SCARNA10 5501 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 7040569 7040832 7040702 Y NA SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 8943 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 9308932 9309318 9309073 Y KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP NA NA NA NA NA PTMAP4 81609 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 9929416 9929512 9929464 Y NA NA NA NA NA NA DDX12P 330591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 10306018 10306454 10306037 Y NA CLEC7A,OLR1 NA NA NA NA OLR1 16283 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 11221356 11221421 11221389 Y NA NA NA NA NA NA TAS2R14 100751 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 11949422 11949819 11949574 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 148634 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 11962012 11962232 11962094 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 161224 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 11975427 11976011 11975687 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 174639 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 11986979 11987463 11987102 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 186191 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 11989252 11989963 11989497 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 188464 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 12646905 12646967 12646936 Y LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 66350 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 12708006 12708373 12708190 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 4944 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 13056884 13057235 13057060 Y GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA MIR614 9528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 25819 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 13247337 13247745 13247512 Y EMP1 GSG1 NA NA NA NA GSG1 6874 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 GSG1 NA NA NA NA GSG1 72 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr12 13255105 13255488 13255167 Y EMP1 GSG1 NA NA NA NA GSG1 486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 13331850 13332340 13332007 Y NA EMP1 EMP1,KIAA1467 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 15310 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 13376628 13377027 13376828 Y NA EMP1 NA NA NA NA EMP1 28978 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 13812261 13812521 13812427 Y GRIN2B NA NA NA NA NA GRIN2B 318532 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 13817220 13817383 13817356 Y NA NA NA NA NA NA GRIN2B 313670 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 14410616 14411017 14410842 Y PLBD1 RP11-134N1.2 ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-134N1.2 43092 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr12 14413561 14413925 14413703 Y NA RP11-134N1.2 ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-134N1.2 46037 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 14426552 14426694 14426609 Y PLBD1,ATF7IP NA NA NA NA NA RP11-134N1.2 59028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 16817876 16817986 16817888 Y LMO3 NA NA NA NA NA LMO3 56348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 16970054 16970256 16970077 Y LMO3 NA NA NA NA NA RP11-1018J11.1 169804 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2,EEF1A1P4 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 20047049 20047293 20047237 Y NA RP11-405A12.1 PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 45162 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 20069508 20069793 20069676 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 22662 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.98938108374992 chr12 20076637 20076989 20076813 Y PDE3A RP11-405A12.1 NA NA NA NA RP11-405A12.1 15466 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 7220 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 5.28890499432679 chr12 20124309 20124606 20124452 Y PDE3A RP11-405A12.1 PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 31854 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 20365637 20365979 20365748 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 154200 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 20543386 20543422 20543406 Y NA PDE3A NA NA NA NA PDE3A 23207 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 20732540 20732626 20732597 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 212361 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 20746479 20746810 20746645 Y LST-3TM12 NA NA NA NA NA PDE3A 226300 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 20780077 20780376 20780084 Y LST-3TM12,PDE3A NA NA NA NA NA PDE3A 259898 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 22654594 22654831 22654713 Y NA NA NA NA NA NA ETNK1 121178 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 25207728 25208290 25207976 Y C12orf77,KRAS,CASC1,LRMP NA NA NA NA NA RP11-662I13.1 89290 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 25537800 25538060 25537930 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 17302 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 16493 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 15955 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.71402401668257 chr12 26130090 26130317 26130202 Y NA RASSF8 NA NA NA NA RASSF8 20128 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA SSPN,BHLHE41 NA NA NA NA SSPN 5113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 27346815 27347118 27346987 Y NA STK38L STK38L,REP15,PPFIBP1,C12orf71 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 47783 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 28501330 28501622 28501413 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 30934 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 29473475 29473492 29473484 Y NA NA NA NA NA NA ERGIC2 58630 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA METTL20 NA NA NA NA METTL20 6792 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.56426206139414 chr12 32881013 32881116 32881065 Y NA RP11-278C7.1,YARS2 NA NA NA NA RP11-278C7.1 2692 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 33044985 33045279 33045082 Y NA PKP2 NA NA NA NA PKP2 2495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 34500403 34500725 34500579 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 99987 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 39800065 39800203 39800134 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 34989 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 39808802 39808894 39808882 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 26298 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 40250890 40251201 40251046 Y NA NA NA NA NA NA ABCD2 239337 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 41680022 41680168 41680092 Y PDZRN4 NA NA NA NA NA CNTN1 595778 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr12 41706432 41706786 41706551 Y PDZRN4 NA NA NA NA NA CNTN1 622188 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 41849480 41849764 41849622 Y NA NA NA NA NA NA GXYLT1 686917 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 42598855 42599145 42599001 Y YAF2,YAF2,YAF2 YAF2,PPHLN1 NA NA NA NA YAF2 31006 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr12 44936022 44936417 44936038 Y NELL2,NELL2,NELL2 NA NA NA NA NA NELL2 377214 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 44976377 44976736 44976725 Y NELL2,NELL2,NELL2 NA NA NA NA NA NELL2 336895 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 45626822 45627300 45627014 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 18998 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 46380247 46380714 46380477 Y SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 3189 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 46608402 46609191 46609043 Y ARID2,SCAF11,SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 52609 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 46609835 46610258 46610179 Y ARID2,SCAF11,SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 51542 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 46844808 46845174 46844835 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 69346 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 47033293 47033660 47033445 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 257831 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 47185736 47186095 47186020 Y NA NA NA NA NA NA AMIGO2 285639 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 47612205 47612473 47612375 Y FAM113B NA NA NA NA NA AMIGO2 140471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 47613849 47614234 47614042 Y FAM113B NA NA NA NA NA AMIGO2 142115 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 47787801 47788194 47788086 Y NA NA AMIGO2,RPAP3 IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 309650 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 48076459 48076736 48076534 Y NA RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 21108 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 48277511 48277819 48277750 Y NA NA NA NA NA NA HDAC7 52596 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr12 49801773 49801917 49801846 Y NA SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 43406 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 49822830 49822961 49822896 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2 64463 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr12 49972592 49972801 49972676 Y NA KCNH3,MCRS1,PRPF40B MCRS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRPF40B 12591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 50092156 50092464 50092310 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 7044 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 50092738 50092974 50092805 Y AQP2,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 6534 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 50100082 50100376 50100305 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA FMNL3 134 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 50860078 50860266 50860172 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 36502 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 50900445 50901076 50900765 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 3677 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 50931365 50931732 50931390 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 34597 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 50932147 50932418 50932300 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 35379 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 52184760 52184919 52184839 Y NA NA NA NA NA NA ACVRL1 113773 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 52241099 52241559 52241297 Y NA NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 57133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 56366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr12 52242460 52242886 52242778 Y SLC4A8,ANKRD33 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 55806 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 52243040 52243117 52243080 Y SCN8A,ACVRL1,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 55575 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 52262826 52263308 52263216 Y NA ACVRL1 SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 35384 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 52559335 52559488 52559400 Y ACVR1B,ACVR1B,NR4A1 NA NA NA NA NA C12orf44 98305 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 52617951 52618303 52618240 Y NA NA NA NA NA NA RP3-416H24.4 153941 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 53266859 53267080 53267047 Y NA NA KRT18,KRT8,LOC283403,KRT80,EIF4B,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 73575 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 53340686 53341032 53340856 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 31 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 53612468 53612778 53612580 Y TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 11986 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 53885903 53886227 53886219 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 5620 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 54090300 54090537 54090319 Y NA ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 21108 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 54391907 54392298 54392098 Y ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9 HOXC12,HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5 NA NA NA NA HOXC-AS1 113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 54400746 54401119 54400931 Y NA HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 11029 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr12 54413422 54413659 54413446 Y ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 10978 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 54745877 54746035 54745904 Y NA NA NA NA NA NA COPZ1 52891 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 54752421 54752649 54752549 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 58595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 54949338 54949510 54949424 Y NA PDE1B,PPP1R1A NA NA NA NA PDE1B 8204 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 56132069 56132385 56132308 Y OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4 BLOC1S1,ITGA7,RDH5,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 2679 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 56193144 56193361 56193252 Y OR6C3,OR6C75 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA SARNP 16179 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 56294124 56294208 56294164 Y NA RNU1-69P,DGKA,WIBG NA NA NA NA DGKA 24895 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 5.63383358091332 chr12 57462088 57462242 57462164 Y R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6 TAC3,TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 17604 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 57529958 57530234 57530094 Y LRP1 NAB2,LRP1,STAT6 SHMT2,NDUFA4L2 IMR90 Hi-C 24141950 STAT6 6036 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 57672745 57672985 57672868 Y NA NA NA NA NA NA SHMT2 51635 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 58094555 58094631 58094593 Y NA OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31 NA NA NA NA OS9 8817 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 58168960 58169095 58169042 Y TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM TSPAN31,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM NA NA NA NA RP11-571M6.15 4149 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 58259163 58259391 58259220 Y TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2 CTDSP2 CTDSP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 20641 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 58283417 58283685 58283602 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,CTDSP2 CTDSP2,RP11-620J15.3,XRCC6BP1 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-620J15.3 44273 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 58758718 58759055 58758893 Y XRCC6BP1 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 XRCC6BP1 425394 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 62517177 62517433 62517258 Y NA NA NA NA NA NA USP15 134686 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 62970708 62971108 62970733 Y NA RP11-631N16.2,MIRLET7I NA NA NA NA RP11-631N16.2 23424 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 63051832 63051994 63051914 Y MON2,PPM1H NA NA NA NA NA MIRLET7I 56366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 153991 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 63179567 63180349 63179723 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 146468 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 64346406 64346706 64346556 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 110333 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 64386107 64386411 64386216 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 150034 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 64718599 64718738 64718727 Y NA NA NA NA NA NA C12orf56 64234 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 65262498 65262651 65262575 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D30 89909 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 65997532 65998101 65997899 Y HMGA2 RP11-221N13.3,RP11-230G5.2 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 2883 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 66008791 66009141 66009009 Y NA RP11-221N13.3,RP11-230G5.2 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 14142 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 66034360 66034755 66034412 Y NA RP11-221N13.3,RP11-230G5.2 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-230G5.2 208 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr12 66136008 66136292 66136116 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 79619 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 66286698 66286979 66286899 Y IRAK3 RP11-366L20.2 NA NA NA NA RP11-366L20.2 12751 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 67275619 67275719 67275669 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 185223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 67361974 67362194 67362149 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 98748 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 67363946 67364340 67364143 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 96602 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 67411263 67411633 67411591 Y NA RP11-123O10.4 NA NA NA NA RP11-123O10.4 49309 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 67828762 67829103 67828960 Y NA NA DYRK2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CAND1 167701 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 68753581 68753851 68753757 Y RAP1B MDM1 RAP1B,SNORA70G,LOC100507250,NUP107,MDM2,MDM1,SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 29420 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 68848831 68849142 68848987 Y RAP1B NA NUP107,LOC100507250 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 124670 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.06957151951918 chr12 69227269 69227544 69227345 Y SLC35E3 MDM2 NA NA NA NA MDM2 27313 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 69311802 69312020 69311891 Y CPM NA NA NA NA NA MDM2 111846 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 69449484 69449868 69449621 Y RAP1B,LYZ,CPM NA CPM,MDM2 IMR90 Hi-C 24141950 CPSF6 181449 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 69797421 69797731 69797518 Y NA YEATS4 NA NA NA NA YEATS4 45938 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 70648828 70649035 70648891 Y RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 13688 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 70650618 70650832 70650694 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 15478 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 71697189 71697197 71697193 Y NA NA NA NA NA NA LGR5 134353 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 72165791 72165958 72165868 Y NA RAB21 NA NA NA NA RAB21 19137 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 75902459 75902855 75902619 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 561 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 76283192 76283327 76283260 Y NA NA PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 142385 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 76963599 76963802 76963737 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 OSBPL8 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OSBPL8 12010 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 77251083 77251471 77251277 Y NA CSRP2 NA NA NA NA CSRP2 19369 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 78233905 78233967 78233936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-34H18.1 517484 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 80219716 80220141 80220058 Y NA NA NA NA NA NA RP11-84G21.1 106540 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 81156248 81156255 81156252 Y NA MYF5 NA NA NA NA MYF5 47557 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 83082881 83083305 83083086 Y NA TMTC2 NA NA NA NA TMTC2 4222 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 83157091 83157416 83157138 Y NA NA NA NA NA NA TMTC2 78432 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 85197588 85197851 85197679 Y NA NA NA NA NA NA SLC6A15 107543 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr12 85344886 85345065 85345044 Y NA SLC6A15 NA NA NA NA SLC6A15 39492 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 86013160 86013354 86013263 Y NA NA NA NA NA NA RASSF9 214994 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 86658149 86658358 86658243 Y NA NA NA NA NA NA NTS 392076 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr12 87554185 87554198 87554192 Y NA NA NA NA NA NA MGAT4C 323504 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 89553560 89553820 89553732 Y DUSP6,ATP2B1 NA POC1B,LOC728084,DUSP6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP6 191228 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 89579864 89580040 89579936 Y NA NA DUSP6,POC1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP6 165008 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 89727563 89727887 89727725 Y ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 17161 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 89740084 89740418 89740292 Y POC1B,ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 4630 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr12 89845741 89845891 89845816 Y NA NA NA NA NA NA POC1B 71910 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 90091098 90091469 90091453 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 9608 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 90125293 90125953 90125608 Y DUSP6,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 24216 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 90274602 90274800 90274694 Y POC1B,ATP2B1 NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 173525 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 90484866 90485476 90485213 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA ATP2B1 383789 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 91499594 91499827 91499730 Y NA KERA,LUM NA NA NA NA LUM 3781 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 91775053 91775433 91775292 Y NA NA LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DCN 200153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 92189163 92189178 92189169 Y NA NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 348171 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 92268006 92268083 92268045 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 269266 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 92415461 92415779 92415694 Y NA NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 121570 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 92484962 92485088 92485023 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 52261 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 92528487 92528918 92528861 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 8431 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 93389469 93389782 93389626 Y NA NA NA NA NA NA EEA1 68362 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 93890331 93890756 93890540 Y NA MRPL42 NA NA NA NA MRPL42 31067 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 94158186 94158524 94158355 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 89035 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 94495978 94496358 94496187 Y NA NA CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBMS2P1 320387 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 RBMS2P1 NA NA NA NA RBMS2P1 42578 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr12 95043067 95043319 95043087 Y TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 729 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 95477787 95477978 95477880 Y NA NR2C1 NR2C1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NR2C1 12308 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 95492031 95492186 95492111 Y NA NR2C1 NA NA NA NA NR2C1 26552 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 95840387 95840581 95840484 Y METAP2 METAP2 VEZT,FGD6 IMR90 Hi-C 24141950 METAP2 24715 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 96642925 96643253 96643074 Y CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 56765 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 96650909 96650966 96650937 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 64749 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 96659033 96659395 96659303 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 72873 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 96685157 96685428 96685293 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 98997 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 96752607 96752772 96752695 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 39566 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 96773991 96774080 96774036 Y NA CDK17 NA NA NA NA CDK17 18258 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 98487338 98487732 98487536 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-41P 322084 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 99532172 99532427 99532300 Y ANKS1B,ANKS1B,ANKS1B NA NA NA NA NA APAF1 495253 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 102187051 102187461 102187342 Y DRAM1,GNPTAB GNPTAB NA NA NA NA GNPTAB 35255 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 102220478 102220758 102220699 Y NA GNPTAB,DRAM1 NA NA NA NA GNPTAB 1958 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 102734344 102734692 102734517 Y NA NA IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 NUP37 222442 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 102930045 102930144 102930098 Y NA NA PARPBP,IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 NUP37 418143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 104199621 104199645 104199634 Y NA NT5DC3 NA NA NA NA NT5DC3 33330 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 104330398 104330552 104330475 Y NA HSP90B1,C12orf73,TDG NA NA NA NA HSP90B1 8513 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 106593469 106593866 106593668 Y NA NA NA NA NA NA NUAK1 61658 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 107153976 107154194 107154103 Y RFX4,RIC8B RIC8B NA NA NA NA RIC8B 12179 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 107363542 107363991 107363752 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 14953 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.06957151951918 chr12 108920909 108921183 108921031 Y NA FICD,SART3,ISCU NA NA NA NA FICD 13947 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 108989761 108990124 108989943 Y NA SART3,ISCU NA NA NA NA ISCU 35403 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5 NA NA NA NA RP11-968O1.5 23553 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 110315812 110316035 110315886 Y C12orf34,TCHP,TCHP TRPV4,GLTP,TCHP NA NA NA NA GLTP 258 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 110809213 110809452 110809351 Y NA ANAPC7 NA NA NA NA ANAPC7 30083 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 111016111 111016444 111016311 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 2681 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 111019873 111020249 111019900 Y MYL2,ATP2A2,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 748 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 111218381 111218520 111218451 Y PPTC7 PPP1CC NA NA NA NA PPP1CC 39637 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 111752741 111753113 111753000 Y NA NA NA NA NA NA FAM109A 51812 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 111875686 111876044 111875771 Y BRAP,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 33934 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 111881338 111881509 111881420 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 39586 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 112545862 112545946 112545885 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 1036 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 113524315 113524473 113524399 Y DTX1 DTX1 NA NA NA NA DTX1 31801 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 114842378 114842779 114842612 Y TBX5,TBX5,TBX5 NA NA NA NA NA TBX3 277190 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 115865739 115865767 115865753 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 745770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 116590030 116590409 116590220 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 122734 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 116602727 116603094 116602910 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 110049 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 116821073 116821333 116821156 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 107930 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 116872632 116872752 116872692 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 96475 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 116946088 116946451 116946189 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 22776 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 118605193 118605499 118605376 Y NA PEBP1,VSIG10 NA NA NA NA VSIG10 33362 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 118632324 118632442 118632383 Y NA RPS2P5 PEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P5 49435 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 120153680 120153798 120153737 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 50122 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA NA NA NA NA NA CIT 113436 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 120433844 120433899 120433873 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 119407 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 120445148 120445418 120445237 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 107888 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 120926786 120926862 120926830 Y SIRT4 TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5 NA NA NA NA DYNLL1 21133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 121714857 121715111 121714996 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 19000 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 121715307 121715461 121715407 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 18650 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 121888305 121888670 121888535 Y NA NA NA NA NA NA RNF34 52461 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 122124782 122125118 122124936 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 MORN3,TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MORN3 16245 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr12 123131126 123131793 123131490 Y CLIP1,RSRC2,VPS37B,HCAR3,HCAR2 NA NA NA NA NA DENR 103528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 123636095 123636496 123636485 Y NA PITPNM2 NA NA NA NA PITPNM2 3533 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 124875953 124876085 124876023 Y NCOR2 NA NA NA NA NA FAM101A 420165 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 124926088 124926324 124926239 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 438890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 124963399 124963744 124963551 Y UBC NA NA NA NA NA SCARB1 401470 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 125008756 125009019 125008888 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 356195 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 125027797 125027993 125027883 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 337221 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 125033431 125034089 125033755 Y UBC NA NA NA NA NA SCARB1 331125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 313839 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr12 125346086 125346324 125346188 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 18890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 125395122 125395522 125395138 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 4392 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 125479851 125480155 125479863 Y NA DHX37,BRI3BP NA NA NA NA BRI3BP 3605 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 125534116 125534467 125534247 Y NA AACS AACS K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AACS 13458 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 129306542 129307039 129306920 Y SLC15A4,GLT1D1 SLC15A4,GLT1D1 NA NA NA NA SLC15A4 14 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 131117194 131117823 131117569 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA RIMBP2 81003 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 131941405 131941587 131941511 Y NA NA NA NA NA NA SFSWAP 252039 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 132221686 132221872 132221813 Y NOC4L SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 28060 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 132293483 132293821 132293495 Y NA MMP17 NA NA NA NA MMP17 17117 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4100 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr12 132558778 132559145 132558825 Y NA SNORA49,EP400NL NA NA NA NA EP400NL 7683 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 133029955 133030417 133030330 Y NA FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 33720 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 133528012 133528357 133528019 Y NA CHFR,ZNF605 NA NA NA NA CHFR 2533 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr12 133688468 133688629 133688567 Y NA ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 16430 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr12 133701272 133701384 133701332 Y ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10 ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 3675 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 20555489 20555876 20555683 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 24679 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 20694627 20695029 20694906 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3 NA NA NA NA GJA3 38159 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 20701926 20702100 20701958 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3 NA NA NA NA GJA3 31088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr13 21649697 21649802 21649731 Y NA LATS2 LATS2,SAP18 IMR90 Hi-C 24141950 LATS2 16011 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 21893563 21893874 21893643 Y NA MIPEPP3 ZDHHC20 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEPP3 23285 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 22242983 22243087 22242992 Y NA RPS7P10,FGF9 NA NA NA NA FGF9 435 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 22688764 22689136 22688963 Y NA NA NA NA NA NA FGF9 445242 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 23500406 23500844 23500578 Y NA NA NA NA NA NA HMGA1P6 205469 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr13 24543608 24543809 24543709 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 82050 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 24697003 24697328 24697264 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 235445 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 27166168 27166184 27166175 Y GPR12,WASF3 WASF3 NA NA NA NA WASF3 36328 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 27198783 27198789 27198786 Y NA NA NA NA NA NA WASF3 68943 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 27728821 27729155 27728988 Y USP12 USP12 NA NA NA NA USP12 14878 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 28534904 28535178 28535096 Y LNX2,FLT3,PRHOXNB PDX1 NA NA NA NA PDX1 42747 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 29427378 29427629 29427504 Y NA NA NA NA NA NA SLC46A3 136271 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058 LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA ALOX5AP 175921 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 31783730 31783901 31783816 Y NA HSPH1,B3GALTL NA NA NA NA B3GALTL 11657 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 272945 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr13 36630888 36631287 36631099 Y DCLK1 NA NA NA NA NA DCLK1 72156 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 38874589 38874762 38874676 Y NA UFM1 NA NA NA NA UFM1 47224 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 41052248 41052639 41052450 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 186095 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 42137571 42138044 42137923 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 254230 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 42646001 42646399 42646206 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 197890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 42705100 42705257 42705170 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 139032 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 42942077 42942145 42942079 Y TNFSF11,AKAP11 NA NA NA NA NA AKAP11 97788 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 43865785 43866112 43865949 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 270446 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 43952045 43952412 43952203 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 356706 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 44028316 44028697 44028507 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 330347 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 44165760 44165919 44165882 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 193125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 44303607 44303703 44303655 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 55341 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 44329047 44329228 44329222 Y NA ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 29816 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 90905 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 45333095 45333256 45333140 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 183812 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 45745052 45745233 45745142 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 52402 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 45752820 45753055 45752934 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 60170 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 49228719 49228977 49228933 Y FNDC3A,FNDC3A CYSLTR2 CYSLTR2 IMR90 Hi-C 24141950 CYSLTR2 49974 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 49563041 49563333 49563220 Y RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A NA NA NA NA NA CDADC1 256714 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 49569007 49569270 49569139 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 250777 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 50630657 50630910 50630784 Y NA MIR16-1,DLEU1 NA NA NA NA MIR16-1 9460 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 50706824 50707012 50706949 Y NA DLEU2 DLEU7,DLEU1,DLEU2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLEU2 8968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 51486183 51486653 51486377 Y RNASEH2B RNASEH2B NA NA NA NA RNASEH2B 4369 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 51491068 51491415 51491243 Y RNASEH2B RNASEH2B NA NA NA NA RNASEH2B 9254 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 51641920 51642198 51642053 Y INTS6 NA NA NA NA NA FAM124A 152305 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 52319871 52320068 52319946 Y NA NA NA NA NA NA DHRS12 56225 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 54073704 54073716 54073710 Y NA NA NA NA NA NA PCDH8 652929 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 59854407 59854488 59854447 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 881633 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 60723538 60723946 60723707 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 12175 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 63021628 63021960 63021792 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 1626184 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 64537945 64538229 64538154 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 109915 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 64589476 64589676 64589576 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 58468 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 64623751 64624068 64623941 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 24076 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 64652316 64652644 64652373 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 4172 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.59904782115373 chr13 66880384 66880768 66880605 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 921700 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 67146133 67146492 67146404 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 655976 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 67442728 67443117 67443041 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 359351 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 67461334 67461726 67461614 Y PCDH9 NA NA NA NA NA PCDH9 340742 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 67633828 67634032 67633930 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 168436 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 67730122 67730387 67730193 Y PCDH9 NA NA NA NA NA PCDH9 72081 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 69259676 69259922 69259838 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 1457208 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 71302853 71303171 71302975 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 944028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 72206339 72206570 72206525 Y DACH1 H3F3BP1 NA NA NA NA H3F3BP1 40629 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 72438548 72439003 72438895 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 327 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr13 73223300 73223692 73223493 Y PIBF1 NA NA NA NA NA RPL21P110 52139 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 75882191 75882614 75882549 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 171636 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 76138851 76139260 76139031 Y NA COMMD6,UCHL3 NA NA NA NA UCHL3 17232 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 77599424 77599520 77599503 Y NA RPL7P44,DHX9P1,CLN5,FBXL3 NA NA NA NA FBXL3 94 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 85779521 85779874 85779724 Y NA NA NA NA NA NA LINC00351 155862 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 91807013 91807446 91807380 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 190628 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 92294972 92294984 92294978 Y NA NA NA NA NA NA GPC5 246043 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 92871734 92872145 92872019 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 161637 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 92900985 92901044 92901015 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 190888 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 93001340 93001722 93001531 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 291243 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 93083293 93083662 93083475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 373196 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr13 93096966 93097333 93097096 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 386869 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 93868426 93868831 93868563 Y NA GPC6 GPC6 IMR90 Hi-C 24141950 GPC6 8264 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 93915220 93915506 93915338 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 38125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 94472931 94472950 94472936 Y NA NA NA NA NA NA SNORD22 453718 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 94644641 94644702 94644672 Y NA NA NA NA NA NA DCT 485234 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 94785518 94785984 94785813 Y NA NA NA NA NA NA DCT 343952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr13 94891482 94891695 94891602 Y NA NA NA NA NA NA DCT 238241 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 95003602 95003792 95003731 Y NA NA NA NA NA NA DCT 126144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 95854476 95854763 95854633 Y NA NA NA NA NA NA ABCC4 96924 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 95931058 95931197 95931128 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 20490 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 96284564 96284961 96284763 Y NA DZIP1,DNAJC3-AS1,DNAJC3 NA NA NA NA DZIP1 9996 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 99956842 99956954 99956899 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 90830 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 100028420 100028640 100028476 Y NA NA NA NA NA NA TM9SF2 123031 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 100154383 100154610 100154487 Y GPR183 TM9SF2 NA NA NA NA TM9SF2 2712 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 100760491 100760725 100760608 Y NA PCCA,RPL15P18 NA NA NA NA PCCA 21222 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 104371816 104371919 104371873 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 876622 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 104663923 104664083 104664030 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 1168729 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr13 106753025 106753272 106753030 Y ARGLU1 NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 465240 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 106777477 106777605 106777541 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 440907 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 107078443 107078580 107078574 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 139932 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 107124360 107124455 107124408 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 94057 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 107448247 107448283 107448269 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G1P5 134462 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 108153519 108153767 108153691 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 363316 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr13 108310994 108311341 108311278 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 205742 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 108407171 108407488 108407466 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 109595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 108520131 108520835 108520801 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3048 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 108978746 108978885 108978817 Y LIG4,ABHD13,TNFSF13B NA NA NA NA NA ABHD13 110019 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 111061947 111062361 111062286 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 104451 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr13 111597919 111598063 111597990 Y NA ANKRD10 ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 32503 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 111609846 111610157 111610005 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ARHGEF7,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 44430 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 112726762 112727353 112726963 Y NA SOX1 NA NA NA NA SOX1 6849 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr13 112727649 112728064 112727870 Y NA SOX1 NA NA NA NA SOX1 7736 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 113179985 113180373 113180107 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP3 60108 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 113828673 113828834 113828768 Y ATP11A,DCUN1D2,CUL4A CUL4A,PCID2 NA NA NA NA CUL4A 31718 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 114119812 114119949 114119881 Y NA DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 23318 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr13 114556439 114556767 114556713 Y NA GAS6 NA NA NA NA GAS6 8279 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 20803011 20803143 20803077 Y NA TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1 NA NA NA NA CCNB1IP1 3540 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 21660147 21660368 21660311 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPC 75285 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 22025629 22026018 22025838 Y NA METTL3,SALL2 NA NA NA NA SALL2 22279 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 23056506 23056666 23056661 Y REM2 DAD1,ABHD4 NA NA NA NA DAD1 331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 23449151 23449315 23449234 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB HAUS4,AJUBA,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 536 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 23554726 23554907 23554813 Y SLC7A7,RBM23,ACIN1 CDH24,C14orf119,ACIN1 NA NA NA NA C14orf119 7067 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 24891908 24892270 24892086 Y NA NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA KHNYN 4222 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 30710598 30710949 30710622 Y NA NA PRKD1 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD1 51494 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 31360303 31360625 31360494 Y NA COCH NA NA NA NA COCH 18583 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 31455672 31455729 31455709 Y NA AP4S1,STRN3 NA NA NA NA AP4S1 36583 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 32472672 32472966 32472819 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP5 70354 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr14 34507932 34508142 34508077 Y EGLN3 NA EGLN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 421420 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 35090811 35090907 35090859 Y NA SNX6 NA NA NA NA SNX6 6482 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 35625298 35625573 35625393 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 35543 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 36235126 36235268 36235197 Y NA RALGAPA1 NA NA NA NA RALGAPA1 41242 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 37465189 37465490 37465428 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 174581 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 37785804 37785829 37785809 Y NA NA NA NA NA NA MIPOL1 120686 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 38052089 38052429 38052199 Y NA TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 10623 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 39768270 39768447 39768359 Y PNN,MIA2 CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 35782 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 41099089 41099243 41099183 Y NA NA NA NA NA NA LRFN5 975530 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.82900021221141 chr14 42075138 42075996 42075609 Y LRFN5 LRFN5 NA NA NA NA LRFN5 365 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 42079862 42079990 42079926 Y LRFN5 LRFN5 NA NA NA NA LRFN5 5089 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 44804196 44804463 44804330 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 560035 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 47843045 47843295 47843249 Y NA NA NA NA NA NA RPL13AP2 174738 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 50328882 50329315 50329091 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10961 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D NA NA NA NA NA ARF6 109565 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr14 50926261 50926342 50926322 Y MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1 CDKL1 NA NA NA NA CDKL1 45082 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 51066593 51066625 51066609 Y TRIM9,CDKL1,ATL1 MAP4K5 SAV1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K5 40749 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 129928 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 52726227 52726468 52726407 Y NA NA PTGDR,TXNDC16 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER2 52555 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 53209302 53209454 53209392 Y NA ERO1L,PSMC6,STYX,GNPNAT1 NA NA NA NA STYX 14404 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 53269343 53269708 53269600 Y PTGER2 GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 12957 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 53361596 53362059 53361840 Y NA NA NA NA NA NA FERMT2 55094 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 53392802 53392977 53392890 Y NA FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 24176 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 53628560 53628795 53628705 Y DDHD1 DDHD1 DDHD1 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD1 10560 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 54084179 54084193 54084186 Y NA NA NA NA NA NA BMP4 339286 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 54137471 54137744 54137539 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 BMP4 285735 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 54444458 54444658 54444588 Y NA BMP4 BMP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 BMP4 20979 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 54640534 54640974 54640637 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 BMP4 217055 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 54899909 54900051 54899977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 38342 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 54902274 54902529 54902415 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 40707 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 57307919 57308194 57308095 Y OTX2 OTX2 NA NA NA NA OTX2 32722 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 57459148 57459304 57459264 Y NA NA NA NA NA NA OTX2 183951 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.06957151951918 chr14 58705309 58705629 58705462 Y ARID4A ACTR10,PSMA3 NA NA NA NA PSMA3 3920 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 58726838 58727438 58727133 Y NA PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA PSMA3 17289 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr14 60189263 60189533 60189522 Y NA NA NA NA NA NA RTN1 146151 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 61188145 61188381 61188263 Y NA SIX4,MNAT1 NA NA NA NA SIX4 685 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 62298450 62298645 62298529 Y NA COX4I1P1 PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 1363 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 64185455 64185764 64185678 Y PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1 SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 6993 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 64670198 64670275 64670237 Y NA NA NA NA NA NA MTHFD1 182474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 65224783 65224915 65224850 Y ZBTB1,PLEKHG3 NA NA NA NA NA PLEKHG3 55963 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 65637410 65637773 65637587 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 69997 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 65905118 65905243 65905181 Y NA FUT8 NA NA NA NA FUT8 29808 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 67537409 67537555 67537482 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 168271 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 67774949 67775062 67775003 Y PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 49652 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 68431145 68431760 68431180 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 146649 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 68720004 68720020 68720012 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 166893 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 69159987 69160257 69160134 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 100933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 69328763 69329130 69328947 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 67573 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 70803999 70804244 70804143 Y NA COX16 NA NA NA NA COX16 20204 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 71838643 71839069 71838909 Y PCNX,SIPA1L1 NA SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 52112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 71870372 71870659 71870456 Y PCNX,SIPA1L1 NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 83841 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 71996595 71997083 71996703 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 210064 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 72602663 72602717 72602690 Y RGS6,RGS6 NA NA NA NA NA DCAF4 788323 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 72667667 72667865 72667766 Y NA NA NA NA NA NA DCAF4 723175 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 74208106 74208498 74208298 Y C14orf43 PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA PNMA1 28978 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 74220065 74220506 74220203 Y C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43 PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 31557 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 74224982 74225468 74225101 Y NA PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 26595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 74949377 74949710 74949544 Y NA MIR4709,ISCA2,NPC2 NA NA NA NA MIR4709 4470 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 76234838 76235006 76234846 Y NA NA TGFB3,IFT43 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf1 109306 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 76243945 76244101 76244023 Y TGFB3 NA NA NA NA NA C14orf1 118413 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 66642 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr14 76734272 76734379 76734290 Y ESRRB NA NA NA NA NA TGFB3 286938 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 77396429 77396646 77396562 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-7F17.1 36380 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 77422240 77422571 77422458 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL RP11-7F17.1 IRF2BPL,KIAA1737 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 10455 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 77489818 77490087 77489881 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 2947 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 77495718 77495873 77495815 Y NA IRF2BPL,RP11-7F17.3 NA NA NA NA IRF2BPL 2684 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 77498012 77498283 77498148 Y NA IRF2BPL,RP11-7F17.3 NA NA NA NA IRF2BPL 4978 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL,RP11-7F17.3 KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr14 77508586 77508871 77508699 Y IRF2BPL IRF2BPL,RP11-7F17.3 IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 15552 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 77826239 77826291 77826265 Y NA GSTZ1,POMT2,SAMD15,TMED8 NA NA NA NA SAMD15 14741 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 79406333 79406507 79406344 Y NA NA NA NA NA NA NRXN3 699599 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 79502772 79503033 79502836 Y NA NA NA NA NA NA NRXN3 796038 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 79880226 79881040 79880569 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 971060 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 80972596 80972697 80972671 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 120496 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 81019191 81019257 81019224 Y DIO2,CEP128 NA NA NA NA NA DIO2 167091 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 81439745 81439770 81439758 Y CEP128,TSHR CEP128 NA NA NA NA CEP128 15884 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr14 82233009 82233227 82233113 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L 234804 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 88445167 88445328 88445280 Y GPR65,GALC,GALC GALC NA NA NA NA GALC 12681 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 88468736 88469338 88468995 Y GALC,GALC,GPR65 GALC NA NA NA NA GALC 10727 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 89493430 89493694 89493607 Y NA NA EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768,EML5,TTC8 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 204933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 90081839 90081992 90081916 Y FOXN3,FOXN3 FOXN3 NA NA NA NA FOXN3 1501 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 90167936 90168219 90168049 Y TDP1,FOXN3,FOXN3 NA FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN3 84443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 90761350 90761506 90761428 Y NA PSMC1 NA NA NA NA PSMC1 40511 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 90765988 90766106 90766043 Y KCNK13 PSMC1 NA NA NA NA PSMC1 45149 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 91090658 91091172 91090732 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 189651 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 91267745 91267886 91267834 Y NA TTC7B,CTD-3035D6.2 NA NA NA NA TTC7B 12937 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 91511263 91511534 91511399 Y NA C14orf159,RPS6KA5 NA NA NA NA C14orf159 13143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 91723953 91724002 91723978 Y NA NA NA NA NA NA CCDC88C 158186 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 91827435 91827790 91827659 Y RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 54398 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 91830447 91830798 91830608 Y SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 51390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 91987775 91988051 91987908 Y SMEK1 SMEK1 NA NA NA NA SMEK1 12877 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 92070183 92070310 92070247 Y NA NA NA NA NA NA SMEK1 95285 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 93697718 93697880 93697787 Y ITPK1,MOAP1 MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142 NA NA NA NA C14orf142 26279 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 94808145 94809286 94808819 Y SERPINA1 NA NA NA NA NA PPP4R4 197680 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 98634336 98634368 98634354 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 1101493 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 296223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 99735950 99736476 99736276 Y BCL11B BCL11B NA NA NA NA BCL11B 89 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA DEGS2,YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 34673 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr14 100687969 100688087 100687996 Y NA YY1,RP11-638I2.4 YY1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 YY1 14548 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr14 102288392 102288845 102288491 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 62257 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 102292259 102292630 102292392 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 66124 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 102342938 102343183 102343098 Y PPP2R5C,WDR20,PPP2R5C NA NA NA NA NA DYNC1H1 85682 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.90919064798067 chr14 102746257 102746658 102746398 Y NA MOK,ZNF839 NA NA NA NA MOK 22879 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 102780583 102780765 102780709 Y NA MOK,ZNF839,CINP,TECPR2 MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF839 949 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 103097343 103097523 103097412 Y NA RCOR1 NA NA NA NA RCOR1 40345 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 103266656 103267057 103266785 Y NA TRAF3 CDC42BPB,AMN IMR90 Hi-C 24141950 TRAF3 24843 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 123915 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr14 103726827 103727460 103727139 Y MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5 NA EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 70421 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 103785779 103785970 103785865 Y NA EIF5 RCOR1,EIF5,CDC42BPB,LOC100131366,TNFAIP2,MARK3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF5 11911 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 105191285 105191466 105191451 Y NA INF2,ADSSL1,SIVA1 NA NA NA NA ADSSL1 2762 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 105546439 105546836 105546640 Y NA NA BTBD6,BRF1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA4 60954 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 105653618 105653649 105653635 Y NA JAG2,NUDT14 NA NA NA NA NUDT14 7958 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 105665519 105665885 105665604 Y NA JAG2,NUDT14,BTBD6 NA NA NA NA NUDT14 19859 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 6059 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 5167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr15 20570096 20570220 20570180 Y NA NA REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-603B24.2 1973869 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 20596893 20597220 20597190 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1946869 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 20599040 20599336 20599188 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1944753 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 21914435 21914569 21914482 Y OR4N4 NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 629520 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 23841916 23842255 23842027 Y MKRN3 MKRN3,MAGEL2 NA NA NA NA MKRN3 33462 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 25018281 25018456 25018384 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN SNRPN NA NA NA NA SNRPN 48338 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 25123469 25123644 25123557 Y SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN NA NA NA NA NA SNRPN 56675 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 25209245 25209272 25209252 Y NA SNURF,SNHG14,SNORD64 NA NA NA NA SNURF 11064 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 25555752 25555966 25555813 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 126162 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 25595443 25596209 25595953 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 85919 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 25634776 25635000 25634877 Y SNURF,SNRPN UBE3A NA NA NA NA UBE3A 47128 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 25709347 25709692 25709520 Y NA UBE3A NA NA NA NA UBE3A 27219 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 25766793 25766905 25766849 Y NA NA LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 84665 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 26958560 26958904 26958869 Y NA NA NA NA NA NA GABRA5 150606 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 27014024 27014086 27014055 Y GABRB3,GABRB3,GABRA5,GABRA5 NA NA NA NA NA GABRA5 95424 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 27509398 27509798 27509429 Y NA NA NA NA NA NA GABRG3 294969 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 28342283 28342646 28342468 Y OCA2 NA NA NA NA NA OCA2 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 29407243 29407640 29407337 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA NDNL2 152393 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 29526240 29526874 29526776 Y NA NDNL2 NA NA NA NA NDNL2 33159 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 29949236 29949642 29949365 Y NA RP11-680F8.1 NA NA NA NA RP11-680F8.1 15552 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA RP11-680F8.1 57328 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 31617195 31617521 31617244 Y MTMR10,KLF13 KLF13 NA NA NA NA KLF13 137 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 31627410 31627711 31627458 Y NA KLF13 NA NA NA NA KLF13 10352 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 31733081 31733438 31733352 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13,OTUD7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 116023 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 31799647 31800074 31799955 Y NA NA NA NA NA NA KLF13 182589 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 32020218 32020316 32020267 Y NA NA OTUD7A IMR90 Hi-C 24141950 OTUD7A 140676 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 32030840 32030849 32030846 Y NA NA NA NA NA NA OTUD7A 130143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 32140399 32140767 32140585 Y NA OTUD7A NA NA NA NA OTUD7A 20225 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 32384266 32384605 32384436 Y CHRNA7 NA NA NA NA NA CHRNA7 63575 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 33742285 33742304 33742295 Y NA NA NA NA NA NA RYR3 141122 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 106465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 312243 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 35788754 35789006 35788880 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 510266 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 36349026 36349361 36349194 Y NA NA NA NA NA NA RP11-184D12.1 193097 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 36355561 36355727 36355644 Y NA NA NA NA NA NA RP11-184D12.1 186731 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr15 36404848 36405114 36404981 Y C15orf41 NA NA NA NA NA RP11-184D12.1 137344 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr15 36502579 36502898 36502738 Y NA RP11-184D12.1 NA NA NA NA RP11-184D12.1 39560 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr15 36720333 36720777 36720654 Y NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf41 149035 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr15 36897694 36898088 36897999 Y C15orf41 C15orf41 NA NA NA NA C15orf41 27882 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 37047885 37048196 37047991 Y NA NA NA NA NA NA C15orf41 178073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 37249666 37249815 37249741 Y NA NA NA NA NA NA MEIS2 141689 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 37253162 37253269 37253223 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA MEIS2 138235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 37396811 37397277 37397114 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 5307 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 38376586 38376698 38376641 Y NA NA SPRED1,FAM98B IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 165829 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 39361992 39362177 39362006 Y NA NA FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 506216 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 438868 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 39449850 39450075 39449963 Y NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 421205 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 39673743 39674138 39673898 Y NA NA THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 197142 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 40180090 40180249 40180216 Y NA GPR176,EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 30844 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 40728458 40728872 40728667 Y NA IVD,BAHD1,CHST14 NA NA NA NA BAHD1 1048 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 41158071 41158384 41158228 Y RHOV RHOV,VPS18 NA NA NA NA RHOV 6103 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 41456018 41456111 41456065 Y NA INO80 NA NA NA NA INO80 49466 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 41878002 41878382 41878246 Y NA RPAP1,TYRO3,MGA NA NA NA NA TYRO3 30129 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.83961912846149 chr15 42091432 42091661 42091502 Y NA MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B NA NA NA NA JMJD7,PLA2G4B 26622 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 42535686 42535733 42535710 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 27698 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 42547123 42547182 42547153 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 16249 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 42814906 42815063 42814960 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 23937 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 43200953 43201247 43201100 Y NA TTBK2 NA NA NA NA TTBK2 9760 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 43232186 43232306 43232267 Y TTBK2 TTBK2 TTBK2 IMR90 Hi-C 24141950 TTBK2 21179 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr15 43803895 43804004 43803947 Y TGM7,TP53BP1,MAP1A TP53BP1,MAP1A NA NA NA NA MAP1A 2739 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr15 44837233 44837387 44837300 Y CTDSPL2,PATL2 EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 9978 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 45784407 45784611 45784453 Y C15orf48,SQRDL,PLDN SLC30A4 NA NA NA NA SLC30A4 28394 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 49268018 49268116 49268067 Y NA SHC4 NA NA NA NA SHC4 14377 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 50634288 50634665 50634477 Y NA GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 10860 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 51169242 51169420 51169339 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,USP50,SPPL2A,AP4E1,ASB18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 AP4E1 29449 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 51535974 51536234 51536151 Y SPPL2A,DMXL2 NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 140501 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 51921715 51922068 51922003 Y NA DMXL2,SCG3 DMXL2,LYSMD2,TMOD2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DMXL2 8685 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr15 53063704 53063805 53063755 Y NA NA NA NA NA NA FAM214A 63690 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 56029665 56029817 56029741 Y NA PRTG NA NA NA NA PRTG 3471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 56162319 56162688 56162565 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4 121256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 57261737 57262096 57261746 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 52916 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 57302684 57303020 57302852 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 93863 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 57529031 57529296 57529123 Y NA NA NA NA NA NA CGNL1 136869 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 58568513 58568584 58568545 Y NA NA LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A2 219481 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A2 96873 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 58898092 58898418 58898348 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A2 110027 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 59019191 59019406 59019394 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 20771 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 59030118 59030538 59030425 Y RNF111,ADAM10 ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 9639 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 59226674 59226915 59226795 Y NA SLTM FAM63B MCF7 ChIA-PET 22265404 SLTM 2822 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 59469464 59469853 59469728 Y ADAM10,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 74187 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 59566542 59566544 59566543 Y MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 96348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 59649595 59649770 59649683 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 13122 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 60700608 60701055 60700809 Y NA ANXA2,RP11-745A24.2 NA NA NA NA RP11-745A24.2 5946 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 60861865 60862603 60862448 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 92488 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 60881604 60881753 60881652 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 112227 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 60937521 60937640 60937631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 168144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 61264927 61265345 61265257 Y NA NA NARG2 IMR90 Hi-C 24141950 RORA 254173 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 61340586 61340641 61340614 Y NA NA NA NA NA NA RORA 178877 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 61501689 61502023 61501856 Y NA RORA NA NA NA NA RORA 17495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 62042724 62043095 62042895 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 307577 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 62130295 62130308 62130301 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 220364 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 62683990 62684402 62684060 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 62896766 62896914 62896838 Y NA NA TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 216041 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 63771566 63772233 63772016 Y HERC1,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,CA12,USP3,HERC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 22560 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 63894930 63894962 63894946 Y FBXL22 USP3-AS1 NA NA NA NA USP3-AS1 3142 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 64000367 64000635 64000532 Y USP3,HERC1 NA NA NA NA NA USP3-AS1 108579 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 64397616 64397971 64397713 Y SNX1 DAPK2,FAM96A,SNX1,SNX22 NA NA NA NA SNX1 13294 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 64940943 64941327 64941079 Y NA NA NA NA NA NA OAZ2 52153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 64991554 64991938 64991797 Y NA OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 1542 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 65127928 65128208 65128016 Y NA PIF1,PLEKHO2 PIF1 K562 ChIA-PET 22265404 PLEKHO2 3880 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.83961912846149 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 65713781 65714189 65713985 Y IGDCC3,IGDCC4 IGDCC3,IGDCC4 NA NA NA NA IGDCC4 371 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 65831867 65832220 65831871 Y NA DPP8,PTPLAD1 C15orf44 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD1 11111 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 66163349 66163534 66163463 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80718 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 67373443 67373710 67373534 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 19342 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 67426476 67426864 67426547 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 72375 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 RPS24P16 NA NA NA NA RPS24P16 33898 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 RPS24P16 NA NA NA NA RPS24P16 32338 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 67516633 67516865 67516859 Y NA RPS24P16,IQCH,AAGAB NA NA NA NA RPS24P16 5919 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 67926783 67927143 67926830 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K5 93736 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 68132952 68133362 68133003 Y PIAS1,CALML4 NA NA NA NA NA PIAS1 211155 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 68260561 68260756 68260687 Y C15orf61 NA PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 83761 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 68852038 68852173 68852100 Y NOX5,CORO2B,CORO2B NA NA NA NA NA ITGA11 129537 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 69087536 69088004 69087836 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA SPESP1 20556 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 69817910 69818170 69818070 Y NA NA C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 74787 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 70006588 70006856 70006758 Y TLE3 NA C15orf50,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 263465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr15 70392960 70393272 70393150 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 4445 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 70867778 70867861 70867857 Y NA NA NA NA NA NA UACA 186071 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 71571390 71571701 71571551 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388266 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 71615809 71616164 71615988 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 432685 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 72098812 72099061 72098925 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 305538 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 72198564 72199008 72198773 Y PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA SENP8 205591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 72270951 72271133 72271042 Y GRAMD2 NA NA NA NA NA SENP8 133466 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 72448533 72448632 72448574 Y TMEM202,CELF6,CELF6,SENP8,SENP8 SENP8,MYO9A NA NA NA NA MYO9A 39615 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 73061587 73061861 73061724 Y PARP6,CELF6,CELF6,ARIH1,ADPGK ADPGK NA NA NA NA ADPGK 14326 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 73435699 73435965 73435801 Y NEO1,HCN4 NA NA NA NA NA NEO1 93648 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 74221354 74221537 74221415 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 5024 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA STRA6 89360 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 74728445 74728784 74728615 Y NA SEMA7A,UBL7 NA NA NA NA SEMA7A 3637 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 74876114 74876298 74876206 Y ULK3,CLK3 ARID3B,CLK3 NA NA NA NA CLK3 12543 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3 NA NA NA NA EDC3 32032 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 75250602 75250974 75250783 Y RPP25 COX5A,SCAMP5,RPP25 NA NA NA NA RPP25 2797 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 75382415 75382988 75382870 Y NA NA NA NA NA NA PPCDC 68519 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 75400106 75401427 75400997 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA C15orf39,SCAMP5,PPCDC MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C15orf39 84557 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 75404629 75405178 75404816 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA SCAMP5,PPCDC,C15orf39 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 80806 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 75449127 75449383 75449255 Y NA C15orf39 PPCDC,SCAMP5 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 36601 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.72464293293265 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr15 75867013 75867354 75867182 Y C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1 PTPN9,SNUPN NA NA NA NA PTPN9 2276 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr15 76455838 76456047 76455943 Y NA NA NA NA NA NA ETFA 145766 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 76639120 76639380 76639270 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12055 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 77340153 77340443 77340173 Y PSTPIP1 TSPAN3 NA NA NA NA TSPAN3 33883 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 77351977 77352357 77352309 Y NA TSPAN3 PSTPIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN3 21969 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 77543876 77544254 77544063 Y NA NA NA NA NA NA PEAK1 166232 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 77675113 77675384 77675318 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA PEAK1 35102 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 77923178 77923295 77923290 Y NA NA NA NA NA NA LINGO1 187947 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 78110975 78112297 78111796 Y HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1 NA NA NA NA NA LINGO1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.29952391057686 chr15 78754081 78754185 78754133 Y ACSBG1 IREB2 NA NA NA NA IREB2 26308 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 78953383 78953770 78953429 Y MORF4L1 CHRNA3,RPL18P11 CHRNA5,CHRNB4,LOC729911 IMR90 Hi-C 24141950 RPL18P11 1465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 79216586 79216987 79216944 Y RASGRF1 CTSH NA NA NA NA CTSH 22929 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 79635470 79635474 79635472 Y NA TMED3 NA NA NA NA TMED3 34066 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 81156027 81156230 81156065 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1199 86343 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 81219891 81220152 81220022 Y STARD5 NA NA NA NA NA MESDC2 60067 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 82050341 82050360 82050353 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 286122 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 82203414 82203711 82203543 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 132771 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr15 82340231 82340454 82340397 Y NA MEX3B NA NA NA NA MEX3B 3749 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 83681404 83681605 83681512 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 3011 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 83730539 83730760 83730650 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA BTBD1 3346 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 83761220 83761490 83761347 Y TM6SF1 BTBD1,TM6SF1 BTBD1,MIR4515 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM6SF1 12669 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 83778085 83778410 83778297 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3926 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 83862328 83862648 83862488 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 12122 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 83869144 83869263 83869183 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 5507 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 85566958 85567254 85567106 Y NA PDE8A NA NA NA NA PDE8A 45287 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 86020857 86021180 86020870 Y KLHL25 NA NA NA NA NA AKAP13 99055 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 86111518 86111581 86111550 Y NA NA NA NA NA NA AKAP13 189716 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 86231326 86231343 86231335 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 104918 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 86779203 86779595 86779399 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 442942 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 88877677 88878020 88877849 Y NA NA NA NA NA NA NTRK3 79678 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 89156201 89156887 89156382 Y NA AEN NA NA NA NA AEN 5640 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.83961912846149 chr15 89664635 89664981 89664666 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 12745 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 89672226 89672631 89672291 Y ABHD2 ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 5095 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 90402022 90402269 90402146 Y NA ANPEP,AP3S2 NA NA NA NA AP3S2 33305 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 90418263 90418454 90418325 Y NA AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 17120 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 90950706 90950784 90950761 Y FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 21256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 90951105 90951410 90951208 Y FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 21655 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 90957340 90957730 90957416 Y FES,ZNF710,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 91114363 91114916 91114453 Y UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,IQGAP1 CRTC3 NA NA NA NA CRTC3 43206 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 91541068 91541209 91541180 Y NA RCCD1,PRC1,VPS33B NA NA NA NA PRC1 4209 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 92464513 92465010 92464828 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 69588 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 93121727 93122011 93122001 Y C15orf32 NA NA NA NA NA HMGN1P38 130966 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.2541192345672 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2,MIR3175 NA NA NA NA MIR3175 12413 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA MIR3175 74413 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA RGMA 87773 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 93864881 93865242 93865107 Y NA NA NA NA NA NA RGMA 234448 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 95029258 95029308 95029272 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 256491 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr15 96867848 96868085 96868000 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2-AS1 505 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 96871345 96871608 96871517 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2-AS1 2755 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 96872860 96873000 96872921 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA MIR1469 1490 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA MIR1469 9552 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr15 96884534 96884884 96884709 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA MIR1469 10044 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 96886247 96886633 96886548 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 8833 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 96890448 96891058 96890571 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 4408 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 96898438 96898666 96898552 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 2972 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 96900187 96900329 96900243 Y NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 4721 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.75942869269224 chr15 96900508 96900866 96900583 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 5042 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 96959733 96960000 96959734 Y NA NA LOC145820 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-522B15.3 64267 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 12.6473815081728 chr15 97325630 97326019 97325642 Y SPATA8 NA NA NA NA NA RP11-522B15.3 430164 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 98545444 98546413 98546248 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 84660 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 98957223 98957617 98957414 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2544M6.1 122817 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 98964843 98965105 98964974 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2544M6.1 130437 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 99090927 99091248 99091140 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 99091450 99092159 99091603 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98041 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA PGPEP1L 153022 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 99399333 99399603 99399475 Y NA NA NA NA NA NA PGPEP1L 149421 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA NA NA NA NA NA PGPEP1L 140039 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr15 99450086 99450215 99450157 Y IGF1R NA NA NA NA NA PGPEP1L 98809 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 99559007 99559192 99559062 Y NA PGPEP1L PGPEP1L MCF7 ChIA-PET 22265404 PGPEP1L 9983 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 99856918 99857221 99857070 Y NA NA NA NA NA NA HSP90B2P 61081 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 100216338 100216615 100216373 Y MEF2A,MEF2A NA NA NA NA NA LYSMD4 55151 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 100914283 100914527 100914405 Y ADAMTS17 ADAMTS17 NA NA NA NA ADAMTS17 34073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr15 101462538 101462736 101462613 Y NA ALDH1A3,LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 5118 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 101807515 101807673 101807594 Y NA CHSY1,VIMP,SNRPA1 NA NA NA NA VIMP 8032 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr15 101818299 101818511 101818407 Y NA CHSY1,VIMP,SNRPA1 NA NA NA NA VIMP 2594 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 124533 124922 124605 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 84 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 130955 131250 131103 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 5949 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ,NHLRC4 NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 891857 892147 892002 Y NA NA NA NA NA NA RPUSD1 55460 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 1076512 1076669 1076553 Y RAB40C,RAB40C,RAB40C,RAB40C,RHBDL1,FBXL16,SOX8,BAIAP3,BAIAP3 LMF1,SOX8 NA NA NA NA SOX8 46704 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 1179495 1179558 1179527 Y NA CACNA1H CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8 IMR90 Hi-C 24141950 CACNA1H 21683 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 1210403 1210717 1210625 Y NA CACNA1H NA NA NA NA CACNA1H 9162 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 1349375 1349723 1349678 Y NA UBE2I,BAIAP3 NA NA NA NA UBE2I 3825 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 1696376 1696557 1696439 Y NA IFT140,CRAMP1L,HN1L NA NA NA NA HN1L 29700 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 HS3ST6,NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST6 13288 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 2582505 2583298 2582685 Y RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1 ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA PDPK1 2667 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr16 3013245 3013631 3013382 Y KREMEN2 KREMEN2,PAQR4,PKMYT1 NA NA NA NA KREMEN2 1300 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr16 3207486 3207903 3207712 Y SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 29708 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 3285972 3286117 3286070 Y PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263 ZNF200,ZNF263 NA NA NA NA ZNF200 1751 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr16 3730332 3730635 3730484 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 34963 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 3908512 3908774 3908643 Y NA CREBBP NA NA NA NA CREBBP 19953 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.64445249716339 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr16 4451383 4451509 4451446 Y UBN1,UBN1,MGRN1,GLYR1,CORO7 PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA CORO7 22197 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.52947630163455 chr16 5474398 5474545 5474472 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 328589 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 7167298 7167326 7167312 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1546214 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 8726526 8727136 8726655 Y USP7,C16orf72,METTL22 METTL22,ABAT NA NA NA NA METTL22 12986 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 9147014 9147397 9147240 Y ABAT C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 36108 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 9162231 9162510 9162397 Y NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 20995 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 10563450 10564010 10563797 Y NA NA NA NA NA NA EMP2 108545 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 10596760 10596940 10596850 Y EMP2 NA NA NA NA NA EMP2 75615 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 10710964 10711341 10711185 Y EMP2 EMP2 NA NA NA NA EMP2 38409 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 11012685 11013009 11012730 Y TEKT5,FAM18A,CIITA,CLEC16A DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 21308 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 11397402 11397565 11397484 Y NA SOCS1 CLEC16A,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4,SOCS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS1 49366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 11654480 11655021 11654741 Y ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,LITAF NA NA NA NA NA LITAF 73216 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 11894292 11894377 11894335 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A,RSL1D1 NA NA NA NA ZC3H7A 5169 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 12224376 12224580 12224411 Y NA NA NA NA NA NA SNX29 155782 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 15069619 15069687 15069631 Y PDXDC1 PDXDC1 NA NA NA NA PDXDC1 3171 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 15583408 15583655 15583541 Y NDE1,C16orf45 NA KIAA0430 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf45 57256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 15766344 15766530 15766415 Y C16orf45 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31220 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 15769690 15769796 15769712 Y NA KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 34566 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 17411483 17411608 17411498 Y NA NA NA NA NA NA NOMO3 1087131 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 17684991 17685426 17685261 Y NA NA NA NA NA NA RPS15A 1114279 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 20729381 20729771 20729568 Y LYRM1,DCUN1D3 THUMPD1 NA NA NA NA THUMPD1 21635 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 20908672 20908960 20908809 Y CRYM,LYRM1,DCUN1D3 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 230 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 21295163 21295477 21295440 Y NA CRYM-AS1,CRYM NA NA NA NA CRYM-AS1 14693 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr16 21620302 21620588 21620483 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 13763 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 21656930 21657029 21656972 Y CRYM,METTL9,IGSF6 NA NA NA NA NA METTL9 50391 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 23463654 23463771 23463713 Y NA COG7 NA NA NA NA COG7 1153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 24863023 24863279 24863154 Y NA NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 124007 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 25005690 25005854 25005767 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 19133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 25564339 25564353 25564346 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST4 136994 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 26016185 26016314 26016250 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST4 314838 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 27228652 27228785 27228726 Y NA NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 49330 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 27240450 27240772 27240769 Y NA NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 37343 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 27334573 27334825 27334616 Y NA IL4R NA NA NA NA IL4R 11584 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 27543393 27543748 27543573 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 15486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 27546889 27546978 27546937 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 12256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 27577101 27577365 27577280 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA KIAA0556 17647 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 28871082 28871475 28871117 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1,ATP2A1 NA NA NA NA SH2B1 15161 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr16 29709853 29709969 29709906 Y QPRT SPN,QPRT NA NA NA NA QPRT 37253 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 30482309 30482674 30482424 Y CORO1A,SEPT1,ITGAL DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SEPHS2 26807 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 30579441 30579843 30579693 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689 ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785 NA NA NA NA AC002310.7 1728 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.79421445245183 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr16 30876491 30876606 30876548 Y NA MIR4519,BCL7C NA NA NA NA MIR4519 8038 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr16 33959236 33959284 33959270 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2076157 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 33974683 33974853 33974768 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2091604 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 34441880 34442279 34442062 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2558801 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.56426206139414 chr16 35029860 35030042 35030005 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 3146781 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 46683529 46683842 46683691 Y NA SHCBP1,VPS35,ORC6 NA NA NA NA SHCBP1 29991 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 46776803 46777018 46776928 Y MYLK3 NA ORC6,VPS35 K562 ChIA-PET 22265404 ORC6 55248 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr16 47176557 47176930 47176742 Y NETO2 NETO2 NA NA NA NA NETO2 649 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 48592202 48592453 48592359 Y SIAH1,N4BP1 NA NA NA NA NA N4BP1 59606 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 48631315 48631363 48631339 Y NA N4BP1 NA NA NA NA N4BP1 20696 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 49542422 49542557 49542490 Y ZNF423 NA NA NA NA NA CBLN1 228680 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 49882114 49882389 49882252 Y NA NA NA NA NA NA HEATR3 215463 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 49893175 49893278 49893262 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 204574 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr16 50101332 50101352 50101341 Y NA HEATR3 NA NA NA NA HEATR3 3480 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 50376082 50376389 50376371 Y NA BRD7 NA NA NA NA BRD7 24456 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 50501772 50501939 50501899 Y NA NA NKD1 IMR90 Hi-C 24141950 NKD1 78302 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 2763 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr16 52854151 52854308 52854232 Y NA NA NA NA NA NA RP11-297L17.6 166935 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 53128013 53128430 53128279 Y RBL2 CHD9 NA NA NA NA CHD9 41068 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 53165497 53165808 53165602 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 78552 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 53915459 53915524 53915492 Y NA NA NA NA NA NA FTO 179584 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 54269031 54269378 54269204 Y NA IRX3 NA NA NA NA IRX3 49297 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 56352339 56352494 56352417 Y MT3,CES5A,GNAO1,BBS2 NA NA NA NA NA AMFR 104956 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 57048506 57048777 57048701 Y HERPUD1,NLRC5 NLRC5 NA NA NA NA NLRC5 27109 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 57269711 57269965 57269822 Y NA ARL2BP,PLLP NA NA NA NA ARL2BP 7045 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 57488914 57489209 57489062 Y NA COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4 NA NA NA NA POLR2C 5090 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 9325 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 58299498 58299672 58299601 Y NA CCDC113,GINS3 NA NA NA NA GINS3 27312 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr16 60706684 60707081 60706883 Y NA NA NA NA NA NA GOT2 1940423 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 61921949 61922053 61922001 Y NA NA NA NA NA NA GOT2 3155688 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 62009181 62009277 62009229 Y NA NA NA NA NA NA GOT2 3242920 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 64377838 64377886 64377853 Y NA NA NA NA NA NA BEAN1 2081314 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 66508767 66508904 66508846 Y NA BEAN1 NA NA NA NA BEAN1 49567 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 66709355 66709374 66709366 Y DYNC1LI2 CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 19236 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 66719308 66719396 66719350 Y NA CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 9214 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 66784501 66784840 66784671 Y NA DYNC1LI2 NA NA NA NA DYNC1LI2 800 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 CA7,NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr16 67047765 67048035 67047886 Y FBXL8,CES4A CES4A,CBFB NA NA NA NA CBFB 12984 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 67895003 67895199 67895134 Y TPPP3,CENPT THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1 NA NA NA NA EDC4 9727 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 68113537 68113949 68113713 Y SLC7A6OS,RLTPR,RANBP10,PSMB10,DPEP2,NFATC3 NFATC3 NA NA NA NA NFATC3 2705 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr16 68320188 68320357 68320233 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 22492 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 68418958 68419037 68419019 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-30P 57526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 68544131 68544336 68544235 Y NA ZFP90,RNU4-36P SMPD3,CDH1,PRMT7,CDH3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 17657 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 68794775 68795028 68794920 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 25647 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 69060339 69060481 69060445 Y NA NA NA NA NA NA HAS3 76986 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 69121214 69121414 69121257 Y NA HAS3,CHTF8,CIRH1A HAS3 IMR90 Hi-C 24141950 HAS3 16053 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr16 69345968 69346332 69346034 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 2709 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 69351854 69351929 69351891 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 8595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 69477830 69478460 69477879 Y NA TERF2,CYB5B NA NA NA NA CYB5B 21402 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 69761641 69762033 69761837 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 2787 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.83961912846149 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 70716686 70717066 70716876 Y NA MTSS1L NA NA NA NA MTSS1L 903 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 70771415 70771759 70771684 Y EXOSC6 NA NA NA NA NA MTSS1L 53446 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 71046758 71046771 71046763 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 213694 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 71731364 71731710 71731537 Y NA PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 24894 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 71828659 71828769 71828714 Y NA AP1G1,ATXN1L,IST1 NA NA NA NA AP1G1 12335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 71931018 71931097 71931057 Y DHX38,ATXN1L,KIAA0174 ZNF821 NA NA NA NA ZNF821 3779 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 419434 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 73053285 73053647 73053466 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 37950 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 73090044 73090191 73090091 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 1406 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr16 73558765 73558950 73558947 Y NA NA HP,HPR IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 467168 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 73577859 73577941 73577900 Y NA NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 486262 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 74356396 74356719 74356558 Y NA PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 27723 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 74509119 74509400 74509260 Y NA NA NA NA NA NA RP11-252A24.2 108981 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 74672577 74672957 74672890 Y NA GLG1,RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 25822 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 75034712 75035106 75034867 Y NA ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 2641 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 75283958 75284369 75284078 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 15582 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 75294692 75295061 75294835 Y TERF2IP,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 4890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 77979179 77979195 77979185 Y VAT1L,WWOX NA NA NA NA NA WWOX 152115 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 78325751 78325980 78325865 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 194441 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 80838768 80839127 80839024 Y CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2 CDYL2 NA NA NA NA CDYL2 2542 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 81512608 81512902 81512703 Y PLCG2,CMIP,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 35833 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 81732062 81732263 81732080 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 38439 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 81763852 81764387 81764185 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 6315 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr16 81831224 81831380 81831299 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 60522 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 81855087 81855491 81855343 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 84385 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 81871176 81871311 81871248 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 100474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 83790064 83790448 83790256 Y NA HSBP1 NA NA NA NA HSBP1 49000 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 84424110 84424272 84424217 Y NECAB2 NA NA NA NA NA TAF1C 205441 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 16.2116435695669 chr16 84545075 84545257 84545139 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104426 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 84674948 84675055 84674964 Y KLHL36 COTL1,KLHL36 KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL36 5076 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 84704578 84704887 84704734 Y NA KLHL36,USP10 NA NA NA NA KLHL36 24447 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 85020713 85021068 85020917 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 22073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 85037797 85037883 85037799 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 5258 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.21933347480761 chr16 85268297 85268637 85268360 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 208922 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr16 85397523 85397640 85397583 Y NA NA LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 324039 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 85450092 85450367 85450166 Y NA NA LOC727710,GINS2,KIAA0182,FAM92B,LOC400548,C16orf74 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 271312 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 85591342 85591727 85591695 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 129952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 85600571 85600865 85600718 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 120814 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 85758517 85758802 85758746 Y NA GINS2,C16orf74 GINS2,KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf74 23933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 85906320 85906531 85906426 Y NA IRF8 IRF8,COX4I1,FOXF1,LOC400550,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 23878 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 86532148 86532503 86532334 Y NA FOXF1 NA NA NA NA FOXF1 9630 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 86587305 86587716 86587504 Y NA FOXF1,MTHFSD,FOXC2 NA NA NA NA MTHFSD 464 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 86653031 86653193 86653112 Y NA NA FOXL1,FOXC2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 54174 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 86855510 86855797 86855532 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 256653 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 87072481 87072526 87072504 Y NA NA FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf95 276496 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 87421939 87422407 87422148 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 1341 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 87428114 87428209 87428177 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 4366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 87773499 87773902 87773849 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23696 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 87781357 87781475 87781397 Y C16orf95 KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 16123 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 87811524 87811882 87811665 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13926 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr16 87978906 87979489 87979213 Y ZCCHC14,BANP,BANP BANP CA5A,KLHDC4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 1361 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 87987504 87988357 87987703 Y ZCCHC14,BANP,BANP,BANP BANP NA NA NA NA BANP 6654 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 88082514 88082829 88082672 Y NA NA NA NA NA NA BANP 101664 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 88857121 88857244 88857196 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 7502 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 88860126 88860280 88860179 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA CDT1 7341 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 88955496 88955935 88955760 Y NA TRAPPC2L,GALNS NA NA NA NA GALNS 34118 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 89184955 89185230 89185162 Y CYBA,RNF166,RNF166,CBFA2T3 ACSF3 LINC00304,LOC400558,CDH15 IMR90 Hi-C 24141950 ACSF3 32172 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.82900021221141 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr16 89323118 89323579 89323381 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 41000 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr16 89406185 89406252 89406205 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 124067 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 89423849 89423969 89423923 Y CBFA2T3,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 131000 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 89451016 89451317 89451295 Y CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 103652 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 89474257 89474602 89474526 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 80367 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 89601012 89601134 89601078 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68,CPNE7 NA NA NA NA RPL13 23931 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 89683162 89683271 89683207 Y DPEP1,C16orf55 CPNE7,CHMP1A NA NA NA NA CHMP1A 38982 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 89688213 89688598 89688406 Y NA CPNE7,CHMP1A NA NA NA NA CHMP1A 33655 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr16 89992380 89992810 89992683 Y NA MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA TUBB3 6580 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 12308 12676 12492 Y NA DOC2B NA NA NA NA DOC2B 16751 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 597415 597783 597745 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 25174 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 1107024 1107388 1107281 Y NA ABR ABR,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,YWHAE,LOC100306951,BHLHA9,MYO1C,CRK IMR90 Hi-C 24141950 ABR 22927 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.94397640774026 chr17 1466992 1467380 1467296 Y RILP INPP5K,PITPNA-AS1,PITPNA NA NA NA NA PITPNA 2882 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 1533068 1533815 1533453 Y CRK,INPP5K,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2,RILP NA NA NA NA SLC43A2 2888 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.83961912846149 chr17 1986889 1987344 1987111 Y MNT,SLC43A2,SCARF1,WDR81 OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 31441 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 2040718 2040966 2040824 Y PAFAH1B1,SCARF1,WDR81 NA NA NA NA NA HIC1 85270 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 2078039 2078451 2078156 Y TSR1,HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA HIC1 122591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 2126107 2126815 2126522 Y NA NA NA NA NA NA SRR 77862 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 2166387 2166805 2166676 Y METTL16,SMG6,SMG6 SRR,SMG6 NA NA NA NA SRR 37872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 2241529 2241816 2241651 Y NA SRR,SMG6,SGSM2,TSR1 NA NA NA NA TSR1 2728 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 2291927 2292298 2292113 Y NA MNT NA NA NA NA MNT 10114 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.95459532399033 chr17 2307798 2307958 2307865 Y PAFAH1B1 MNT NA NA NA NA MNT 5386 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 2409124 2409453 2409310 Y NA METTL16 NA NA NA NA METTL16 3732 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 2627139 2627523 2627311 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 132635 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 4065011 4065373 4065306 Y NA ZZEF1,CYB5D2 NA NA NA NA CYB5D2 20549 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 4125491 4125809 4125534 Y NA ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 4204226 4204625 4204419 Y CAMKK1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 38952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 4412786 4412979 4412855 Y NA SPNS2,MYBBP1A NA NA NA NA SPNS2 12653 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 4934963 4935218 4935186 Y NA CAMTA2,INCA1,KIF1C,ZFP3 NA NA NA NA KIF1C 35720 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr17 5245508 5245890 5245691 Y NA NA NA NA NA NA RABEP1 61950 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 6790647 6790875 6790776 Y SLC16A11,DLG4,DLG4 NA NA NA NA NA AC027763.2 122793 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 6821400 6821836 6821600 Y NA NA NA NA NA NA AC027763.2 91832 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 6822767 6822872 6822855 Y NA NA NA NA NA NA AC027763.2 90796 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 6822879 6823265 6823073 Y NA NA NA NA NA NA AC027763.2 90403 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 6851869 6852198 6852047 Y XAF1,GABARAP,RNASEK NA NA NA NA NA AC027763.2 61470 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 6897797 6898308 6898020 Y NA AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13 NA NA NA NA AC027763.2 15360 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 6925152 6925653 6925481 Y PLSCR3,C17orf49,BCL6B AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13 NA NA NA NA MIR497HG 4174 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 7115018 7115437 7115195 Y NA ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1 NA NA NA NA ACADVL 3007 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 7456067 7456382 7456285 Y ACAP1,WRAP53,CD68,CD68,TNFSF12 TNFSF12,TNFSF12-TNFSF13,SENP3,EIF4A1,SNORD10,CD68,MPDU1,AC113189.5 NA NA NA NA TNFSF12-TNFSF13 5651 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.71402401668257 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.18454771504802 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.67923825692298 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.41450010610571 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr17 8268468 8268891 8268818 Y SPDYE4,MFSD6L,CCDC42,CNTROB,ODF4 KRBA2,RPL26,NDEL1 NA NA NA NA KRBA2 9138 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 8391640 8392024 8391937 Y NA NA NA NA NA NA NDEL1 77191 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 8649167 8649702 8649446 Y ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42 NA NA NA NA NA MYH10 117088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 9267283 9267598 9267441 Y NA NA NA NA NA NA STX8 210310 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 9549792 9549873 9549833 Y NA USP43 NA NA NA NA USP43 3777 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 9995282 9995290 9995286 Y MYH4 NA NA NA NA NA RPS27AP1 164789 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 10220640 10220911 10220834 Y GAS7,MYH4 NA NA NA NA NA RPS27AP1 60561 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 15925706 15925935 15925791 Y FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24675 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 16319642 16320463 16320033 Y NA UBB,TRPV2 NA NA NA NA TRPV2 2786 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 16878291 16878630 16878396 Y NA NA NA NA NA NA MPRIP 65229 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 17204544 17204774 17204670 Y NA COPS3 NA NA NA NA NT5M 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 17851403 17851564 17851499 Y NA TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 22172 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 25676124 25676302 25676192 Y LGALS9,WSB1 NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 WSB1 57022 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 25680204 25680481 25680340 Y LGALS9,WSB1 NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61102 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 25816130 25816488 25816250 Y WSB1,LGALS9 KSR1 NA NA NA NA KSR1 34460 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 26552347 26552427 26552387 Y NA NA NA NA NA NA TMEM97 91694 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 26894495 26894823 26894797 Y NA UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5 NA NA NA NA PIGS 2067 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 27072804 27073286 27072989 Y TRAF4 PROCA1,RAB34,RPL23A,NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 3802 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 27118575 27118718 27118697 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 49573 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr17 27129097 27129445 27129306 Y NA NA NA NA NA NA ERAL1 50511 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 27199839 27200032 27199936 Y DHRS13 ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA ERAL1 19883 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 27405810 27406234 27406188 Y NA NA NA NA NA NA SEZ6 74352 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 27473466 27473709 27473569 Y NA MYO18A NA NA NA NA MYO18A 31721 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 27814311 27814661 27814484 Y NA NA NA NA NA NA TP53I13 76409 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr17 27966112 27966641 27966332 Y NA GIT1,CORO6 NA NA NA NA CORO6 18187 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 28108459 28108825 28108642 Y NA NA NA NA NA NA SSH2 146469 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 29115484 29115559 29115508 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CRLF3 34235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 29154156 29154190 29154173 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CTD-2349P21.1 1729 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 29596751 29597032 29596911 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 119610 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 30593810 30594211 30593930 Y NA RHBDL3 NA NA NA NA RHBDL3 2615 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 30846365 30846870 30846526 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 34728 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr17 31072918 31073214 31073077 Y NA NA NA NA NA NA MYO1D 128981 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 31159026 31159151 31159124 Y NA MYO1D NA NA NA NA MYO1D 43044 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 31544174 31544501 31544350 Y NA NA NA NA NA NA TMEM98 291246 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 32349488 32349675 32349661 Y ACCN1 NA NA NA NA NA CCL2 230629 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 32727834 32727990 32727930 Y CCL2,CCL1 NA ACCN1,CCL13,UNC45B IMR90 Hi-C 24141950 CCL2 147530 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 32940308 32940705 32940417 Y TMEM132E NA NA NA NA NA ZNF830 345844 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 34045470 34045815 34045642 Y NA RASL10B RASL10B IMR90 Hi-C 24141950 RASL10B 10853 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.67923825692298 chr17 34871446 34871455 34871448 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 17392 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 35078576 35079010 35078700 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 122575 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 35519679 35519723 35519693 Y NA NA NA NA NA NA AATF 215504 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 35608489 35608691 35608590 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 156218 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 36101828 36102076 36101951 Y DDX52,HNF1B NA NA NA NA NA DDX52 100335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 37542274 37542291 37542284 Y NA FBXL20 NA NA NA NA FBXL20 14485 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 25371 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 38466457 38466702 38466562 Y IKZF3 CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 3013 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 38496652 38496786 38496719 Y MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA RARA NA NA NA NA RARA 33208 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 38601076 38601487 38601191 Y GJD3,IGFBP4 TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 3374 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 38706778 38707153 38707073 Y NA NA NA NA NA NA TNS4 50929 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 38759098 38759390 38759213 Y CCR7 SMARCE1 KRT14,KRT42P,KRT26,KRT28,CCR7,TOP2A,IGFBP4,KRT33A,KRT33B IMR90 Hi-C 24141950 SMARCE1 43370 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 39003172 39003257 39003186 Y KRTAP2-1,KRT10 TMEM99,KRT10 NA NA NA NA KRT10 26325 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 3898 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 40163251 40163440 40163343 Y NA CNP,NKIRAS2,DNAJC7 NA NA NA NA NKIRAS2 1851 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 40539110 40539537 40539349 Y NA STAT3,PTRF NA NA NA NA STAT3 524 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 40671173 40671319 40671240 Y PTRF AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA AC067852.1 417 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 40689876 40689925 40689901 Y NA AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX,PSMC3IP NA NA NA NA NAGLU 3686 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 40805539 40806065 40805782 Y NA TUBG1,FAM134C,TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1 NA NA NA NA TUBG2 3258 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 41198878 41199234 41199056 Y NA IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA RND2 23620 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 41421158 41421352 41421255 Y NA NA NBR1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4D 52975 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 41847666 41848033 41847850 Y NA SOST,DUSP3 NA NA NA NA DUSP3 6323 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 42198947 42199210 42199140 Y NA C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.72464293293265 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 42589268 42589584 42589359 Y C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104 GPATCH8,FZD2 ATXN7L3,GPATCH8 K562 ChIA-PET 22265404 GPATCH8 10470 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 42872286 42872458 42872432 Y FMNL1,GRN ADAM11,GJC1 NA NA NA NA GJC1 33726 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 43249989 43250354 43250021 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM2 13922 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr17 43951029 43951274 43951198 Y NA MAPT NA NA NA NA MAPT 18474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 43993191 43993527 43993444 Y STH,MAPT MAPT NA NA NA NA MAPT 23443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 44113965 44114105 44114069 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 144217 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 44135698 44135955 44135827 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 165950 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 44232468 44232502 44232485 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 262720 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 44234299 44234706 44234578 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 264551 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 44342171 44342447 44342244 Y KIAA1267,KIAA1267 NA MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPT 372423 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr17 44847625 44847956 44847902 Y WNT3 NA NA NA NA NA RPS7P11 50092 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1,TBX21 NA NA NA NA TBX21 37143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr17 45778272 45778788 45778511 Y SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21 TBX21 NA NA NA NA TBX21 29822 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 45796870 45797334 45797030 Y TBKBP1,TBX21 TBX21 NA NA NA NA TBX21 11276 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 45980057 45980402 45980230 Y NA SP6,SP2,AC003665.1,PNPO NA NA NA NA SP2 8541 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 46079914 46080281 46080131 Y NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2 CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 33111 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 46168455 46168716 46168586 Y NA NFE2L1,CBX1,SNX11 NA NA NA NA CBX1 8167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 46583139 46583523 46583310 Y SKAP1 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3 HOXB2,HOXB3,HOXB4,SKAP1,HOXB8,HOXB1,HOXB9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HOXB-AS1 35390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB5 6092 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 47081081 47081234 47081133 Y NA IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 8307 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 35619 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 47425065 47425127 47425096 Y MYST2,ZNF652,ZNF652 RP11-1079K10.3,ZNF652 NA NA NA NA RP11-1079K10.3 11400 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 47942337 47942718 47942546 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613C6.4 71632 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 48288364 48288588 48288396 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 COL1A1 PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 11371 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 49028088 49028439 49028211 Y NA RP11-700H6.1 NA NA NA NA RP11-700H6.1 8014 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 49182545 49182921 49182907 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 13305 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 49301885 49301958 49301926 Y NA MBTD1,UTP18 NA NA NA NA MBTD1 33566 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 49714308 49714449 49714379 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 378419 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 52293847 52293867 52293857 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 460616 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 53171922 53172041 53171982 Y NA NA NA NA NA NA COX11 127776 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF HLF STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLF 24390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 53361426 53361912 53361701 Y MMD,COX11,STXBP4,HLF HLF NA NA NA NA HLF 21053 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 53497797 53498268 53498065 Y NA MMD NA NA NA NA MMD 444 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 54669912 54670125 54669969 Y NA NOG NA NA NA NA NOG 852 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr17 54855339 54855522 54855428 Y TRIM25,SCPEP1 NA NA NA NA NA DGKE 53938 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 55288386 55288469 55288428 Y NA MSI2 MSI2 IMR90 Hi-C 24141950 MSI2 42743 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 55628691 55629280 55629007 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MRPS23 296137 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 55655246 55655454 55655378 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 269963 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 55741402 55741415 55741409 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 184002 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 56161643 56161969 56161895 Y VEZF1,MTMR4 DYNLL2 NA NA NA NA DYNLL2 2867 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 56391648 56391970 56391957 Y NA SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 36484 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 56410599 56410851 56410735 Y RAD51C,SRSF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 17603 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 56587640 56587744 56587729 Y PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 5522 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 56600012 56600151 56600118 Y DYNLL2,OR4D2,SEPT4,SEPT4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 6746 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 56696420 56696582 56696517 Y NA RNU1-60P,RNU1-108P C17orf47,SEPT4 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-60P 38084 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 56701235 56701661 56701522 Y OR4D1,BZRAP1 RNU1-60P,RNU1-108P NA NA NA NA RNU1-60P 33005 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 56744054 56744558 56744332 Y SUPT4H1 RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C NA NA NA NA RNU1-108P 1996 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 57203741 57203833 57203787 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 21459 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 57839956 57840355 57840071 Y RNFT1 NA NA NA NA NA PTRH2 56969 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 57841314 57841767 57841379 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 58327 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA MIR21 55968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 57966021 57966396 57966241 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 1908 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 58220284 58220524 58220391 Y VMP1,USP32,PPM1D,CA4 NA HEATR6,PPM1D,USP32,APPBP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 HEATR6 65992 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 58467674 58467818 58467746 Y BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,APPBP2,USP32 USP32 NA NA NA NA USP32 30013 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 58468371 58468697 58468395 Y BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32 USP32 NA NA NA NA USP32 29134 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 58678620 58678973 58678714 Y PPM1D PPM1D NA NA NA NA PPM1D 3076 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 58804933 58805128 58805031 Y NA NA NA NA NA NA BCAS3 52119 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 58977545 58977928 58977702 Y NA NA NA NA NA NA AC005884.1 167304 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr17 59018495 59018735 59018604 Y NA NA TBX2,C17orf82 IMR90 Hi-C 24141950 AC005884.1 126497 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 59150035 59150103 59150069 Y BCAS3 AC005884.1 NA NA NA NA AC005884.1 4803 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 59213347 59213460 59213422 Y TBX4,TBX2 NA NA NA NA NA AC005884.1 68115 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 59337920 59337981 59337951 Y NA NA NA NA NA NA TBX2 137276 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 59449966 59450070 59450027 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 25187 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 59473431 59474098 59473741 Y TBX2,C17orf82 TBX2 NA NA NA NA TBX2 1159 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 59474585 59474918 59474715 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 339 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr17 59488217 59488528 59488332 Y NA TBX2,TBX4 NA NA NA NA TBX2 12960 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 59532462 59532698 59532510 Y NA TBX4 NA NA NA NA TBX4 4697 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 60555037 60555507 60555099 Y NA RP11-464D20.2 MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-464D20.2 36621 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 60707692 60707749 60707711 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 4930 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 60973132 60973339 60973182 Y TLK2 NA NA NA NA NA MARCH10 89427 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 61299362 61299669 61299468 Y MAP3K3 NA MIR548W,DCAF7,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 222070 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 61451328 61451417 61451341 Y NA NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 70322 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 61456495 61456666 61456581 Y NA NA MIR548W,MARCH10,MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 65073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 61538235 61538385 61538330 Y NA CYB561 CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYB561 16496 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 61796482 61796787 61796636 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 19950 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 62258830 62259200 62259015 Y SCN4A SNORD104 NA NA NA NA SNORD104 37387 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 62487438 62487665 62487534 Y ICAM2 POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 3489 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 63030127 63030512 63030385 Y NA GNA13 AMZ2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 20445 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 63043139 63043174 63043152 Y NA GNA13 NA NA NA NA GNA13 7783 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 63624560 63624814 63624604 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 561388 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 545803 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 64271821 64272172 64271887 Y NA PRKCA PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCA 24582 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 64380133 64380302 64380218 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 83379 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 64714382 64714708 64714545 Y PRKCA NA NA NA NA NA CACNG4 244318 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 64961597 64961937 64961768 Y CACNG4 CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 2571 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 64962057 64962755 64962345 Y NA CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 3031 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 65477756 65478333 65478203 Y HELZ,PSMD12 NA NA NA NA NA PITPNC1 106181 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 65487114 65487504 65487449 Y HELZ,PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA NA PITPNC1 115539 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 65567749 65567899 65567852 Y NOL11 NA NA NA NA NA NOL11 144050 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr17 66380161 66380700 66380381 Y SLC16A6 NA NA NA NA NA WIPI1 70954 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 66419326 66419636 66419592 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 32018 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 66456929 66457226 66456998 Y NA WIPI1,PRKAR1A NA NA NA NA WIPI1 5275 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 66495044 66495250 66495179 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A WIPI1,PRKAR1A PRKAR1A,FAM20A MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRKAR1A 10671 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 67900401 67900565 67900472 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ2 262249 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 68078545 68078943 68078744 Y KCNJ16 NA NA NA NA NA KCNJ2 83871 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 70122851 70122907 70122879 Y NA SOX9 NA NA NA NA SOX9 7690 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 70585200 70585480 70585419 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 35890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 70587266 70587776 70587444 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 33594 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 70664433 70664574 70664507 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 43063 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 70779461 70779663 70779556 Y CPSF4L NA NA NA NA NA RPL32P33 158091 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 70924179 70924389 70924230 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 162462 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 71227425 71227646 71227536 Y NA COG1,C17orf80,FAM104A NA NA NA NA C17orf80 1053 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 71439964 71440055 71440021 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 133650 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 71476918 71477129 71477067 Y NA NA NA NA NA NA SDK2 161099 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 71743861 71743878 71743870 Y NA NA NA NA NA NA SDK2 105633 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 72247418 72247796 72247504 Y NA RPL38,TTYH2 NA NA NA NA TTYH2 39765 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 72596633 72597034 72596924 Y TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD NA NA NA NA NA RAB37 67683 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 73007152 73007476 73007237 Y RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 387 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 73007918 73008254 73008160 Y RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 1153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 73133469 73133809 73133510 Y NA ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2 NA NA NA NA NT5C 7579 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 74134600 74134832 74134764 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1 EXOC7,FOXJ1 NA NA NA NA FOXJ1 548 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 74233896 74234348 74234226 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 106 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 74359249 74359572 74359412 Y RHBDF2,SPHK1,SPHK1 SPHK1,PRPSAP1 PRPSAP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPHK1 11093 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 74415585 74415933 74415760 Y MFSD11,RNF157 SPHK1,PRPSAP1,UBE2O NA NA NA NA UBE2O 31355 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 74593962 74594390 74594127 Y FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,JMJD6 CYGB,ST6GALNAC2 ST6GALNAC2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ST6GALNAC2 12924 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 75134867 75135304 75135067 Y SEC14L1,SEC14L1 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 54069 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 44377 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 75461802 75462176 75461947 Y SEC14L1,SEC14L1 NA NA NA NA NA SEPT9 187151 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 75553117 75553125 75553121 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 278466 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 75871159 75871457 75871308 Y NA RNU1-80P NA NA NA NA RNU1-80P 42723 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 13.7971434634612 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 76643240 76643420 76643373 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA DNAH17,CYTH1 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 132959 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 76767876 76768189 76768026 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 8190 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 76770526 76771358 76771190 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 5021 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 76912078 76912524 76912123 Y CYTH1,CANT1 TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 6945 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 77178498 77178880 77178689 Y NA NA NA NA NA NA ENGASE 109477 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 77178893 77179196 77179046 Y NA NA NA NA NA NA ENGASE 109872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 77702456 77702572 77702532 Y NA CBX2 NA NA NA NA CBX2 47359 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr17 77784894 77785612 77785337 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 11412 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr17 77952311 77952542 77952488 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D16 55105 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 78121490 78121818 78121740 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA EIF4A3 2508 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 78352228 78352499 78352367 Y GAA,RNF213 ENDOV NA NA NA NA ENDOV 34466 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr17 78734428 78734929 78734574 Y C17orf56 NA NA NA NA NA RPTOR 217809 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 78756741 78756888 78756815 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 206510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 78821401 78821639 78821452 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 141759 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 78962835 78962976 78962910 Y NA CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA CHMP6 422 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr17 78992000 78992331 78992033 Y C17orf56 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 14617 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 79128807 79129119 79128972 Y C17orf56 NA NA NA NA NA AZI1 65680 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 79261011 79261270 79261067 Y NA C17orf89,SLC38A10 NA NA NA NA SLC38A10 6077 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 50438 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA SLC38A10 93061 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 79365060 79367456 79365203 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 97713 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 79368790 79369424 79369000 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 101443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 79546845 79547000 79546944 Y PCYT2 C17orf70 NA NA NA NA C17orf70 27858 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 79979263 79979824 79979465 Y NA ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L NA NA NA NA LRRC45 85 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr17 80068913 80069274 80069094 Y NARF,HEXDC,CCDC57 DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 14705 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 80158664 80158910 80158860 Y DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 FASN K562 ChIA-PET 22265404 CCDC57 9796 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr17 80215337 80215590 80215470 Y SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14017 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr18 10894 11221 11019 Y NA NA NA NA NA NA USP14 145162 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 159482 159743 159659 Y CETN1 USP14 NA NA NA NA USP14 3099 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 222573 222827 222703 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 43223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 235900 236290 236249 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 29760 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 781638 782117 782009 Y NA RNU1-109P,YES1 NA NA NA NA RNU1-109P 14019 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 1192820 1193070 1192907 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP72 129016 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 2096653 2096904 2096779 Y NA NA ADCYAP1 IMR90 Hi-C 24141950 METTL4 472604 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 2656589 2657177 2656999 Y NA CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 2852 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 2851086 2851429 2851256 Y EMILIN2 NA LPIN2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN2 159884 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 2972158 2972493 2972361 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,MYL12B,SMCHD1,EMILIN2 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 38820 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 3508912 3509046 3509010 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 99306 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr18 3509218 3509430 3509419 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 99612 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.48407162562488 chr18 3527351 3527432 3527391 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 117745 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 3582686 3583234 3582964 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 173080 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 3661317 3661540 3661407 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 251711 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr18 3665613 3666165 3665884 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 256007 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 5629750 5630120 5629929 Y NA EPB41L3 NA NA NA NA EPB41L3 1051 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L3 266575 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr18 6416928 6417109 6417051 Y L3MBTL4 L3MBTL4,RPL6P27 NA NA NA NA L3MBTL4 3692 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 8412266 8412506 8412385 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 194937 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 9129786 9129925 9129855 Y PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4301 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 9138526 9138911 9138547 Y ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 NA NA NA NA ANKRD12 4300 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 9219810 9220134 9219877 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD12 85584 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr18 9612296 9612535 9612373 Y NA PPP4R1 NA NA NA NA PPP4R1 703 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 9877272 9877635 9877453 Y VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 34364 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 10417323 10417624 10417474 Y NA APCDD1 APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 APCDD1 35001 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 10475783 10476043 10475911 Y NA APCDD1,NAPG NA NA NA NA APCDD1 23158 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 10528233 10528593 10528264 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 4331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 10543130 10543398 10543236 Y NAPG NAPG NA NA NA NA NAPG 19228 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr18 12076743 12076871 12076848 Y NA NA GNAL IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 97719 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 12306995 12307375 12307158 Y CHMP1B TUBB6 NA NA NA NA TUBB6 1327 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 12317654 12318000 12317871 Y CHMP1B TUBB6 NA NA NA NA TUBB6 11986 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 12330841 12331244 12331045 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 25173 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 18512291 18512341 18512327 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 177471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 19090172 19090203 19090178 Y NA NA NA NA NA NA ESCO1 88642 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 19415827 19415836 19415832 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 132909 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 20104385 20104397 20104392 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 271827 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 20139802 20140256 20140003 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 235968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 21091625 21091887 21091629 Y C18orf8 C18orf8 NA NA NA NA C18orf8 10152 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 21417655 21417852 21417722 Y NPC1,LAMA3 NA NA NA NA NA TTC39C 152885 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 21808250 21808465 21808434 Y OSBPL1A NA NA NA NA NA CABYR 91308 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 23609881 23610142 23609962 Y NA NA NA NA NA NA SS18 59039 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 23657156 23657540 23657507 Y NA SS18 NA NA NA NA SS18 11641 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 26231611 26231936 26231774 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 476201 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr18 29897352 29897676 29897515 Y NA NA NA NA NA NA RNF138 227534 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 33275532 33275916 33275719 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 116451 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 34052267 34052344 34052306 Y NA NA NA NA NA NA FHOD3 176590 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 35188178 35188197 35188187 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 781020 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 37151664 37151869 37151793 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 238025 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 44392877 44393138 44393020 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL2 102317 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 45353824 45354074 45353943 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 101441 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 45420480 45420806 45420653 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 34709 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 45454827 45455289 45455128 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 226 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 45534549 45534809 45534718 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 79034 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 46072108 46072320 46072224 Y NA CTIF NA NA NA NA CTIF 8691 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 46184656 46184773 46184715 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 121239 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 46253142 46253362 46253168 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 189725 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 46349762 46350033 46349891 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 286345 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 414813 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 NA SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTIF 438763 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 46946352 46946456 46946404 Y NA DYM NA NA NA NA DYM 39261 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 47216686 47217049 47216797 Y NA NA MYO5B IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 121281 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 47785953 47786324 47786143 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 NA NA NA NA CCDC11 4568 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 47824396 47824519 47824438 Y CCDC11,MBD1,MBD1 CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC1 11722 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 47834061 47834491 47834223 Y CCDC11,MBD1,MBD1 CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21387 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 51675484 51675804 51675634 Y NA NA NA NA NA NA MBD2 73354 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 54487568 54487957 54487622 Y NA NA NA NA NA NA TXNL1 170737 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 55267032 55267261 55267214 Y NEDD4L FECH,NARS NA NA NA NA FECH 15028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 55803829 55804070 55803959 Y NA NA NA NA NA NA SNORD28 461793 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 55881305 55881780 55881408 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 384083 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 55957381 55957780 55957581 Y NA NA NA NA NA NA SNORD28 308083 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 56359373 56359598 56359412 Y NA MALT1 NA NA NA NA MALT1 22755 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 60880346 60881040 60880460 Y SERPINB12,BCL2 NA NA NA NA NA KDSR 151703 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 60979120 60979234 60979125 Y BCL2 NA NA NA NA NA KDSR 53509 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 61085026 61085396 61085214 Y VPS4B VPS4B NA NA NA NA VPS4B 2320 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 61121848 61122109 61121956 Y SERPINB10,SERPINB12,SERPINB5 VPS4B,SERPINB5 NA NA NA NA SERPINB5 19885 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 66131807 66132182 66131996 Y NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 248264 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 66679870 66680014 66679942 Y NA NA NA NA NA NA TMX3 299335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 67683360 67683665 67683513 Y NA NA NA NA NA NA RTTN 187516 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 67815165 67815405 67815286 Y NA NA NA NA NA NA RTTN 55776 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr18 68326255 68326550 68326425 Y RTTN NA NA NA NA NA SOCS6 372118 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 72501282 72501640 72501447 Y NA NA NA NA NA NA ZNF407 238176 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 73628376 73628483 73628456 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 576994 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 120 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr18 74556264 74556608 74556436 Y NA ZNF236 NA NA NA NA ZNF236 23701 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 75149077 75149342 75149210 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 616514 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr18 76756179 76756568 76756439 Y NA SALL3 NA NA NA NA SALL3 17904 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 76828001 76828378 76828185 Y NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 716 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 76831132 76831674 76831321 Y NFATC1,NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 3847 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr18 76884362 76884757 76884560 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 57077 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 77006633 77006788 77006711 Y ATP9B NA NA NA NA NA NFATC1 147068 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 77060474 77060624 77060564 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 93232 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 77153646 77154504 77153944 Y ATP9B,NFATC1,NFATC1 NA NA NA NA NA NFATC1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 77282333 77282684 77282593 Y ATP9B,NFATC1,CTDP1 NA NA NA NA NA NFATC1 128477 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 77682652 77682872 77682762 Y NA PQLC1,HSBP1L1 NA NA NA NA PQLC1 26792 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr18 78004258 78004625 78004566 Y PARD6G PARD6G NA NA NA NA PARD6G 829 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 289700 289869 289784 Y C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 307 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 488227 488667 488380 Y NA SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MADCAM1 1051 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 567332 567750 567473 Y NA CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 1547 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 4137 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 710143 710459 710314 Y GPX4,C2CD4C,PALM RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA PALM 3190 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 1161691 1161983 1161922 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 10299 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 1171027 1171165 1171096 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1117 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 1651371 1651730 1651556 Y NA UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 767 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 1669192 1669298 1669247 Y C19orf26,EFNA2,APC2,TCF3,TCF3 TCF3 TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3 IMR90 Hi-C 24141950 TCF3 18588 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 1725719 1725877 1725796 Y C19orf26,MUM1,APC2 ONECUT3 TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1 IMR90 Hi-C 24141950 ONECUT3 24495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 1942393 1942508 1942451 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3205 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 2167436 2167667 2167594 Y CSNK1G2,GADD45B,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 4972 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 2489253 2489454 2489354 Y BTBD2,MOBKL2A,PLEKHJ1,SF3A2,SGTA,TIMM13 LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 15133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr19 2888802 2889178 2888846 Y NA ZNF555,ZNF57 NA NA NA NA ZNF57 9718 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 2926811 2926963 2926923 Y NA ZNF57,ZNF77,TLE6 NA NA NA NA ZNF77 16006 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 3314117 3314647 3314306 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 42914 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 3360896 3361804 3361247 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 3335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 3405079 3405252 3405203 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 47518 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 3562421 3562565 3562489 Y NA HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 8210 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 3570616 3571018 3570829 Y C19orf28,HMG20B,GIPC3 MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 3671007 3671294 3671202 Y NFIC,MAP2K2,EEF2,PIP5K1C,APBA3 PIP5K1C,TJP3 NA NA NA NA PIP5K1C 27183 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 4089074 4089290 4089084 Y NA ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24131 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 4567148 4567365 4567215 Y TICAM1,SEMA6B PLIN5,LRG1 NA NA NA NA LRG1 28662 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 4636294 4636441 4636384 Y ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 1089 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 4912030 4912419 4912247 Y NA PLIN3,UHRF1 NA NA NA NA UHRF1 10938 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 5091674 5091892 5091780 Y NA NA NA NA NA NA KDM4B 124549 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 5336072 5336705 5336347 Y PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 2109 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 5804044 5804378 5804211 Y NA DUS3L NDUFA11,DUS3L,NRTN,LONP1,CATSPERD,RANBP3,LOC100128568,FUT6,VMAC,PRR22,FUT3,RFX2,FUT5,CAPS K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DUS3L 14795 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 5968077 5968307 5968208 Y NA RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7846 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 5989815 5989915 5989890 Y SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 13662 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 6105811 6106211 6106011 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 91372 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 6189136 6189412 6189274 Y NA RFX2 NA NA NA NA RFX2 8171 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 6516969 6517178 6517079 Y NA TUBB4A,TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 11832 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 6556475 6556744 6556665 Y RFX2,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14 TNFSF9,CD70 NA NA NA NA TNFSF9 27465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 7197339 7197547 7197388 Y NA NA NA NA NA NA INSR 94498 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr19 9402141 9402360 9402251 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 30088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 9517572 9518021 9517955 Y NA ZNF266 NA NA NA NA ZNF266 26233 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 9974094 9974487 9974263 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA PIN1 30161 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 10352370 10352740 10352555 Y KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1 S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM5 MRPL4,ICAM1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL4 7837 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 10526573 10526793 10526623 Y ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 14359 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 10713789 10714290 10714179 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,C19orf38,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2 KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3 NA NA NA NA SLC44A2 2656 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 10766466 10766790 10766534 Y NA ILF3,QTRT1 NA NA NA NA ILF3 3529 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 11484314 11484469 11484411 Y ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4 CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR NA NA NA NA SWSAP1 953 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 11675625 11675958 11675811 Y CCDC159,ACP5,ACP5 CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 7436 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 11878639 11879058 11878901 Y NA ZNF823,ZNF441,ZNF491,ZNF440 NA NA NA NA ZNF441 2824 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 12131760 12131812 12131786 Y NA CTD-2006C1.2,ZNF433,ZNF878,ZNF844 NA NA NA NA ZNF433 12744 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 12844296 12844608 12844453 Y NA FBXW9,SNORD41,TNPO2,C19orf43,ASNA1 NA NA NA NA C19orf43 707 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 13094405 13094796 13094616 Y ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5 CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX NA NA NA NA NFIX 9626 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 13129050 13129163 13129107 Y MAST1,NFIX,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 24628 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.4492858658653 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 14320325 14320686 14320360 Y NA LPHN1 NA NA NA NA LPHN1 5326 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 14404408 14404769 14404597 Y NA NA NA NA NA NA CD97 84544 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 14474119 14474280 14474154 Y ZNF333,RFX1,PKN1,CD97 CD97 CD97,DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 15033 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr19 14528800 14529217 14529142 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A CD97,DDX39A,PKN1 NA NA NA NA DDX39A 608 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr19 15333627 15333747 15333631 Y SYDE1,NOTCH3 NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 23835 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.52947630163455 chr19 15492858 15492952 15492905 Y NA AKAP8,AKAP8L NA NA NA NA AKAP8 4249 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 15666666 15666804 15666739 Y NA NA NA NA NA NA WIZ 107904 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F11 95558 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr19 15974006 15974442 15974280 Y NA NA NA NA NA NA CYP4F11 69235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D TPM4,RAB8A NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 16462018 16462188 16462137 Y CIB3 KLF2 NA NA NA NA KLF2 28390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 16480475 16480862 16480751 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 46847 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 17124642 17124654 17124646 Y NA CPAMD8 NA NA NA NA CPAMD8 10971 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 17176287 17176664 17176476 Y MYO9B CPAMD8,HAUS8,MYO9B NA NA NA NA HAUS8 7771 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 17190539 17191239 17190954 Y HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 5948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 17218539 17219391 17218963 Y MED26,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 33948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 17224246 17224646 17224434 Y MED26,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 39655 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 17345747 17345835 17345791 Y NA USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1 NA NA NA NA NR2F6 8914 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr19 18588665 18588964 18588926 Y NA ISYNA1,ELL NA NA NA NA ISYNA1 41554 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 18810961 18811220 18811091 Y NA CRTC1 NA NA NA NA CRTC1 18474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 19027750 19028071 19027900 Y MAU2 GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3 NA NA NA NA COPE 135 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 19623798 19624201 19624001 Y NA NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 344 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 19705357 19705479 19705434 Y NA PBX4,LPAR2,GMIP NA NA NA NA PBX4 22246 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 19977247 19977754 19977315 Y PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253 ZNF506,ZNF253,ZNF93 NA NA NA NA ZNF253 2552 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 20128543 20128860 20128736 Y NA ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 19455 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 20162886 20163252 20163139 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF682,ZNF90,AC006539.2 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 14571 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 20337633 20337845 20337749 Y ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486 NA NA NA NA NA ZNF486 61596 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 20606211 20606644 20606560 Y ZNF90 ZNF826P NA NA NA NA ZNF826P 436 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 21617862 21618096 21617867 Y NA ZNF493 NA NA NA NA ZNF493 39941 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 21678211 21678382 21678297 Y ZNF430,ZNF100,ZNF429 ZNF429 NA NA NA NA ZNF429 727 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 21689202 21689645 21689487 Y ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429 ZNF429 NA NA NA NA ZNF429 11718 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 21976448 21976744 21976704 Y NA ZNF100 NA NA NA NA ZNF100 28018 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 22715195 22715609 22715437 Y NA ZNF98 NA NA NA NA ZNF98 1908 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 7.47345270937481 chr19 23309445 23309479 23309469 Y NA NA NA NA NA NA ZNF730 53433 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 23971294 23971621 23971458 Y NA ZNF681,RPSAP58 NA NA NA NA RPSAP58 27487 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 28241688 28242434 28242171 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1460014 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 28248561 28250861 28250165 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1451587 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 29093592 29093747 29093670 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 608701 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 29096561 29096764 29096663 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 605684 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 29109267 29109431 29109349 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 593017 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 29210558 29210810 29210684 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 491638 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 29702850 29703471 29703365 Y NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 402 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 29958744 29959023 29958884 Y NA NA NA NA NA NA VSTM2B 56383 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 30207596 30207744 30207670 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 3232 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr19 32021641 32022032 32021837 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ3 183188 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 33664629 33664677 33664651 Y NA LRP3 NA NA NA NA LRP3 1832 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3,SLC7A10 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.72464293293265 chr19 34724001 34724111 34724046 Y NA KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 19331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr19 34874880 34875495 34875019 Y NA GPI,PDCD2L,UBA2 NA NA NA NA PDCD2L 17794 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 34992713 34992833 34992773 Y NA WTIP NA NA NA NA WTIP 22839 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 35491833 35492367 35492256 Y FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A ZNF792,GRAMD1A,SCN1B NA NA NA NA GRAMD1A 8145 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 35701711 35701918 35701833 Y ZNF792,FXYD5,FXYD5,FXYD5,FFAR3 LSR NA NA NA NA LSR 35315 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 35812312 35812429 35812332 Y HPN,LGI4,USF2,MAG,FFAR2,U2AF1L4,FFAR3,FFAR1 CD22 NA NA NA NA CD22 4148 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 35821239 35821740 35821574 Y USF2,ZBTB32,CD22 CD22 NA NA NA NA CD22 13075 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 UPK1A-AS1,IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 UPK1A-AS1 31058 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr19 36863070 36863255 36863179 Y NA LINC00665,ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 4846 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 36882143 36882391 36882267 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 14042 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 37262228 37262609 37262419 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 501 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 37322216 37322466 37322299 Y ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345 ZNF345,ZNF790 NA NA NA NA ZNF345 16797 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 37424676 37424848 37424761 Y ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568 ZNF829,ZNF568 NA NA NA NA ZNF568 19445 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.10435727927877 chr19 37822125 37822150 37822138 Y NA HKR1,ZNF527 NA NA NA NA HKR1 20386 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 37942009 37942313 37942161 Y ZNF420,ZNF585B,ZNF527,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF571,ZNF540,ZNF540,ZFP30,ZNF793,ZNF570,ZNF569 ZNF570,ZNF569 NA NA NA NA ZNF570 14174 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 38717073 38717581 38717079 Y NA DPF1,SPINT2,PPP1R14A NA NA NA NA DPF1 773 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 38807798 38808031 38807971 Y MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA KCNK6 453 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 39150238 39150530 39150365 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 13949 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 39411140 39411539 39411467 Y LGALS7 NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2 NA NA NA NA MRPS12 7649 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr19 39621407 39621638 39621523 Y NA PAK4 NA NA NA NA PAK4 6997 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 39627416 39627544 39627474 Y NA PAK4 NA NA NA NA PAK4 13006 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 40043031 40043289 40043135 Y PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,EID2 EID2B,EID2 DLL3,EID2,LGALS17A IMR90 Hi-C 24141950 EID2 14161 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr19 40849279 40849406 40849342 Y NA PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 2957 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA PRX 5826 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr19 41014841 41015014 41014895 Y MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4 BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SPTBN4 44693 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 41037324 41037469 41037389 Y ZNF780B,MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4 SHKBP1 NA NA NA NA SHKBP1 43288 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 41108162 41108528 41108432 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 11373 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 41169097 41169273 41169245 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 25604 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 41267029 41267391 41267210 Y NA ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA MIA 8162 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 41304071 41304255 41304136 Y SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1 SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA EGLN2 1170 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 41680959 41681276 41681150 Y NA RPL36P16,CYP2S1,AXL CYP2A13,CYP2B7P1,HNRNPUL1,AXL,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 RPL36P16 7193 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 41802534 41802970 41802553 Y B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 11124 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 42419916 42420316 42420067 Y ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA ARHGEF1 34688 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 42432096 42432209 42432128 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 29333 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 42444277 42444712 42444407 Y POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16830 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 42444727 42445027 42444981 Y NA RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16515 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr19 42756723 42757090 42756966 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 219 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr19 42784087 42784212 42784170 Y CEACAM8,CEACAM3,DEDD2 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13398 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr19 42924318 42924497 42924408 Y NA NA NA NA NA NA MEGF8 96557 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 44616064 44616441 44616271 Y KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284 ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234 NA NA NA NA ZNF225 1730 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 44825986 44826083 44826035 Y ZNF221,ZNF284,ZNF285,ZNF233,ZNF233 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 18787 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 45584780 45584791 45584786 Y CEACAM16,NKPD1 CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA MARK4 4234 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 45931993 45932316 45932152 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1 NA NA NA NA CD3EAP 24526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr19 45954905 45955186 45955133 Y GIPR,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,BLOC1S3,PPM1N,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB IMR90 Hi-C 24141950 FOSB 14067 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 46665382 46665717 46665592 Y NA NA NA NA NA NA CCDC61 169043 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 46683956 46684315 46684191 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 163936 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 46708652 46708841 46708747 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 139410 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 46905606 46905628 46905621 Y NA CCDC8 NA NA NA NA CCDC8 9213 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 46907328 46907649 46907570 Y NA CCDC8 NA NA NA NA CCDC8 7192 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3,DACT3 NA NA NA NA DACT3 19419 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr19 47458912 47459233 47458939 Y ZC3H4,CCDC9 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS1 61844 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 47610820 47611121 47611012 Y NA SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 3410 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 47613231 47613789 47613256 Y PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 742 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 47662714 47662828 47662771 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA ZC3H4 47705 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 47742856 47743228 47743000 Y NA MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA BBC3 8833 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr19 47744387 47744529 47744512 Y SLC8A2 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA BBC3 10364 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr19 47867147 47867265 47867191 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 16609 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 48076356 48076760 48076653 Y SLC8A2,ZNF541 NA GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541 IMR90 Hi-C 24141950 NAPA 59859 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 48222362 48222481 48222377 Y SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2 EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 7762 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 48629286 48629473 48629353 Y NA PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA PLA2G4C 17212 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 48903450 48903602 48903513 Y NA TMEM143,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10640 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr19 49315464 49315783 49315738 Y NA BCAT2,HSD17B14 NA NA NA NA BCAT2 3178 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 49577003 49577438 49577313 Y SULT2B1,MAMSTR,KCNA7 SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3 NA NA NA NA SNRNP70 9238 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 50833837 50834367 50834143 Y MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3 NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA KCNC3 405 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1,SPIB NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 17659 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 51012062 51012382 51012222 Y KLK6,SYT3,SHANK1 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 228 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2,LRRC4B NA NA NA NA LRRC4B 9014 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr19 51111018 51111676 51111369 Y NA LRRC4B,C19orf81 NA NA NA NA C19orf81 39026 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 51151399 51151595 51151466 Y KLK4,KLK14,KCNC3,ACPT,SYT3,LOC342918 C19orf81 NA NA NA NA C19orf81 697 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 51198423 51198838 51198828 Y KLK6,KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1 C19orf81,SHANK1,CLEC11A NA NA NA NA SHANK1 21869 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 51971340 51971606 51971413 Y ZNF613,SIGLEC7,CD33,ZNF649,ZNF175,SIGLEC6,SIGLEC8,SIGLEC12,SIGLEC12 NA NA NA NA NA ZNF175 100945 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr19 52227755 52228377 52227966 Y HAS1 NA NA NA NA NA ZNF175 155204 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 52229316 52229816 52229631 Y HAS1 NA NA NA NA NA ZNF175 156765 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 52274579 52275152 52274785 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR2 NA NA NA NA NA ZNF613 153248 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 52674093 52674226 52674127 Y ZNF836 ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF836 1197 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 53660263 53660559 53660411 Y NA ZNF415,ZNF665 NA NA NA NA ZNF347 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr19 54116077 54116235 54116154 Y NA NA DPRX IMR90 Hi-C 24141950 ZNF813 147088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 54373735 54373974 54373935 Y VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM MYADM,AC008753.6,PRKCG,CACNG7 NA NA NA NA AC008753.6 3374 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 55038222 55038527 55038355 Y NA NA KIR3DX1 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP5 55811 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 55909655 55909755 55909754 Y PPP1R12C,TMEM150B TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 7390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 55988531 55988605 55988568 Y NAT14 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA ZNF628 2832 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 56097081 56097467 56097273 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 6870 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr19 56098668 56099098 56098905 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 8457 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 56789143 56789486 56789342 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 87982 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 56807694 56808027 56807709 Y NLRP13,ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZNF542 69441 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 56811653 56811926 56811777 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 65542 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 57020241 57020583 57020445 Y ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28 ZNF667-AS1,ZNF667,ZNF471 NA NA NA NA ZNF471 3029 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 57349423 57349757 57349684 Y ZNF543,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZNF470,ZNF71,LOC147670,ZNF835,ZIM2,PEG3 PEG3,ZIM2 NA NA NA NA PEG3 339 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 57351144 57351414 57351350 Y ZNF543,AURKC,AURKC,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZFP28,ZNF470,LOC147670,ZNF835,PEG3,ZIM2,PEG3 PEG3,ZIM2 NA NA NA NA ZIM2 1047 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr19 57976528 57976751 57976646 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 10187 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 58217187 58217439 58217313 Y NA ZNF551,ZNF154,ZNF671,ZNF776 NA NA NA NA ZNF154 1140 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr19 58321012 58321020 58321017 Y VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 3261 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 58398826 58399093 58399050 Y ZNF548,ZNF772,ZNF549,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZSCAN1,ZNF606,ZNF329,ZNF256,ZNF135,ZNF418 ZNF587,ZNF417,ZNF418 NA NA NA NA ZNF417 26885 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF417,ZNF418,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 58415823 58415990 58415970 Y NA ZNF417,ZNF418,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 9988 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135 NA NA NA NA ZNF135 10951 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 58781089 58781297 58781193 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 ZNF8 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF8 7021 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 58911739 58912056 58911822 Y NA A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 868 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.10435727927877 chr19 59049687 59049971 59049795 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA ZBTB45 1409 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 59050036 59050316 59050176 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA ZBTB45 1758 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr19 59078228 59078288 59078258 Y CHMP2A,CHMP2A ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA CENPBD1P1 4582 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr19 59087419 59087864 59087514 Y NA ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA MZF1 4477 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr2 739928 740199 740059 Y NA NA TMEM18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM18 64489 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 1659182 1659769 1659438 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 86855 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 2468009 2468259 2468065 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 721385 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr2 3198841 3199068 3198933 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 180585 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 3508183 3508316 3508315 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 13191 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 7081985 7082191 7081999 Y NA RNF144A NA NA NA NA RNF144A 26462 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 7100927 7101152 7100993 Y NA RNF144A NA NA NA NA RNF144A 45404 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 7191649 7191931 7191786 Y RNF144A NA NA NA NA NA RNF144A 136126 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 8227210 8227486 8227386 Y NA NA NA NA NA NA ID2 589489 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 8816590 8817048 8816915 Y NA AC011747.7 NA NA NA NA ID2 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 9142736 9142998 9142867 Y NA MBOAT2 NA NA NA NA MBOAT2 794 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 9641378 9641587 9641543 Y NA IAH1 NA NA NA NA IAH1 29591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 10330449 10330626 10330557 Y NA NA NA NA NA NA RRM2 69994 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 10721200 10721506 10721353 Y NA NA NA NA NA NA NOL10 106595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 AC062028.1,PQLC3 NA NA NA NA AC062028.1 705 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr2 11343595 11343995 11343855 Y E2F6 NA NA NA NA NA PQLC3 50271 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 11531800 11532088 11531893 Y NTSR2,KCNF1,C2orf50 ROCK2 ROCK2,PDIA6,PQLC3,KCNF1,FLJ33534,C2orf50,GREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 45344 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 11670828 11671487 11671198 Y NA NA NA NA NA NA E2F6 66531 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 68329 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 12291470 12291837 12291654 Y NA NA TRIB2,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 475749 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 15309828 15310293 15310034 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 389161 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 15629690 15629929 15629800 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 69525 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 15700375 15700622 15700454 Y DDX1,NBAS NBAS,DDX1 NA NA NA NA NBAS 921 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 16149011 16149377 16149168 Y NBAS NA NA NA NA NA RP11-120J4.1 140948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 16575995 16576348 16576051 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 269251 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 16576517 16576693 16576605 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 268906 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 19548078 19548301 19548191 Y NA OSR1 NA NA NA NA OSR1 8113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 20176136 20176469 20176303 Y WDR35 WDR35 NA NA NA NA WDR35 11423 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 20491517 20491908 20491876 Y NA NA SDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 58087 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 20544740 20544866 20544805 Y NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 5129 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 20811186 20811439 20811262 Y NA HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 37410 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 22707603 22708000 22707760 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 898088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 23412802 23412834 23412819 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 193254 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 23840114 23840588 23840464 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 234026 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 24234264 24234694 24234378 Y MFSD2B C2orf44,FKBP1B NA NA NA NA C2orf44 35751 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA RPL36AP13 63439 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 24491972 24492409 24492370 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP13 62972 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 24626364 24626604 24626483 Y NA ITSN2 CENPO,ADCY3,NCOA1,ITSN2,LOC375190,C2orf84,PTRHD1,EFR3B,DNAJC27,DNAJC27-AS1,POMC IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 44781 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 131763 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 24859370 24859696 24859496 Y NA NA NA NA NA NA CENPO 154309 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 25352140 25352468 25352150 Y DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A NA NA NA NA NA EFR3B 89141 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 25438901 25439135 25438983 Y PTRHD1,ADCY3 NA NA NA NA NA DNMT3A 124324 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 25545894 25546051 25546003 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 17408 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 25789731 25789834 25789815 Y RAB10 NA NA NA NA NA DTNB 104669 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 26184450 26184595 26184522 Y NA KIF3C,UQCRHP2 NA NA NA NA KIF3C 19023 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 26605539 26605826 26605756 Y RAB10 GPR113 NA NA NA NA GPR113 37854 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 27072078 27072262 27072179 Y UCN,CCDC164,OTOF,MAPRE3,DPYSL5 DPYSL5 NA NA NA NA DPYSL5 3463 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 27072631 27072808 27072721 Y CCDC164,MAPRE3,DPYSL5 DPYSL5 NA NA NA NA DPYSL5 4016 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 27557346 27557529 27557503 Y DPYSL5,C2orf16 MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513 NA NA NA NA MPV17 10799 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 27674321 27674677 27674499 Y NA PPM1G,NRBP1,IFT172,FNDC4 NA NA NA NA NRBP1 25664 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA AC074091.13,MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC074091.13 21721 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 28319174 28319559 28319300 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 207209 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 28400759 28401210 28400868 Y RBKS,BRE,BRE,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 212105 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 28838669 28838944 28838799 Y TRMT61B NA NA NA NA NA PPP1CB 133562 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA NA WDR43 57821 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 29349196 29349466 29349333 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 30625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 30440662 30440911 30440739 Y NA LBH LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 11486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 30788740 30788786 30788763 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 120648 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 33863068 33863290 33863179 Y NA FAM98A NA NA NA NA FAM98A 40619 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 36603527 36603925 36603600 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 22458 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 37383262 37383336 37383288 Y NA EIF2AK2 NA NA NA NA EIF2AK2 1054 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 37763005 37763322 37763129 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193288 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 37993289 37993401 37993340 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 29678 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 38118990 38119149 38119073 Y NA NA CDC42EP3,QPCT,PRKD3,FAM82A1 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 155379 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 38552581 38552739 38552658 Y NA ATL2 NA NA NA NA ATL2 49688 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 38571888 38572175 38572032 Y FAM82A1,ATL2 ATL2 NA NA NA NA ATL2 30252 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 39063059 39063487 39063392 Y NA DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 37588 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 39078847 39079086 39078967 Y NA DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21989 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 40728878 40729055 40728967 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 107138 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 40958599 40958755 40958677 Y NA NA LOC100128590,SLC8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 122406 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 42354917 42355159 42355039 Y EML4 EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 39331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 42481657 42481775 42481735 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 87167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 19491 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr2 43038629 43038924 43038876 Y NA HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 20896 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr2 43361604 43361811 43361729 Y OXER1,ZFP36L2,THADA,THADA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 89937 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 44007303 44007575 44007439 Y NA DYNC2LI1 NA NA NA NA DYNC2LI1 8125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 44542790 44543096 44543052 Y SLC3A1 PREPL,CAMKMT NA NA NA NA PREPL 43905 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 44577605 44577885 44577745 Y NA PREPL,CAMKMT NA NA NA NA PREPL 9116 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 45161073 45161475 45161220 Y SIX3 RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 2863 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr2 45164818 45165169 45165126 Y NA RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 480 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr2 45176497 45176546 45176522 Y NA RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1,AC012354.8 NA NA NA NA SIX3-AS1 9485 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 45177079 45177275 45177123 Y NA RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1,AC012354.8 NA NA NA NA SIX3-AS1 10067 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 45237112 45237533 45237325 Y SIX2 AC012354.8 NA NA NA NA AC012354.8 15560 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 45486924 45487080 45487002 Y NA NA NA NA NA NA AC012354.8 265372 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 46614603 46614745 46614671 Y RHOQ NA NA NA NA NA EPAS1 95797 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 46857387 46857788 46857588 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA PIGF 15129 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 47100841 47101015 47100907 Y NA TTC7A NA NA NA NA TTC7A 40281 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 47206692 47207332 47207009 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 39698 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 47214273 47214540 47214407 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 47279 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 47298687 47298930 47298712 Y TTC7A,MCFD2 NA NA NA NA NA CALM2 102810 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 48416951 48417276 48417215 Y FOXN2 NA NA NA NA NA FOXN2 122500 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 48709527 48709805 48709665 Y FOXN2,KLRAQ1 PPP1R21,STON1 NA NA NA NA PPP1R21 43790 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 53966054 53966447 53966241 Y PSME4 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA CHAC2 26482 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 54196339 54196842 54196524 Y ASB3,ASB3,PSME4 ACYP2,PSME4 NA NA NA NA PSME4 362 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 54221958 54222266 54222094 Y ASB3,ASB3,PSME4 ACYP2,PSME4 SPTBN1,PSME4 IMR90 Hi-C 24141950 PSME4 25981 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 54682152 54682577 54682442 Y NA SPTBN1 NA NA NA NA SPTBN1 730 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 54714209 54714329 54714214 Y NA SPTBN1 NA NA NA NA SPTBN1 32787 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 55552986 55553278 55553132 Y NA NA NA NA NA NA MTIF2 58503 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 55558772 55559057 55558882 Y NA NA NA NA NA NA MTIF2 64289 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 56239449 56239594 56239531 Y EFEMP1 NA PNPT1,EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 EFEMP1 90175 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 58002154 58002414 58002211 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 130372 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 58266393 58266527 58266430 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 133607 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 59983827 59983888 59983858 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 625852 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 60779041 60779656 60779263 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 339 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 61165363 61165465 61165452 Y NA RNU4-51P NA NA NA NA RNU4-51P 28925 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 61428317 61428371 61428344 Y USP34,AHSA2 AHSA2 NA NA NA NA AHSA2 25764 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 61464355 61464721 61464539 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 61802 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 61466894 61467158 61467026 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 64341 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 61586795 61586939 61586907 Y AHSA2,USP34 NA NA NA NA NA USP34 108965 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 61698926 61699282 61699220 Y PUS10,AHSA2,USP34 USP34 NA NA NA NA USP34 3022 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr2 61748471 61748954 61748828 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 14807 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 61766465 61766637 61766569 Y AHSA2,USP34 XPO1 NA NA NA NA XPO1 2704 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 5.0589526032691 chr2 62424513 62424632 62424578 Y B3GNT2 B3GNT2 NA NA NA NA B3GNT2 3265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 63991794 63992008 63991901 Y NA NA UGP2 IMR90 Hi-C 24141950 WDPCP 60969 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 64245195 64245602 64245370 Y NA VPS54 NA NA NA NA VPS54 989 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 64342969 64343339 64343172 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 25034 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 64352533 64352773 64352693 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 15600 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 64367846 64368162 64368149 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 211 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 64443457 64443626 64443536 Y NA NA PELI1,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 73869 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 64821728 64822106 64821796 Y SLC1A4,PELI1 NA NA NA NA NA AFTPH 72263 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 64836549 64836646 64836605 Y SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH NA NA NA NA NA AFTPH 87084 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr2 64957479 64957902 64957679 Y NA SERTAD2 SERTAD2,AFTPH,LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 18237 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 65085914 65086269 65086077 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 109775 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 66054995 66055115 66055055 Y NA NA NA NA NA NA SPRED2 397224 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr2 67663503 67663666 67663540 Y NA ETAA1 C1D,MEIS1,ETAA1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 41052 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 68428934 68429266 68429100 Y NA WDR92,PNO1 NA NA NA NA PNO1 45958 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 68544914 68545935 68545552 Y CNRIP1 NA NA NA NA NA CNRIP1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 69424670 69425029 69424849 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 186360 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 69533941 69534050 69534019 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 78332 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 70141198 70141461 70141241 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 18378 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 70154281 70154743 70154417 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 31461 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 70230474 70230514 70230493 Y NA ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 43077 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 70346022 70346119 70346054 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 18339 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 35376 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 71022127 71022451 71022314 Y FIGLA ADD2 NA NA NA NA ADD2 28770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 72713565 72713630 72713598 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 337540 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 74237302 74237493 74237398 Y NA AC073046.25,TET3 DGUOK IMR90 Hi-C 24141950 TET3 9462 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 74446656 74447054 74446868 Y NA MOB1A,MTHFD2 NA NA NA NA MTHFD2 22967 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 74647656 74647929 74647851 Y SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81 DCTN1,C2orf81,WDR54,INO80B,WBP1,MOGS NA NA NA NA WDR54 851 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 74765672 74765911 74765792 Y WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1 PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA DOK1 8242 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 74766124 74766334 74766228 Y NA PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA DOK1 7819 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 74811573 74811810 74811692 Y NA DOK1,LOXL3 DOK1,LOXL3 IMR90 Hi-C 24141950 LOXL3 30756 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 75090921 75091085 75091029 Y NA HK2 NA NA NA NA HK2 31813 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 75836166 75836348 75836343 Y NA MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 35561 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 75903279 75903482 75903481 Y C2orf3,C2orf3 MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 31370 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 75912574 75912759 75912685 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA GCFC2 23356 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 78386991 78387304 78387148 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 373483 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 78401270 78401306 78401289 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 387762 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 80009885 80010107 80009996 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA2 599528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 84260622 84260661 84260642 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG1 424508 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 85151844 85152193 85152004 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 21095 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 85404303 85404456 85404381 Y NA TCF7L1 NA NA NA NA TCF7L1 45770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 85492413 85492544 85492479 Y SH2D6 NA NA NA NA NA TGOLN2 61004 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP5 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 85887180 85887589 85887391 Y SH2D6,SFTPB C2orf68 NA NA NA NA C2orf68 49991 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 86129642 86129982 86129887 Y NA ST3GAL5 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 15505 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 86284876 86285205 86285126 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 46073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 86388217 86388607 86388413 Y NA IMMT,MRPL35 NA NA NA NA IMMT 32286 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 86692253 86692485 86692369 Y NA KDM3A NA NA NA NA KDM3A 26483 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 89152553 89152811 89152648 Y EIF2AK3 NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 89229 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 91759872 91760090 91759934 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2696548 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2752348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 96348390 96348623 96348461 Y NA NA NA NA NA NA FAHD2A 281921 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 97012594 97012961 97012778 Y ASTL SNRNP200,ITPRIPL1,NCAPH NA NA NA NA NCAPH 13069 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 97206009 97206227 97206118 Y NA ARID5A NA NA NA NA ARID5A 5529 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 97291626 97292008 97291852 Y NA KANSL3 NA NA NA NA KANSL3 14516 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr2 97472369 97472711 97472456 Y ANKRD36,ARID5A,KIAA1310,CNNM3 CNNM4,CNNM3,ANKRD23,ANKRD39 CNNM3 IMR90 Hi-C 24141950 CNNM3 7271 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 98367978 98368166 98368128 Y TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA RNU4-8P 88784 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 98389575 98389609 98389594 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-8P 110381 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-8P 164017 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 98465985 98466159 98466067 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 144229 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 98485830 98486136 98485916 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 124252 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA VWA3B 121353 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 99064911 99065194 99064955 Y MGAT4A,MGAT4A,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 5594 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 99081402 99081780 99081544 Y TMEM131,UNC50,MGAT4A,INPP4A INPP4A UNC50,COA5 IMR90 Hi-C 24141950 INPP4A 22085 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 99173119 99173416 99173284 Y INPP4A COA5,UNC50 UNC50,COA5 IMR90 Hi-C 24141950 COA5 49562 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 99213145 99213306 99213215 Y INPP4A COA5,UNC50 NA NA NA NA COA5 9672 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 99723014 99723348 99723222 Y TSGA10 C2orf15,LIPT1,TSGA10 NA NA NA NA C2orf15 32600 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 100036640 100036800 100036773 Y NA NA NA NA NA NA REV1 67697 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 100082054 100082282 100082201 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 22215 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 100323852 100324185 100324151 Y NA NA NA NA NA NA REV1 219355 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 101204642 101204822 101204740 Y RPL31 PDCL3 NA NA NA NA PDCL3 27490 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 101790359 101790618 101790446 Y RNF149 NA TBC1D8,RPL31 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D8 76710 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 101944860 101945306 101945135 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 RNF149 NA NA NA NA RNF149 21697 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 102333492 102333834 102333706 Y IL1R1,RNF149,IL1R2,MAP4K4,MAP4K4 MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 22180 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 102380179 102380656 102380455 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 68867 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 102669658 102669754 102669731 Y IL1R1 IL1R1 IL1R2,IL1R1,IL1RL2 IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 9250 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 102698208 102698334 102698269 Y IL1R1,MAP4K4,MAP4K4 IL1R1 IL1R2 IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 19204 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 106474357 106474542 106474414 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 115003 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 110012610 110012858 110012734 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 356925 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 113444240 113444400 113444290 Y NA SLC20A1 NA NA NA NA SLC20A1 42806 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 113657771 113658101 113657937 Y NA NA CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 CKAP2L 137517 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 AC017074.2 376840 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 AC017074.2,MIR4782,SLC35F5 NA NA NA NA MIR4782 7115 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 114581845 114582045 114581946 Y NA NA ACTR3 IMR90 Hi-C 24141950 ACTR3 63492 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 114672841 114673224 114672915 Y NA ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 27304 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 116027974 116028021 116027995 Y DPP10,DPP10,DPP10 NA NA NA NA NA ACTR3 1382437 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 118741787 118742055 118741993 Y CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 27654 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 119067655 119067950 119067737 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 125693 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 119068196 119068550 119068541 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 126234 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 119145172 119145468 119145321 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 203210 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 120887789 120888032 120887910 Y NA NA NA NA NA NA TMEM185B 90952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 127863441 127863795 127863513 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 127934423 127934665 127934539 Y MAP3K2 NA NA NA NA NA BIN1 71492 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 128147350 128147625 128147497 Y WDR33,SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2 MAP3K2 CYP27C1,IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 3309 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 128165400 128165641 128165534 Y NA MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 21359 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA RNU4-48P,IWS1 NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 128773511 128773726 128773583 Y NA SAP130 NA NA NA NA SAP130 9968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 131148815 131149203 131148908 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18 PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 131149333 131149678 131149410 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37753 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF4 106956 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 131555592 131555820 131555689 Y CCDC115 ARHGEF4 PLEKHB2,FAM168B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ARHGEF4 36669 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 131745045 131745246 131745147 Y NA NA NA NA NA NA FAM168B 103787 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 133609225 133609410 133609318 Y NA NA NA NA NA NA MGAT5 1266144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 135521006 135521271 135521069 Y NA NA NA NA NA NA CCNT2 152534 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 135691118 135691392 135691265 Y TMEM163,ACMSD,CCNT2 CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 16838 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 136242341 136242686 136242514 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 44120 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 136894529 136894959 136894771 Y NA CXCR4 NA NA NA NA CXCR4 20794 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 136933902 136934303 136934241 Y UBXN4 NA NA NA NA NA CXCR4 60167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 137936497 137936938 137936682 Y NA NA NA NA NA NA HNMT 782652 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 139260181 139260311 139260246 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 2810 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 145202638 145202856 145202713 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2 77291 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 145215157 145215664 145215657 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2 64483 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 145338212 145338608 145338410 Y NA NA ZEB2 K562 ChIA-PET 22265404 ZEB2 58065 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 145580675 145580804 145580747 Y ZEB2 NA NA NA NA NA TEX41 157141 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 145756118 145756307 145756200 Y ZEB2 NA NA NA NA NA TEX41 332584 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 145821367 145821376 145821372 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 271422 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 148279824 148280174 148279855 Y NA NA NA NA NA NA AC009480.4 285741 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 149017229 149017560 149017414 Y NA NA NA NA NA NA ORC4 240082 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 153356449 153356753 153356698 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 166698 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 158320847 158320989 158320917 Y ACVR1,ACVR1,CYTIP NA NA NA NA NA ACVR1 409385 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 160097747 160098072 160097910 Y TANC1 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 43238 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 160106082 160106269 160106215 Y MARCH7 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 35041 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 161508098 161508268 161508210 Y TANK NA RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 159793 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 162727867 162728162 162727919 Y NA NA NA NA NA NA DPP4 200890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 162817649 162818074 162817753 Y IFIH1 NA NA NA NA NA DPP4 110978 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385560 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr2 164205577 164205788 164205730 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 384734 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 164322048 164322202 164322137 Y NA NA NA NA NA NA FIGN 268320 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 164486140 164486494 164486462 Y NA NA NA NA NA NA FIGN 104028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr2 164501816 164502222 164502220 Y NA NA NA NA NA NA FIGN 88300 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 164534395 164534690 164534543 Y FIGN NA NA NA NA NA FIGN 55832 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 164955524 164955689 164955619 Y NA NA NA NA NA NA FIGN 365002 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 166011683 166012027 166011915 Y NA NA NA NA NA NA CSRNP3 312130 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 166161416 166161745 166161474 Y SCN2A,SCN2A NA NA NA NA NA CSRNP3 162412 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 168291941 168292335 168292012 Y B3GALT1 NA NA NA NA NA AC074363.1 144260 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 168858571 168859104 168858832 Y NA NA NA NA NA NA STK39 243547 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 169677226 169677236 169677231 Y NA NA NA NA NA NA SPC25 90645 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 171679560 171679730 171679653 Y NA GAD1 NA NA NA NA GAD1 11837 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 174800246 174800560 174800554 Y NA SP3 NA NA NA NA SP3 27870 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 174899943 174900225 174900070 Y SP3 NA SP3,CDCA7,OLA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP3 71513 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 174963658 174963852 174963755 Y NA NA NA NA NA NA SP3 135228 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 175085975 175086128 175086062 Y NA OLA1 NA NA NA NA OLA1 25298 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 175248509 175248787 175248661 Y SP3,SP3 CIR1,SCRN3 NA NA NA NA CIR1 9656 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 175473281 175473435 175473355 Y CIR1,WIPF1 NA NA NA NA NA AC018890.6 63412 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 175519164 175519290 175519227 Y NA WIPF1 NA NA NA NA WIPF1 26354 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 175540530 175540594 175540562 Y CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1 WIPF1,H3F3AP4 NA NA NA NA WIPF1 5050 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 177047108 177047317 177047213 Y NA HOXD-AS2,HOXD1,HOXD-AS1,AC016739.2 NA NA NA NA HOXD1 3990 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 178100990 178101571 178101482 Y NA HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 17167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 180006156 180006503 180006499 Y NA NA NA NA NA NA SESTD1 121014 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 183877830 183878146 183878099 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 23440 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 186616540 186616923 186616825 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 731960 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 187390995 187391341 187391159 Y NA ZC3H15 NA NA NA NA ZC3H15 42112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 187455745 187456210 187455889 Y NA ITGAV NA NA NA NA ITGAV 2953 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 187889357 187889560 187889419 Y NA AC007319.1 NA NA NA NA AC007319.1 23410 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 187922387 187922712 187922454 Y NA NA NA NA NA NA AC007319.1 56440 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 188326523 188326725 188326579 Y NA CALCRL NA NA NA NA CALCRL 15336 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr2 188404228 188404596 188404560 Y TFPI NA NA NA NA NA CALCRL 93041 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 189155414 189155583 189155499 Y NA GULP1 NA NA NA NA GULP1 1018 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 189168145 189168606 189168510 Y NA GULP1 NA NA NA NA GULP1 13749 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 189392634 189392951 189392670 Y NA NA NA NA NA NA GULP1 238238 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 189957665 189957918 189957859 Y COL3A1,COL5A2 NA NA NA NA NA COL5A2 84687 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 189978697 189979080 189978901 Y NA NA NA NA NA NA COL5A2 63525 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 189988166 189988248 189988206 Y NA NA NA NA NA NA COL5A2 54357 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 189996829 189996972 189996897 Y NA COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 45633 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 190014709 190015152 190014914 Y NA COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 27453 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 190025289 190025449 190025364 Y COL3A1 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 17156 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 190040885 190041209 190041024 Y NA COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 1396 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr2 190056615 190056806 190056658 Y NA COL5A2 GULP1,COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 14010 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 190067676 190068381 190068047 Y NA COL5A2 GULP1,COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 25071 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 190073490 190073745 190073639 Y NA COL5A2 COL5A2,WDR75 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 30885 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 190075572 190075716 190075672 Y DIRC1 COL5A2 COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 32967 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 190118899 190119326 190119165 Y NA NA COL5A2,COL3A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 76294 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 191861736 191862119 191861929 Y NA AC067945.3,STAT1 NA NA NA NA AC067945.3 5443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 192500525 192500897 192500643 Y NA NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYO1B 392614 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 192893540 192893930 192893543 Y TMEFF2 NA NA NA NA NA TMEFF2 164505 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 197327086 197327270 197327178 Y NA NA NA NA NA NA HECW2 129146 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 200209653 200209909 200209897 Y SATB2,SATB2,SATB2 NA NA NA NA NA SATB2-AS1 110514 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 200328214 200328741 200328463 Y SATB2,SATB2,SATB2 SATB2-AS1,SATB2 NA NA NA NA SATB2 5248 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 201238754 201239056 201238905 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2L 70150 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 201397001 201397079 201397012 Y NA SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 14494 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 201403171 201403461 201403317 Y NA SGOL2,KCTD18,AOX1 NA NA NA NA KCTD18 20664 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 201794314 201794594 201794537 Y BZW1,BZW1,BZW1,CASP10,CLK1,CLK1 PPIL3,NIF3L1,ORC2 NA NA NA NA ORC2 31809 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 201978583 201978718 201978642 Y CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 109 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 201992378 201992654 201992500 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 13551 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 202078581 202078959 202078777 Y CASP10 NA NA NA NA NA CFLAR 99754 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 202204679 202205066 202204873 Y NA STRADB NA NA NA NA STRADB 45515 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr2 203090268 203090335 203090273 Y NA PSMA2P3,DAZAP2P1,SUMO1,NOP58 NA NA NA NA SUMO1 10996 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 203131534 203131826 203131673 Y FAM117B,NOP58 SUMO1,NOP58 NA NA NA NA NOP58 3095 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 203341668 203341778 203341723 Y NA NA NA NA NA NA BMPR2 102009 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 204672477 204672504 204672490 Y NA NA RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 274344 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 204853675 204853867 204853740 Y NA NA NA NA NA NA RAPH1 455542 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 205941822 205941857 205941840 Y NA NA NA NA NA NA PARD3B 533306 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 206577207 206577609 206577411 Y INO80D NRP2 NA NA NA NA NRP2 32493 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 208016492 208017045 208016857 Y CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 12946 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr2 208602415 208602802 208602609 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA CCNYL1 28151 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 210935617 210935943 210935781 Y C2orf67,ACADL NA NA NA NA NA RPE 70328 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 211571404 211571410 211571407 Y NA NA NA NA NA NA LANCL1 231028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 213168681 213168967 213168824 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 232598 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 213323461 213323863 213323827 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 77702 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 213340230 213340572 213340527 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 60993 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 213400949 213401339 213401014 Y ERBB4 ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 226 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 213401643 213402097 213401658 Y NA ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 78 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 214022192 214022320 214022272 Y IKZF2,IKZF2 NA NA NA NA NA SPAG16 124793 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 216473974 216474094 216474034 Y NA NA NA NA NA NA FN1 175079 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 216519075 216519228 216519149 Y NA NA NA NA NA NA FN1 220180 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 217797120 217797464 217797294 Y NA NA DIRC3,TNP1,IGFBP5 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 238872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 217954839 217955031 217954913 Y NA NA IGFBP5,DIRC3,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 396591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 218027339 218027548 218027469 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 469091 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 218953176 218953511 218953344 Y NA NA NA NA NA NA ARPC2 126306 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 219177286 219177625 219177456 Y NA AAMP,PNKD,TMBIM1,AC021016.7 NA NA NA NA TMBIM1 21977 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 48366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr2 219774108 219774202 219774159 Y USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1 CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 48175 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 219844869 219844996 219844902 Y NA CDK5R2,FEV NA NA NA NA FEV 3383 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 222312152 222312375 222312261 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 124547 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 PAX3 334304 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr2 223155643 223155970 223155818 Y PAX3,CCDC140 PAX3 NA NA NA NA PAX3 5745 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr2 223157138 223157255 223157183 Y PAX3,CCDC140 PAX3 NA NA NA NA PAX3 4460 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 223170887 223171031 223170916 Y NA PAX3 NA NA NA NA PAX3 9172 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 223447202 223447309 223447256 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 71747 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 224773224 224773437 224773430 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 34667 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 225325353 225325370 225325362 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 122740 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 225813471 225813927 225813697 Y CUL3 NA NA NA NA NA DOCK10 91235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 225841174 225841410 225841405 Y NA NA NA NA NA NA DOCK10 63752 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 225857926 225857937 225857931 Y NA DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 47225 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 227580904 227581301 227581103 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 81174 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 228873880 228874070 228873976 Y C2orf83,SPHKAP NA NA NA NA NA CCL20 197322 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 229922941 229923063 229923002 Y NA NA NA NA NA NA PID1 210938 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 232046537 232047112 232046768 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 14148 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 232282956 232283086 232283021 Y NA SNORD82 NA NA NA NA SNORD82 40065 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA NMUR1 75682 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.82900021221141 chr2 232470282 232470477 232470427 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 77076 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 85673 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 232479434 232479727 232479552 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 86228 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 232566219 232566469 232566340 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 3136 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 233181304 233181393 233181324 Y NA NA NA NA NA NA ECEL1 169145 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 236547901 236548387 236548201 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 147168 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 236698901 236699175 236699041 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 298168 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 236910231 236910384 236910319 Y NA NA NA NA NA NA AC079135.1 163706 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 237073092 237073409 237073337 Y NA AC079135.1,GBX2 NA NA NA NA AC079135.1 681 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr2 237657869 237658188 237658029 Y NA NA CXCR7 MCF7 ChIA-PET 22265404 IQCA1 243684 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 238018538 238018666 238018550 Y NA COPS8,AC105760.2 NA NA NA NA AC105760.2 26078 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr2 238038460 238038824 238038818 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 46000 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 238092955 238093156 238093082 Y NA NA COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 100495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 238581844 238582251 238582110 Y LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 47625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 238596328 238596696 238596497 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 62109 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 238700596 238700726 238700660 Y NA NA NA NA NA NA RAMP1 64810 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 238779455 238779579 238779499 Y RAMP1 RAMP1 NA NA NA NA RAMP1 13919 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 239050654 239050828 239050729 Y KLHL30 FAM132B NA NA NA NA FAM132B 14795 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 239129575 239129683 239129630 Y NA ILKAP,AC016757.3,HES6 NA NA NA NA AC016757.3 8635 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 239968226 239968465 239968347 Y NA NA NA NA NA NA TWIST2 213553 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 53464 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 240829709 240829975 240829842 Y NA NA LOC150935 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA10 132844 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 240854377 240854983 240854483 Y NA NA LOC150935,MIR4786 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA10 107836 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 241395144 241395496 241395485 Y NA GPC1 NA NA NA NA GPC1 22056 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 241519364 241519647 241519506 Y NA DUSP28,RNPEPL1,ANKMY1,CAPN10 NA NA NA NA CAPN10 4486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 241771658 241772038 241771862 Y KIF1A KIF1A ANKMY1,RNPEPL1,CAPN10,KIF1A,C2orf54,SNED1,PASK,HDLBP,ANO7,PPP1R7 IMR90 Hi-C 24141950 KIF1A 13933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 241856097 241856248 241856111 Y GPC1,RNPEPL1,SNED1 NA LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 SNED1 80007 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 242300434 242300614 242300524 Y NA SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 6776 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr2 242480531 242480899 242480752 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 15237 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr20 247683 247718 247701 Y NA C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1 NA NA NA NA C20orf96 21672 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr20 290991 291448 291293 Y C20orf54 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 12759 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 483361 483443 483402 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA CSNK2A1 39022 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 623135 623319 623297 Y NA TCF15,SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 8695 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 709042 709425 709354 Y NA NA CSNK2A1,RSPO4,SRXN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRXN1 77028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 1097798 1098000 1097899 Y NA PSMF1 NA NA NA NA PSMF1 5892 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 1119535 1119804 1119673 Y NA PSMF1,TMEM74B NA NA NA NA PSMF1 27629 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 1124805 1124974 1124890 Y SCRT2,C20orf202,C20orf46 PSMF1,TMEM74B NA NA NA NA PSMF1 32899 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 1154843 1155127 1154985 Y FAM110A,SIRPB2,SIRPB1 TMEM74B,RAD21L1 NA NA NA NA TMEM74B 8932 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA SNPH FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 13571 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 1307828 1308261 1308086 Y SDCBP2 NA NA NA NA NA SNPH 62868 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 1338546 1338920 1338732 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 32886 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 1757792 1758093 1758078 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 115061 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 1839579 1839847 1839791 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 33307 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 2450025 2450398 2450237 Y NA SNORD119,SNRPB NA NA NA NA SNRPB 526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 2771027 2771047 2771039 Y NA CPXM1,VPS16 NA NA NA NA CPXM1 8236 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 2855066 2855678 2855300 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 12236 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 3156363 3156554 3156472 Y EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 17521 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 3286864 3286977 3286928 Y NA NA NA NA NA NA SLC4A11 69028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 4487937 4488131 4488040 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 RPS4XP2 120734 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 4895704 4895880 4895792 Y NA NA RASSF2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 93059 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 4906233 4906312 4906273 Y RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 NA NA NA NA NA SLC23A2 82627 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 4941641 4941708 4941700 Y NA SLC23A2 RASSF2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 47231 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 4954142 4954446 4954407 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 34493 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 5053777 5054341 5054121 Y PRNP,PRNP,RASSF2,SLC23A2 NA NA NA NA NA PCNA 50931 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr20 5622884 5622997 5622941 Y TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 33212 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 6594261 6594618 6594466 Y NA NA NA NA NA NA FERMT1 492070 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 8173456 8173854 8173482 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 62632 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 99877 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 8380615 8380981 8380808 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 269791 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 8509253 8509664 8509321 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 398429 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 9013530 9013651 9013594 Y PLCB4 PLCB4 PLCB4,PLCB1 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB4 33759 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 9291356 9291748 9291412 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 243946 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 10447085 10447351 10447236 Y NA MKKS NA NA NA NA MKKS 34215 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 10466571 10466854 10466711 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 53701 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 10468745 10468922 10468834 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 55875 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 10471502 10471750 10471599 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 58632 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 12250218 12250236 12250226 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 380847 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 14036151 14036406 14036253 Y NA NA NA NA NA NA MACROD2 62136 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 14500869 14501154 14501002 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 184607 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 14819565 14819718 14819593 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 503303 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 16373141 16373392 16373267 Y OTOR NA NA NA NA NA KIF16B 178686 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 17593106 17593506 17593263 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 44598 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr20 17644857 17645185 17645058 Y NA RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 15755 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 19323791 19324082 19323937 Y SLC24A3 NA NA NA NA NA SLC24A3 132501 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 20432950 20433312 20432989 Y C20orf26,INSM1 NA NA NA NA NA INSM1 86185 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 20652620 20652826 20652771 Y NA RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 38305 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 21147247 21147656 21147458 Y NA PLK1S1 NA NA NA NA PLK1S1 42623 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 21486506 21486611 21486559 Y NA NA NA NA NA NA PAX1 197686 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr20 21501213 21501475 21501344 Y NKX2-2 NA PLK1S1 IMR90 Hi-C 24141950 PAX1 182822 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 24969855 24970103 24969979 Y NA NA NA NA NA NA ACSS1 67513 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 25227906 25228088 25227908 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 1201 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 25299092 25299564 25299289 Y NA NA NA NA NA NA ABHD12 70055 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 26116339 26116766 26116505 Y NA NA NA NA NA NA MIR663A 113396 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 30796713 30797081 30796897 Y NA TSPY26P,PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA POFUT1 3030 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 31044923 31045080 31044970 Y NA NA NA NA NA NA ASXL1 100768 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr20 31170393 31170766 31170763 Y NA C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 110 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 31214876 31215264 31215015 Y NA C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 44000 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 31560072 31560429 31560192 Y CDK5RAP1 NA NA NA NA NA MAPRE1 154373 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 31998840 31999088 31998873 Y C20orf185 CDK5RAP1,SNTA1 CDK5RAP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDK5RAP1 11473 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 32690137 32690399 32690268 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 7739 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr20 33055325 33055363 33055345 Y NA DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 46851 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 37627 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 33263826 33263865 33263846 Y MYH7B PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA PIGU 916 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 33294754 33295084 33294783 Y NA PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA TP53INP2 4660 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 33653192 33653349 33653271 Y NA TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 25325 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 34479476 34479734 34479606 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 5895 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr20 35290523 35290606 35290565 Y DLGAP4 NA SLA2,TGIF2-C20ORF24 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf24 58386 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 35489284 35489554 35489419 Y NA NA NA NA NA NA SAMHD1 88692 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 35612420 35612442 35612434 Y RBL1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 34174 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 35922737 35923093 35922847 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 6696 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 36007590 36007925 36007762 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC SRC NA NA NA NA SRC 36502 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 36056702 36057072 36056829 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 14864 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 36542931 36543304 36543133 Y NA VSTM2L NA NA NA NA VSTM2L 13432 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 36618785 36619379 36619133 Y RALGAPB,RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 40491 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 36693519 36693713 36693616 Y RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA RPRD1B 33571 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 37302978 37303466 37303191 Y ACTR5,SLC32A1 NA ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B IMR90 Hi-C 24141950 ACTR5 71619 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr20 37398577 37398739 37398665 Y NA ACTR5,PPP1R16B NA NA NA NA ACTR5 23492 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 37606792 37607147 37606919 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 17850 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 38415977 38416136 38416027 Y NA NA NA NA NA NA DHX35 827035 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 39126761 39127835 39127266 Y NA NA NA NA NA NA MAFB 188045 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 39826598 39826945 39826630 Y CHD6 NA NA NA NA NA PLCG1 62998 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 42833040 42833424 42833233 Y C20orf111 OSER1-AS1,GDAP1L1 NA NA NA NA OSER1-AS1 4176 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 43582253 43582415 43582335 Y NA PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 4712 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 44001576 44001658 44001579 Y WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT NA NA NA NA SYS1-DBNDD2 11736 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 44062032 44062200 44062120 Y KCNS1,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,WFDC11,WFDC6 PIGT,WFDC2 NA NA NA NA PIGT 19315 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 44855330 44855616 44855473 Y ZNF334,SLC12A5,CDH22 NA NA NA NA NA CDH22 79521 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 45028892 45029133 45029011 Y CD40 SLC35C2,ELMO2 NA NA NA NA ELMO2 30571 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 45825158 45825275 45825178 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND8 158292 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 23191 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr20 47355645 47355720 47355673 Y NA NA NA NA NA NA PREX1 86700 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 47544338 47544681 47544534 Y DDX27 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 7911 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 47547466 47547777 47547635 Y ZNFX1,ARFGEF2 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 11039 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 47784409 47784640 47784548 Y PREX1,ZNFX1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 18264 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 47796581 47796870 47796726 Y NA STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 6034 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 48291121 48291501 48291391 Y ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 36914 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr20 48317822 48318037 48318021 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 10378 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 48327368 48328064 48327696 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 351 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 48402411 48402524 48402488 Y B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8 SLC9A8 KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 24726 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 48532841 48533167 48533004 Y SPATA2,SPATA2 SPATA2,RNF114 NA NA NA NA SPATA2 2761 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 48717588 48717974 48717858 Y NA UBE2V1 NA NA NA NA UBE2V1 12522 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 48726581 48727101 48726820 Y SPATA2,SPATA2 UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189 NA NA NA NA UBE2V1 3395 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 48753681 48754062 48753956 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4 NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 14112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 48887757 48888308 48887925 Y SLC9A8,SPATA2,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB NA PARD6B,CEBPB,PTPN1,LOC284751,FAM65C,MIR645 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 82381 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 48921857 48922230 48922089 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 116481 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 49051331 49051557 49051444 Y RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 73334 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr20 49430215 49430240 49430227 Y PARD6B,BCAS4,ADNP BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 20784 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 49454379 49454475 49454388 Y NA BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 44948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 49516325 49516426 49516399 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP NA NA NA NA RP5-914P20.5 29095 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 20815 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 49553399 49553600 49553500 Y NA RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA ADNP 7441 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr20 49838536 49838841 49838768 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 200870 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 50033542 50033860 50033623 Y NFATC2 NA NA NA NA NA NFATC2 143510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 50113765 50113981 50113873 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 63389 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 50180369 50180507 50180463 Y NFATC2 NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 2999 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 50244610 50244912 50244769 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 67240 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 50267344 50267677 50267577 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 81395 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 50272756 50273155 50272761 Y ATP9A NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 75917 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4 NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 5.28890499432679 chr20 50416342 50416699 50416509 Y NA ATP9A,SALL4 NA NA NA NA SALL4 360 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A,SALL4 NA NA NA NA SALL4 276 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr20 50416861 50417288 50417180 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA SALL4 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr20 50664352 50664405 50664395 Y NA NA ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 154442 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 50665033 50665229 50665099 Y NA NA ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 153618 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52195343 52195714 52195527 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 28732 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.72464293293265 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 52196593 52196861 52196746 Y TSHZ2,ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27585 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 52212842 52213180 52212942 Y ZNF217 ZNF217 BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 11266 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52213211 52213282 52213247 Y NA ZNF217 BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 11164 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr20 52271592 52271787 52271702 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 47146 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52272747 52273002 52272846 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BCAS1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 48301 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52277634 52277772 52277670 Y NA NA SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 53188 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52294676 52294905 52294769 Y NA NA BMP7,SUMO1P1,BCAS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 70230 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52323078 52323315 52323172 Y NA NA SUMO1P1,ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 98632 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52351984 52352361 52352104 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 127538 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52353948 52354213 52354172 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 129502 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 3.21933347480761 chr20 52367753 52368082 52368002 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 143307 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52371075 52371265 52371223 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 146629 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 52374184 52374569 52374228 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 149738 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 5.28890499432679 chr20 52407558 52407732 52407573 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 183112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 52452051 52452403 52452283 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 227605 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52480421 52480878 52480693 Y ZNF217,PFDN4 NA NA NA NA NA ZNF217 255975 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.95459532399033 chr20 52481702 52482101 52481977 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 257256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 258209 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr20 52483715 52484176 52483911 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 259269 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52514730 52515023 52514955 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 273489 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr20 52520115 52520714 52520380 Y ZNF217 NA SUMO1P1,ZNF217,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 267798 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 52527037 52527254 52527085 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 261258 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52531977 52532203 52532002 Y NA NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 256309 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52532315 52532889 52532591 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 255623 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 244941 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52551883 52552311 52551992 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 236201 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52570477 52570680 52570623 Y NA NA NA NA NA NA CYP24A1 217832 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr20 52701459 52701889 52701687 Y NA NA CYP24A1,SULF2,DOK5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 86623 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52730221 52730319 52730270 Y NA NA CYP24A1,DOK5,BMP7,SULF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 58193 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 52831217 52831490 52831439 Y NA CYP24A1,PFDN4 NA NA NA NA PFDN4 8831 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 54729980 54730207 54730095 Y NA NA NA NA NA NA FAM210B 201764 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 56270075 56270492 56270216 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 14100 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 58436515 58436843 58436553 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 69867 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 58459134 58459312 58459218 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177 SYCP2 NA NA NA NA SYCP2 47398 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 58536301 58536377 58536339 Y NA SYCP2,PPP1R3D NA NA NA NA PPP1R3D 22949 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 59670455 59670470 59670463 Y CDH4 NA CDH26,LOC284757,C20orf197 IMR90 Hi-C 24141950 CDH4 155012 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 59828827 59829192 59829064 Y CDH4 CDH4 NA NA NA NA CDH4 3345 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr20 60500389 60500694 60500636 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 138172 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr20 60874912 60875240 60875071 Y NA NA NA NA NA NA ADRM1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 60924549 60924827 60924688 Y TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5 ADRM1,LAMA5,RPS21 NA NA NA NA LAMA5 15541 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 60941528 60941750 60941608 Y SLCO4A1,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 1160 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 60956313 60956720 60956445 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 3452 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 61553883 61554120 61553955 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 13184 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 61554875 61554902 61554887 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 12402 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 61807743 61807918 61807813 Y NA YTHDF1 NA NA NA NA YTHDF1 37668 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr20 62609214 62609358 62609321 Y SAMD10 UCKL1,SAMD10,PRPF6 NA NA NA NA SAMD10 3 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr21 11095741 11096142 11095942 Y BAGE2,BAGE NA NA NA NA NA TEKT4P2 1129156 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 11130122 11130404 11130162 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1163537 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 11174514 11174910 11174556 Y NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1207929 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 11184749 11185145 11184947 Y BAGE2,BAGE NA NA NA NA NA TEKT4P2 1218164 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 16129964 16130277 16130229 Y NA AF127936.3 NA NA NA NA AF127936.3 5780 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 16345757 16346184 16346094 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 89137 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 16354668 16355055 16354876 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 80266 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr21 16368229 16368687 16368553 Y NRIP1 NA NA NA NA NA NRIP1 66634 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 16662871 16663259 16663022 Y NA NA SAMSN1,NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 227550 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 14.6019768321631 chr21 16815878 16816236 16816057 Y NA NA SAMSN1,LOC388813 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 284108 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 17264124 17264427 17264344 Y NA NA NA NA NA NA USP25 163780 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 17652343 17653123 17652644 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 211501 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 17672058 17672352 17672205 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 231216 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 17678130 17678559 17678221 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 237288 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr21 17842479 17842645 17842562 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 401637 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 17906222 17906467 17906345 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 465380 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 466067 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr21 17924273 17924626 17924451 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 483431 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 518558 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 519825 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr21 18124043 18124292 18124232 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 683201 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 18142033 18142291 18142161 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 701191 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 18706000 18706364 18706182 Y NA NA NA NA NA NA CXADR 176336 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 18809176 18809383 18809253 Y NA NA NA NA NA NA CXADR 73317 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 8560 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 20000884 20000961 20000923 Y NA NA NA NA NA NA AL109763.2 129360 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 20089064 20089357 20089211 Y NA AL109763.2 NA NA NA NA AL109763.2 40964 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr21 26956680 26957339 26957242 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 20490 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MRPL39,JAM2 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr21 26980548 26980842 26980671 Y NA MRPL39,JAM2 NA NA NA NA MRPL39 2719 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 27353741 27354048 27353953 Y APP NA NA NA NA NA APP 187398 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr21 28105063 28105410 28105236 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS1 110318 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 28207147 28207505 28207325 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 8223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 29476694 29476903 29476871 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT1 778790 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 30037436 30037730 30037586 Y NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 217963 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 14.8319292232208 chr21 30390843 30391016 30390919 Y NA LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 NA NA NA NA RWDD2B 1144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 30472474 30472512 30472479 Y USP16,BACH1,BACH1 CCT8 NA NA NA NA CCT8 28356 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 30591516 30591874 30591674 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 27124 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 34760614 34760812 34760647 Y OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 12390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 35574029 35574459 35574413 Y NA LINC00310 NA NA NA NA LINC00310 23051 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 36185927 36186112 36186038 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 200486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 36214787 36216208 36215152 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 229346 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 36222572 36222954 36222768 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 237131 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 36845854 36846269 36846061 Y NA NA LINC00160,RUNX1,LOC100506385,CLIC6 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 528696 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 37485408 37485566 37485491 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 19644 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 37486095 37486219 37486157 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 18991 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 37695369 37695803 37695437 Y MORC3 MORC3 NA NA NA NA MORC3 4882 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr21 38072912 38073314 38073050 Y SIM2 SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 3479 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr21 38500086 38500176 38500125 Y NA NA NA NA NA NA TTC3 56560 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr21 38801876 38802213 38802018 Y DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A NA NA NA NA NA DYRK1A 65784 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr21 39004614 39004980 39004830 Y NA NA NA NA NA NA DYRK1A 268522 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 39591082 39591262 39591219 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 99537 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr21 39849020 39849402 39849146 Y ETS2 NA NA NA NA NA ETS2 325829 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 39867622 39867911 39867841 Y ERG NA NA NA NA NA ETS2 307320 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 40357559 40358114 40357780 Y ETS2 NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 ETS2 182328 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 40476284 40476629 40476514 Y ETS2 NA ETS2,LINC00114,ERG IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 77148 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 40716228 40716377 40716303 Y NA BRWD1,HMGN1,WRB NA NA NA NA HMGN1 3196 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 40814197 40814412 40814270 Y NA LCA5L,SH3BGR NA NA NA NA LCA5L 1319 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 42598872 42599018 42598944 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 61144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 42879173 42879227 42879200 Y FAM3B,TMPRSS2,TMPRSS2 NA NA NA NA NA BACE2 341445 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 43214290 43214658 43214474 Y NA NA NA NA NA NA PRDM15 82933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr21 44072717 44073208 44072832 Y NA PDE9A NA NA NA NA PDE9A 971 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 44091107 44091303 44091206 Y NA PDE9A NA NA NA NA PDE9A 19361 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 44355985 44356328 44356154 Y NA PKNOX1 U2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 PKNOX1 36292 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 44469974 44470172 44470008 Y CBS CBS NA NA NA NA CBS 24881 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr21 44860778 44861412 44860950 Y SIK1 SIK1 NA NA NA NA SIK1 15770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 44874156 44874417 44874299 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 29148 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 45015260 45015643 45015451 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 61731 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 45117744 45118082 45118052 Y NA HSF2BP,RRP1B,PDXK PDXK IMR90 Hi-C 24141950 PDXK 18893 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 45394155 45394780 45394371 Y AGPAT3,TRPM2,C21orf33 TRAPPC10 NA NA NA NA TRAPPC10 35420 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr21 45441566 45441868 45441701 Y C21orf2,TRAPPC10 TRAPPC10 PWP2,C21orf33 IMR90 Hi-C 24141950 TRAPPC10 11366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 45890728 45891129 45890927 Y NA LRRC3,AP001065.15 NA NA NA NA AP001065.15 12331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA AP001065.15 NA NA NA NA AP001065.15 40318 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.95459532399033 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 46495480 46495526 46495490 Y KRTAP10-12,ADARB1 ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 3712 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 46549530 46549961 46549631 Y NA NA NA NA NA NA ADARB1 57762 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 46726845 46727332 46727050 Y NA POFUT2 NA NA NA NA POFUT2 21032 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 46982041 46982418 46982230 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,LINC00315,LOC642852 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 19716 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48142 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr21 47212658 47212880 47212769 Y NA NA ADARB1,SLC19A1,PCBP3 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 151050 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 47266684 47266899 47266840 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 132752 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 47524636 47524785 47524711 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 8625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 47543656 47544056 47543951 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 27645 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 47554885 47555152 47555043 Y FTCD COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 38874 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 47637534 47637799 47637667 Y NA LSS,MCM3AP-AS1 NA NA NA NA LSS 8939 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 47724911 47725263 47725135 Y PRMT2 MCM3AP,YBEY,C21orf58,PCNT NA NA NA NA C21orf58 16526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr21 47968526 47968894 47968542 Y NA NA NA NA NA NA PRMT2 84185 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 17568441 17568522 17568513 Y NA IL17RA,CECR6 NA NA NA NA IL17RA 4597 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 17849400 17850329 17849515 Y NA NA NA NA NA NA AC005300.5 177574 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 17850637 17851018 17850672 Y NA NA NA NA NA NA AC005300.5 178811 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 19043288 19043502 19043327 Y NA NA NA NA NA NA DGCR2 64465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 19072724 19073088 19073012 Y NA DGCR2 NA NA NA NA DGCR2 34879 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr22 19337870 19338225 19337898 Y NA NA NA NA NA NA CLTCL1 60631 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 19378121 19378382 19378253 Y NA MRPL40 NA NA NA NA MRPL40 39043 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 19433007 19433028 19433018 Y NA MRPL40,HIRA,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA HIRA 196 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 19930770 19931097 19930953 Y ZDHHC8,COMT COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 3429 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 20287043 20287283 20287165 Y NA RTN4R,DGCR6L NA NA NA NA RTN4R 18274 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 20772547 20772776 20772578 Y PI4KA ZNF74,SCARF2 NA NA NA NA SCARF2 17370 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr22 20911751 20912048 20911845 Y PI4KA,THAP7,PI4KA,MED15 NA NA NA NA NA MED15 63551 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.98938108374992 chr22 22098382 22098623 22098439 Y NA YPEL1 NA NA NA NA YPEL1 10259 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 22187099 22187411 22187395 Y PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 32559 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 22205229 22205454 22205405 Y NA MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 14516 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 22478098 22478432 22478244 Y CCDC116,YPEL1,ZNF280B NA NA NA NA NA TOP3B 142885 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 23552686 23553004 23552762 Y NA BCR NA NA NA NA BCR 32795 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 23863249 23863551 23863355 Y NA NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 120336 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 24796747 24798216 24797446 Y GGT1 ADORA2A NA NA NA NA ADORA2A 13631 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGSM1 148495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr22 25349333 25349980 25349695 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGSM1 149097 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 25883503 25883619 25883561 Y NA CRYBB2P1 MYO18B,LRP5L,CRYBB2P1,ADRBK2,SEZ6L IMR90 Hi-C 24141950 CRYBB2P1 41431 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 27131212 27131584 27131334 Y NA NA MN1,PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 64482 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 27870917 27871291 27871105 Y NA NA PITPNB,MN1,TTC28,TTC28-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 324195 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 28262860 28262973 28262918 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA TTC28-AS1 50391 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 28304832 28305219 28305193 Y NA TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA TTC28-AS1 8145 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 28475489 28475734 28475658 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 161367 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 28797071 28797274 28797258 Y PITPNB,XBP1,CCDC117 NA NA NA NA NA HSCB 338745 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 28879777 28880035 28879909 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 255984 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 31030399 31030736 31030505 Y SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4 TCN2,PES1,SLC35E4,DUSP18 NA NA NA NA SLC35E4 760 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 31692333 31692587 31692466 Y SMTN,RNF185 PIK3IP1,PATZ1,AC005003.1 NA NA NA NA PIK3IP1 5813 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 32806612 32806674 32806643 Y RFPL2,RFPL3,TIMP3 NA NA NA NA NA FBXO7 61989 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 32957010 32957396 32957188 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 88347 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 33023085 33023421 33023227 Y RFPL2,RFPL3,TIMP3 NA NA NA NA NA FBXO7 154422 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 33202971 33203258 33203149 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 7284 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 33240240 33240586 33240349 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 44553 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 33243745 33243918 33243862 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 48058 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 33265683 33265702 33265692 Y TIMP3 NA NA NA NA NA TIMP3 69996 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 35767811 35768194 35767985 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 HMOX1,MCM5 NA NA NA NA HMOX1 6160 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 36385915 36386246 36386112 Y NA RBFOX2 NA NA NA NA RBFOX2 36227 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 36806147 36806450 36806256 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1,RP5-1119A7.14 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP4-633O19__A.1 23476 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 36821515 36821891 36821703 Y IFT27 MYH9,RP4-633O19__A.1,RP5-1119A7.14 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1119A7.14 27100 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 9245 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 37219328 37219591 37219472 Y NA IFT27 NA NA NA NA IFT27 49028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 39339454 39339992 39339491 Y DDX17,JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3A APOBEC3B NPTXR,MGAT3,APOBEC3A,CBX6,CBX7,APOBEC3H IMR90 Hi-C 24141950 APOBEC3B 36360 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 39649567 39649736 39649595 Y SUN2,APOBEC3A,PDGFB NA CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL3 64658 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 40575185 40575584 40575306 Y TNRC6B,TNRC6B NA NA NA NA NA RPL7P52 74115 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 40589903 40590338 40589971 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 88833 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 40840291 40840428 40840373 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 75696 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 41294862 41295130 41294948 Y NA ST13,XPNPEP3 NA NA NA NA XPNPEP3 43781 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 42096331 42096684 42096508 Y CHADL,WBP2NL,MEI1 C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA NHP2L1 11823 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr22 42331053 42331125 42331089 Y SHISA8 TNFRSF13C,CENPM,SEPT3 NA NA NA NA CENPM 10043 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 42339043 42339310 42339264 Y NA TNFRSF13C,CENPM,SEPT3 NA NA NA NA CENPM 1858 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 42718410 42718572 42718489 Y NA Z83851.1 TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 Z83851.1 44670 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 42839941 42840323 42840234 Y POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1 CTA-126B4.7 MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-126B4.7 7912 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 45080339 45080681 45080664 Y PRR5 PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 PARVB,KIAA1644,SAMM50 IMR90 Hi-C 24141950 PRR5-ARHGAP8 15432 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 45402294 45403188 45402906 Y NA PHF21B NA NA NA NA PHF21B 692 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 45403389 45403735 45403573 Y KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B PHF21B NA NA NA NA PHF21B 145 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 45664918 45665214 45665118 Y NA KIAA0930,UPK3A,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90 Hi-C 24141950 UPK3A 13649 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 45899980 45900171 45900075 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 3862 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 46374166 46374684 46374539 Y NA NA NA NA NA NA RP6-109B7.3 72901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 46423205 46423605 46423251 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4 NA NA NA NA RP6-109B7.3 23980 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr22 46812032 46812341 46812187 Y NA NA NA NA NA NA TRMU 87260 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 46924162 46924396 46924177 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 6671 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 47250044 47250415 47250236 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 93526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 48035641 48035928 48035744 Y NA RP11-191L9.4 TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 10218 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 48146543 48146838 48146641 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 121120 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 48185959 48186142 48186052 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 160536 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 49157619 49157940 49157765 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 1061220 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 49765184 49765573 49765231 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 453587 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.29952391057686 chr22 49768624 49768992 49768711 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 450168 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr22 50710173 50710402 50710310 Y MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11 TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2 NA NA NA NA MAPK11 2977 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 50891150 50891343 50891221 Y MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2 SBF1,ADM2,MIOX NA NA NA NA SBF1 20111 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr22 51109040 51109307 51109069 Y SHANK3 ARSA,SHANK3 SHANK3,LMF2,NCAPH2,MAPK8IP2,CHKB-CPT1B,ARSA,SBF1,PPP6R2,ODF3B,SYCE3,KLHDC7B,TYMP,LOC100144603 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SHANK3 1536 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 3219649 3219829 3219819 Y NA CRBN NA NA NA NA CRBN 255 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 4780474 4780964 4780800 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 237837 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 4781579 4781854 4781808 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 236947 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 4871506 4871670 4871602 Y ITPR1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 147131 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 108002 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 5028057 5028369 5028268 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8411 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 8529087 8529361 8529226 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 12032 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 9006142 9006408 9006272 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 2685 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 9452001 9452408 9452073 Y MTMR14,SETD5 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5-AS1 13738 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 9904404 9904624 9904511 Y OGG1,LOC401052,ARPC4,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC RPUSD3,JAGN1 NA NA NA NA RPUSD3 20118 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 10266595 10266861 10266739 Y VHL,IRAK2,TATDN2 TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 20846 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 10276652 10276834 10276729 Y NA TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 10873 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr3 11316376 11316801 11316733 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 4381 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 11612359 11612503 11612424 Y HRH1,ATG7 NA NA NA NA NA VGLL4 147717 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 11632872 11633201 11633091 Y SYN2,VGLL4 NA NA NA NA NA VGLL4 127019 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 11688028 11688035 11688032 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 72185 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 12036535 12036797 12036666 Y NA SYN2 NA NA NA NA SYN2 7079 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 12567743 12567843 12567793 Y NA TSEN2,MKRN2 NA NA NA NA MKRN2 28670 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 12917586 12917878 12917745 Y NA RPL32 IQSEC1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL32 36499 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 12972627 12972739 12972683 Y NA NA NA NA NA NA RPL32 91540 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 12994805 12995095 12994927 Y NA NA NA NA NA NA RPL32 113718 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.83961912846149 chr3 13087949 13088097 13088023 Y RPL32,IQSEC1 IQSEC1 NA NA NA NA IQSEC1 24520 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 13325256 13325344 13325300 Y NA NA NUP210,LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 134465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.95459532399033 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 14257734 14258042 14257871 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 39451 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr3 14715115 14715196 14715168 Y NR2C2,C3orf20 C3orf20 NA NA NA NA C3orf20 509 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 15060728 15061023 15060876 Y NR2C2 MRPS25 NA NA NA NA MRPS25 43819 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 15109564 15109704 15109605 Y ZFYVE20 MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 4722 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 15285479 15285699 15285585 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 39820 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 15335582 15336799 15336677 Y NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 44076 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 15598070 15598395 15598206 Y ANKRD28,CAPN7,SH3BP5,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ BTD,HACL1 NA NA NA NA BTD 42453 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 15712856 15713111 15712984 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 71518 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 85273 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 15901875 15902313 15902310 Y METTL6,ANKRD28 ANKRD28 NA NA NA NA ANKRD28 2597 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr3 16024262 16024670 16024542 Y NA NA ANKRD28,GALNTL2,MIR563 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 124984 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr3 16351640 16351656 16351648 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 46934 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 16352603 16353027 16352777 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 47897 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 16373323 16373612 16373405 Y ANKRD28,OXNAD1 NA NA NA NA NA OXNAD1 68617 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 16379697 16380223 16379925 Y DPH3 NA NA NA NA NA OXNAD1 74991 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 16381472 16381685 16381579 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 76766 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 16647619 16647698 16647658 Y DAZL,DAZL NA NA NA NA NA OXNAD1 342913 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 17248138 17248312 17248225 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 943432 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 17378312 17378639 17378476 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 1073606 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 17441926 17442172 17442040 Y PLCL2 NA NA NA NA NA TBC1D5 1042137 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 17506581 17506846 17506713 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 977463 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 17542863 17543019 17542979 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 941290 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 17661435 17661830 17661633 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 822479 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 17674085 17674191 17674137 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 810118 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 17913596 17913897 17913750 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 570412 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 18722396 18722640 18722477 Y NA NA NA NA NA NA RAD23BP1 144231 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 20096123 20096547 20096288 Y RAB5A KAT2B NA NA NA NA KAT2B 16608 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 21722785 21723001 21722895 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D 689811 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 21762451 21762481 21762466 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D 650331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 23935594 23935945 23935770 Y NA RPL15,NR1D2 NA NA NA NA RPL15 20091 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 24563741 24564038 24564033 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 25198005 25198299 25198060 Y NA RARB NA NA NA NA RARB 15524 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 25473876 25474077 25473977 Y NA NA NA NA NA NA TOP2B 230321 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 25767387 25767675 25767610 Y NA NA NA NA NA NA OXSM 54733 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 26758769 26758926 26758778 Y LRRC3B NA NA NA NA NA NEK10 650025 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 27448460 27448581 27448568 Y NA NEK10 NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 NEK10 39509 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 EOMES 87236 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 32526070 32526309 32526138 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 16591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 32857811 32858132 32857909 Y NA AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 32673 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr3 33638872 33639200 33639124 Y NA NA NA NA NA NA CLASP2 118648 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 34342174 34342425 34342178 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 504330 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 37332823 37333208 37333001 Y NA NA NA NA NA NA GOLGA4 50155 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 37344922 37345358 37345096 Y NA NA NA NA NA NA GOLGA4 62254 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr3 38568637 38569221 38568871 Y SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG EXOG NA NA NA NA EXOG 33019 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 39399859 39400185 39399921 Y CCR8,SLC25A38 SLC25A38,RPSA NA NA NA NA SLC25A38 22654 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 39416078 39416196 39416159 Y TTC21A,MOBP SLC25A38,RPSA SLC25A38 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC25A38 6643 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 39446360 39446713 39446516 Y NA SLC25A38,RPSA NA NA NA NA RPSA 180 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 39512456 39512640 39512578 Y MYRIP,CX3CR1,CX3CR1,MOBP NA NA NA NA NA RPSA 66276 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 40491258 40491489 40491375 Y NA ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619 NA NA NA NA ENTPD3-AS1 1331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 41181029 41181045 41181037 Y NA NA NA NA NA NA CTNNB1 53283 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 41307391 41307696 41307531 Y NA NA NA NA NA NA CTNNB1 73063 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 42067110 42067525 42067205 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 13816 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA RP11-353H3.1 87790 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 43557114 43557210 43557162 Y NA RP11-353H3.1 NA NA NA NA RP11-353H3.1 31742 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 43935699 43936111 43935927 Y NA NA NA NA NA NA ANO10 204613 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 44652575 44652865 44652702 Y ZNF445,ZNF502,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197 ZNF660,ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 28195 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 45035735 45035877 45035806 Y ZNF660,ZNF35 EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA ZDHHC3 20058 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 45512532 45512880 45512706 Y NA NA NA NA NA NA LIMD1 82006 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 45594952 45595331 45595047 Y LIMD1 LIMD1 NA NA NA NA LIMD1 66 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 46036343 46036779 46036493 Y CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1 FYCO1 NA NA NA NA FYCO1 1027 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 46422414 46422628 46422548 Y NA NA NA NA NA NA ALS2CL 310566 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 46482468 46482635 46482528 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA NA NA NA NA ALS2CL 250559 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA NA NA NA NA NA ALS2CL 132975 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr3 46971519 46971826 46971651 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 47347 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 47201175 47201471 47201342 Y CSPG5,SETD2 SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 1986 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 47485746 47485855 47485805 Y NA SCAP NA NA NA NA SCAP 30761 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 47584263 47584567 47584468 Y NA CSPG5 NA NA NA NA CSPG5 35715 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 48967045 48967316 48967140 Y NA SLC25A20,ARIH2 NA NA NA NA ARIH2 12791 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 48990226 48990305 48990298 Y USP4 ARIH2,P4HTM NA NA NA NA P4HTM 35014 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 49425171 49425361 49425266 Y ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7 USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1 NA NA NA NA TCTA 22278 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2 NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 51506153 51506528 51506417 Y VPRBP,RAD54L2,GPR62 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 25482 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 52287340 52287625 52287477 Y PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA PPM1M 9499 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 53024364 53024471 53024418 Y NA NA NA NA NA NA SFMBT1 54295 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 53136597 53136930 53136874 Y PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD RFT1 NA NA NA NA RFT1 25548 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 53286308 53286764 53286678 Y NA TKT NA NA NA NA TKT 1304 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 53360286 53360418 53360351 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 19236 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 56443112 56443203 56443174 Y NA NA NA NA NA NA ERC2 57188 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 56665346 56665542 56665444 Y C3orf63 FAM208A NA NA NA NA FAM208A 49723 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 57150916 57150929 57150923 Y NA ARHGEF3,RP11-157F20.1 NA NA NA NA RP11-157F20.1 15241 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 57555554 57555589 57555572 Y FAM116A,PDE12 DNAH12,PDE12,ARF4 NA NA NA NA PDE12 15551 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 DNAH12,PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr3 57637831 57638080 57637955 Y SLMAP,FAM116A,PDE12 NA NA NA NA NA ARF4 55884 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 57995654 57995894 57995762 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3527 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 58163548 58163776 58163593 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 57457 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 58321418 58321818 58321477 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 4811 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 58372741 58373260 58372916 Y PXK,FAM107A PDHB NA NA NA NA PDHB 44324 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 58412465 58412623 58412544 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 4961 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 58457172 58457525 58457255 Y RPP14,RPP14,KCTD6 PDHB,KCTD6 PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 18316 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 58570984 58571306 58571233 Y PXK,FAM107A NA NA NA NA NA KCTD6 95143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 60392594 60392829 60392710 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 842304 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 60695765 60695821 60695814 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 539312 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 61828479 61828865 61828501 Y PTPRG NA NA NA NA NA RPL10AP6 101699 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 65694421 65694810 65694689 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 327699 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 65831008 65831290 65831149 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 191219 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 66021951 66022397 66022084 Y NA MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 67050514 67050733 67050633 Y KBTBD8 NA NA NA NA NA LRIG1 500827 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 67420914 67421310 67421112 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG2 281728 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 70175230 70175612 70175604 Y NA NA NA NA NA NA RP11-460N16.1 128502 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 71136796 71137147 71137136 Y FOXP1 NA NA NA NA NA FOXP1 493993 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 72132186 72132563 72132457 Y RYBP,FOXP1,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2 NA NA NA NA NA LINC00877 157153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 72445751 72445968 72445860 Y NA RYBP NA NA NA NA RYBP 48101 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 72862614 72863000 72862807 Y SHQ1 SHQ1 NA NA NA NA SHQ1 46065 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA PDZRN3 NA NA NA NA PDZRN3 25523 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 76544086 76544385 76544235 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 62917 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 76605335 76605709 76605470 Y ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 124166 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 77239163 77239286 77239225 Y ROBO2,ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 757994 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 77273270 77273652 77273462 Y ROBO2,ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 792101 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 77632301 77632638 77632470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 1151132 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 78934560 78934824 78934693 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 880141 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr3 85011127 85011790 85011174 Y NA CADM2 NA NA NA NA CADM2 4995 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 85071263 85071596 85071400 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 65131 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 85094285 85094567 85094426 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 88153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 85158641 85158936 85158716 Y CADM2 NA NA NA NA NA CADM2 152509 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 85580627 85580764 85580696 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 574495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 86278242 86278583 86278337 Y NA NA NA NA NA NA VGLL3 759686 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 38969 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 87038753 87038992 87038799 Y VGLL3 VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 484 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 87336210 87336427 87336319 Y NA NA CGGBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CHMP2B 61789 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 88151728 88152092 88151734 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA C3orf38 44801 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr3 88211290 88211624 88211397 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 14255 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 88255753 88255858 88255769 Y HTR1F NA NA NA NA NA CGGBP1 58718 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 89163442 89163800 89163560 Y NA EPHA3 NA NA NA NA EPHA3 8768 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.52947630163455 chr3 97509307 97509490 97509360 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27942 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 98272798 98273262 98273095 Y OR5H6,OR5H2,GPR15 CLDND1,GPR15,CPOX NA NA NA NA GPR15 24055 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 99570772 99571127 99571120 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 260230 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 99575221 99575605 99575379 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 255752 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 99579150 99579217 99579184 Y FILIP1L NA NA NA NA NA FILIP1L 252140 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 251621 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 99582587 99582828 99582708 Y FILIP1L NA NA NA NA NA FILIP1L 248529 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 99782957 99783256 99783070 Y NA FILIP1L TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 48101 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 101424395 101424716 101424556 Y NA ZBTB11,RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 16053 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 101617563 101618145 101617662 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 72728 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 101657359 101657748 101657478 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 112524 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 103522825 103523125 103522973 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 646021 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 105626736 105626952 105626872 Y NA CBLB NA NA NA NA CBLB 40340 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 111185648 111185911 111185780 Y NA NA NA NA NA NA PLCXD2 205612 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 113078924 113079182 113079053 Y NA NA NA NA NA NA BOC 151074 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA NA NA NA NA NA RP11-435F17.1 71167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 114798123 114798367 114798245 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 541804 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 114998646 114998840 114998743 Y NA NA GAP43 IMR90 Hi-C 24141950 GAP43 341331 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 115345321 115345682 115345589 Y GAP43 GAP43 NA NA NA NA GAP43 5150 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 163092 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 117175008 117175053 117175027 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 431463 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 119644387 119644860 119644721 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 166404 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 119809073 119809433 119809278 Y NA GSK3B,RP11-18H7.1 NA NA NA NA GSK3B 1831 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 120167583 120167922 120167648 Y NA FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 178 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr3 120279186 120279582 120279384 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 33574 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 121539764 121539854 121539811 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 12072 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 121966391 121966530 121966436 Y GOLGB1,EAF2,CD86,PARP9,PARP9,PARP9,PARP14,KPNA1,DTX3L,CSTA NA NA NA NA NA CSTA 75561 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 122467278 122467457 122467368 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 43214 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 122493180 122493752 122493620 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 16919 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 123131610 123131782 123131703 Y MYLK,ADCY5,ADCY5 ADCY5 NA NA NA NA ADCY5 34823 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 123229622 123229815 123229688 Y NA NA NA NA NA NA ADCY5 63017 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 123376969 123377163 123377136 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 74580 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 123391718 123392030 123392015 Y ADCY5,MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 89329 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 123782092 123782280 123782136 Y NA NA KALRN,ROPN1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 103528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 124221645 124221997 124221821 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 225216 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 125231315 125231583 125231558 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 5458 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 125235229 125235600 125235483 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 1441 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA SLC41A3 108923 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr3 125712652 125712829 125712741 Y NA NA NA NA NA NA SLC41A3 105575 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 125986265 125986571 125986320 Y NA NA KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37 IMR90 Hi-C 24141950 SLC41A3 167861 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 126108107 126108472 126108304 Y NA NA KLF15,CCDC37,ALDH1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZXDC 84290 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 126359707 126359720 126359714 Y NA TXNRD3NB,TXNRD3 NA NA NA NA TXNRD3 12278 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 280334 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr3 127404993 127405883 127405741 Y MGLL ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 15215 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 GATA2 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GATA2 6492 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 128337505 128337705 128337543 Y KIAA1257,GP9 NA NA NA NA NA RPN1 60213 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 128338287 128338590 128338558 Y RAB7A NA NA NA NA NA RPN1 59328 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 128564550 128565114 128564776 Y DNAJB8,KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 31325 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA KIAA1257 NA NA NA NA KIAA1257 26306 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 129572979 129573244 129573238 Y NA TMCC1 NA NA NA NA TMCC1 37175 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 132164768 132165015 132164817 Y DNAJC13 DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 30398 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 134031444 134031760 134031541 Y NA RPL39P5 ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,AMOTL2,CEP63 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL39P5 41643 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 134068231 134068586 134068519 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 4817 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 134069780 134070244 134070081 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 3159 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 134181248 134181600 134181434 Y NA CEP63,ANAPC13 NA NA NA NA CEP63 20985 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 135827453 135827844 135827484 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 86239 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 135828343 135828732 135828538 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 85351 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 136153802 136154197 136154172 Y NA NA NA NA NA NA PCCB 186654 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 136427457 136427837 136427826 Y STAG1 STAG1 NA NA NA NA STAG1 41383 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 136466232 136466235 136466234 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 2985 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 137768870 137769254 137769106 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 63406 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 137938227 137938395 137938336 Y ARMC8 DBR1,ARMC8 NA NA NA NA ARMC8 34118 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 138438822 138439037 138438988 Y PRR23C NA NA NA NA NA PIK3CB 112743 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 138634319 138634690 138634472 Y NA FOXL2,C3orf72 ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXL2 29292 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 139112882 139113199 139113129 Y PRR23B,PRR23C COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA RP11-319G6.1 6225 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 139824639 139824888 139824698 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 172612 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 140919701 140920097 140919901 Y NA ACPL2 NA NA NA NA ACPL2 25471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 141173878 141174028 141173977 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 29861 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 141240287 141240651 141240396 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 36398 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 141316631 141317016 141316779 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 112742 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 141319185 141319480 141319327 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 115296 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 142164400 142165110 142164972 Y XRN1 RNU1-100P NA NA NA NA XRN1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 142723898 142724007 142723903 Y NA U2SURP NA NA NA NA U2SURP 42559 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 144134299 144134312 144134306 Y NA NA NA NA NA NA SLC9A9 568926 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 146686002 146686397 146686202 Y NA NA NA NA NA NA ZIC1 422812 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 146745799 146745822 146745813 Y NA NA NA NA NA NA ZIC1 363387 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.64445249716339 chr3 146955604 146955955 146955778 Y NA NA NA NA NA NA ZIC1 153254 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr3 147016506 147016766 147016597 Y NA NA NA NA NA NA ZIC1 92443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 147072976 147073090 147073034 Y NA ZIC1,ZIC4 NA NA NA NA ZIC1 36119 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.72464293293265 chr3 147142201 147142415 147142327 Y ZIC4,ZIC4,ZIC4,ZIC1 ZIC1,ZIC4 NA NA NA NA ZIC4 19554 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 147290616 147291014 147290824 Y NA NA NA NA NA NA ZIC4 167969 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr3 147663875 147664087 147663997 Y NA RP11-71N10.1 NA NA NA NA RP11-71N10.1 8084 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr3 149151278 149151442 149151363 Y NA NA GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-278L15.6 59005 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 149339543 149339560 149339552 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 112941 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 149902049 149902225 149902137 Y NA NA PFN2,LOC646903,TSC22D2,RNF13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 135474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 150102610 150102865 150102834 Y SIAH2,SERP1,TSC22D2 TSC22D2 PFN2,RNF13,TSC22D2,SERP1,EIF2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 21257 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 150453151 150453509 150453478 Y CLRN1 RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 24215 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 152121454 152121974 152121660 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 136110 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 155281187 155281565 155281523 Y NA NA NA NA NA NA PLCH1 179291 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 155382767 155382896 155382833 Y NA NA NA NA NA NA PLCH1 77960 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 156229646 156229758 156229715 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 41215 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 156480605 156480801 156480703 Y NA PA2G4P4 NA NA NA NA PA2G4P4 45720 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 156558833 156558838 156558836 Y NA PA2G4P4,LEKR1 NA NA NA NA LEKR1 17563 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 157935893 157935900 157935896 Y NA NA NA NA NA NA RSRC1 114249 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 72930 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 160735129 160735256 160735193 Y NA NA NA NA NA NA NMD3 85228 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA B3GALNT1 128013 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 163153271 163153291 163153281 Y NA NA NA NA NA NA RP11-85M11.2 1769457 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 165215973 165216343 165216172 Y NA NA NA NA NA NA RP11-85M11.2 293225 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 167990404 167990484 167990444 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 178641 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN NA NA NA NA TERC 1241 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 169502698 169502873 169502785 Y GPR160,MYNN,LRRC34 TERC,MYNN NA NA NA NA MYNN 14079 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 170137645 170137870 170137713 Y SLC7A14,CLDN11,CLDN11 CLDN11 NA NA NA NA CLDN11 2992 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 170584649 170585013 170584680 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 1259 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 170975109 170975430 170975328 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 200767 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 171580984 171581341 171581163 Y NA NA NA NA NA NA PLD1 54244 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 171594447 171594730 171594655 Y NA NA NA NA NA NA PLD1 67707 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 171853185 171854055 171853751 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 97767 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 171935922 171936083 171936003 Y FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 180504 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2,RNU4-4P NA NA NA NA RNU4-4P 2089 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 173071500 173071510 173071505 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-4P 559152 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 176276751 176276920 176276836 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 636341 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 176776147 176776153 176776150 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 137108 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 176988907 176989274 176989091 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 75646 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr3 177018025 177018414 177018104 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 104764 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 177038616 177038888 177038742 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 118821 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00578 79625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 177168818 177169119 177168967 Y NA LINC00578 TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00578 11109 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 177170399 177170552 177170483 Y NA LINC00578 TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00578 12690 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 177181725 177182062 177181754 Y NA LINC00578 TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 24016 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 177234134 177234201 177234168 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 76425 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 177297513 177297662 177297588 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 139804 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 177303534 177303876 177303705 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 145825 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 177332842 177333173 177332964 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 175133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 177383116 177383499 177383118 Y NA NA NA NA NA NA LINC00578 225407 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr3 177434552 177434810 177434802 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-2L8.1 215801 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 177472457 177472684 177472465 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-2L8.1 177927 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 177623365 177623625 177623388 Y NA RP11-2L8.1 TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-2L8.1 26986 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 177979552 177979945 177979765 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33A14.1 121260 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr3 178236932 178237225 178237103 Y KCNMB2,KCNMB2 NA KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-33A14.1 135727 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 178432864 178433172 178432931 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33A14.1 331659 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 178532692 178532946 178532777 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 255121 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 180590296 180590653 180590471 Y NA FXR1 NA NA NA NA FXR1 6367 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 182285595 182285736 182285666 Y NA NA NA NA NA NA ATP11B 223552 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 182642205 182642465 182642335 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D1 59276 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 185821581 185821963 185821920 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 4144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 185900125 185900504 185900315 Y NA NA NA NA NA NA ETV5 74018 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 185905496 185905742 185905693 Y NA NA NA NA NA NA ETV5 79389 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 186200833 186200839 186200836 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB11 82353 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 186490704 186490868 186490793 Y ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2 EIF4A2,RFC4 NA NA NA NA EIF4A2 8126 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 186819692 186820086 186819740 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 76610 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 187883507 187883633 187883573 Y NA LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 13662 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 187901313 187901616 187901372 Y NA LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 31468 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 188014586 188014976 188014809 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 144741 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 188108744 188109051 188108899 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 238899 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 188953015 188953026 188953020 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 289587 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 189034066 189034494 189034299 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 370638 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 190251387 190251779 190251471 Y CLDN1 NA NA NA NA NA CLDN1 213123 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 190336230 190336434 190336308 Y IL1RAP NA NA NA NA NA CLDN1 297966 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 190956161 190956506 190956333 Y NA OSTN NA NA NA NA OSTN 41131 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 191620991 191621297 191621143 Y PYDC2 NA NA NA NA NA CCDC50 576125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 191782024 191782374 191782199 Y NA NA NA NA NA NA FGF12 701179 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 191873125 191873377 191873252 Y NA NA NA NA NA NA FGF12 610176 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 192414098 192414374 192414109 Y NA NA NA NA NA NA FGF12 69179 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 192428387 192428496 192428432 Y NA NA NA NA NA NA FGF12 55057 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr3 194210438 194211060 194210799 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 6033 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 194820742 194820949 194820800 Y PPP1R2,ACAP2 NA NA NA NA NA XXYLT1 168947 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 194871039 194871493 194871089 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 118403 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 194875742 194876159 194875826 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 113737 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 90614 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 195628817 195629072 195628853 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 177988 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 195632869 195633225 195632990 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2 NA NA NA NA NA TFRC 173835 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 195633702 195634304 195633876 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 NA NA NA NA NA TFRC 172756 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 196208308 196208582 196208445 Y NA RNF168 NA NA NA NA RNF168 20057 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 196255741 196255873 196255820 Y NA RNF168,FBXO45,WDR53 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 27102 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 196757369 196757726 196757658 Y LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2 AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 2682 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 197254564 197254715 197254640 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 43479 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 197301708 197302062 197301885 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 3514 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 43553 43799 43797 Y ZNF141 ZNF595 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF595 7380 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 330052 330352 330160 Y NA ZNF732,ZNF141 NA NA NA NA ZNF141 449 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 867282 867339 867287 Y NA CPLX1 NA NA NA NA CPLX1 49296 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 991255 991645 991565 Y ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175 DGKQ,IDUA,FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 10079 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr4 1129933 1130282 1130090 Y NA RNF212 RNF212,TMED11P,KIAA1530,SPON2,CTBP1,C4orf42,MAEA,FAM53A,SLBP IMR90 Hi-C 24141950 RNF212 24583 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 1184509 1184886 1184846 Y RNF212,CRIPAK NA NA NA NA NA CTBP1 56855 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr4 1237849 1238004 1237927 Y NA CTBP1,MAEA NA NA NA NA CTBP1 3737 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 1339592 1340250 1339850 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57953 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 1838846 1839065 1839018 Y FGFR3,NAT8L LETM1,WHSC1 NA NA NA NA LETM1 16909 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 1875191 1875366 1875328 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 4040 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 1966776 1967112 1967086 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 7251 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 1970462 1970680 1970571 Y NA SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 3683 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr4 2691649 2691991 2691819 Y NA NA NA NA NA NA TNIP2 64112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 3203733 3204143 3203890 Y SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT NA NA NA NA NA RGS12 88612 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 3872963 3873310 3873200 Y NA NA LOC100133461,FAM86EP,FLJ35424,ADRA2C IMR90 Hi-C 24141950 FAM86EP 81836 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 4272259 4272533 4272507 Y ZBTB49 TMEM128,LYAR,ZBTB49 NA NA NA NA LYAR 17363 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 4577048 4577566 4577357 Y NA STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 34975 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 4855584 4855774 4855697 Y NA MSX1 MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 MSX1 3619 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 5884684 5884906 5884686 Y NA CRMP1 EVC IMR90 Hi-C 24141950 CRMP1 7879 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 6171393 6171654 6171618 Y CRMP1 JAKMIP1 NA NA NA NA JAKMIP1 28664 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 6172675 6172972 6172793 Y NA JAKMIP1 NA NA NA NA JAKMIP1 27346 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 6223621 6224023 6223692 Y PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1 JAKMIP1,WFS1 NA NA NA NA JAKMIP1 23303 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.72464293293265 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA PPP2R2C,MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 6919401 6919899 6919549 Y MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 10432 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 7012933 7013112 7013014 Y NA TADA2B,CCDC96 NA NA NA NA TADA2B 28514 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 7664726 7665176 7664945 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 274477 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 7969878 7969938 7969908 Y SH3TC1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 30225 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 8411022 8411421 8411226 Y NA ACOX3 NA NA NA NA ACOX3 29029 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr4 10182678 10183260 10182921 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 66105 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr4 13250215 13250573 13250395 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 82465 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 13439753 13439937 13439845 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 44052 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 13484540 13485001 13484899 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 551 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr4 14401453 14401769 14401584 Y NA NA NA NA NA NA CPEB2 600529 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 14439704 14439728 14439717 Y NA NA NA NA NA NA CPEB2 562570 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 15553738 15553982 15553851 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 84249 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 15783833 15784027 15783892 Y CD38 NA NA NA NA NA RP11-115L11.1 52583 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 16440383 16440394 16440389 Y NA NA QDPR,PROM1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS21P4 184205 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 16735880 16736127 16736004 Y NA NA NA NA NA NA RPS21P4 479702 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 17829390 17829398 17829394 Y CLRN2,NCAPG DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 18865 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 17853657 17853735 17853696 Y NA DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 43132 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 17979858 17980211 17980206 Y CLRN2,LCORL LCORL NA NA NA NA LCORL 41288 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 19572039 19572379 19572208 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 115422 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 19620943 19621209 19621076 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 164326 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 20340711 20340985 20340805 Y NA NA NA NA NA NA SLIT2 87828 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr4 20445202 20445303 20445235 Y KCNIP4 NA NA NA NA NA SLIT2 192319 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr4 20521707 20522059 20521739 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 173846 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 20757566 20757961 20757877 Y KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA PACRGL 61661 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 22968837 22968993 22968915 Y NA NA NA NA NA NA CDC42P6 241264 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 24471602 24472014 24471897 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 112159 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 24913671 24913932 24913802 Y CCDC149 NA NA NA NA NA CCDC149 65894 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 25402341 25402497 25402460 Y NA ANAPC4 NA NA NA NA ANAPC4 25506 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 25881877 25882168 25881954 Y RBPJ,SLC34A2,SEL1L3 SEL1L3 C4orf52,SEL1L3 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L3 18495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 26077794 26078229 26078077 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 84848 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 26114173 26114191 26114182 Y SLC34A2 RBPJ RBPJ,TBC1D19 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 48886 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 26123354 26123506 26123386 Y NA RBPJ RBPJ,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 39571 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 26888311 26888739 26888468 Y NA STIM2,RP11-293A21.1 NA NA NA NA RP11-293A21.1 28090 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 30719661 30720023 30719741 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 14 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 36131031 36131404 36131217 Y ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 112727 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 37244545 37244895 37244720 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 441103 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 38735219 38735515 38735398 Y NA NA KLF3,TBC1D1,FLJ13197 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-617D20.1 70715 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 39316114 39316675 39316347 Y NA RFC1 NA NA NA NA RFC1 49320 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 40050527 40050740 40050634 Y NA N4BP2 NA NA NA NA N4BP2 5706 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 40533771 40533999 40533881 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 215915 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 40765283 40765623 40765452 Y RBM47 NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 15369 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 42073690 42073968 42073740 Y NA NA NA NA NA NA BEND4 78927 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 48700290 48700744 48700528 Y NA NA NA NA NA NA FRYL 79595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 57278248 57278433 57278373 Y NA AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA PPAT 21348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 61914465 61914653 61914582 Y NA NA NA NA NA NA RP11-621K7.1 724915 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 71638038 71638166 71638102 Y NA NA NA NA NA NA GRSF1 65496 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 75193538 75194041 75193691 Y CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG NA NA NA NA NA MTHFD2L 215647 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 76623783 76624179 76623867 Y RCHY1,G3BP2,G3BP2 G3BP2,USO1 NA NA NA NA G3BP2 23530 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 77133814 77134170 77133987 Y NAAA,CXCL10,CXCL11 SCARB2,FAM47E NA NA NA NA FAM47E 621 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 78656019 78656351 78656260 Y NA NA NA NA NA NA CNOT6L 82418 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 78711096 78711128 78711114 Y NA CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 27641 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 79450278 79450622 79450544 Y NA NA ANXA3 IMR90 Hi-C 24141950 BMP2K 244874 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 80900549 80900754 80900650 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 143854 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr4 84138724 84139183 84138985 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,AGPAT9,PLAC8,PLAC8 NA PLAC8,COPS4,COQ2 IMR90 Hi-C 24141950 COQ2 64884 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 85668684 85668904 85668818 Y NA NA NA NA NA NA CDS1 166552 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 85798168 85798515 85798434 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 87023 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 85799806 85800014 85799906 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 85524 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 88074850 88075090 88074969 Y DSPP NA NA NA NA NA KLHL8 84376 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 88408034 88408084 88408060 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 66300 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 88670885 88671377 88671233 Y NA NA NA NA NA NA SPP1 223442 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 89202679 89202817 89202765 Y NA PPM1K NA NA NA NA PPM1K 1104 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 89713529 89713901 89713721 Y HERC6,HERC5 NA FAM13A-AS1,NAP1L5,HERC3 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L5 96143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 90837558 90837802 90837628 Y NA MMRN1 NA NA NA NA MMRN1 38875 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 102131266 102131303 102131283 Y NA NA NA NA NA NA PPP3CA 136132 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 102153053 102153484 102153407 Y NA NA NA NA NA NA PPP3CA 113951 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 102173679 102174077 102173884 Y NA NA NA NA NA NA PPP3CA 93358 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 103483964 103484649 103484311 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1 NA NA NA NA NA NFKB1 63478 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 103678847 103679008 103678977 Y NA MANBA NA NA NA NA MANBA 1143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 103701783 103702159 103702029 Y NA MANBA,RP11-10L12.4 NA NA NA NA MANBA 21632 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 103788773 103788886 103788830 Y NA RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA CISD2 638 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 106362976 106363368 106363172 Y NA PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 29870 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 106391866 106392288 106392204 Y TET2,TET2 PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 950 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 107955286 107955747 107955665 Y DKK2 NA NA NA NA NA DKK2 247216 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 109078014 109078240 109078233 Y NA NA NA NA NA NA HADH 169144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 109282356 109282522 109282494 Y NA NA LOC641518,LEF1,HADH IMR90 Hi-C 24141950 RPL34-AS1 257094 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 110449545 110449722 110449703 Y SEC24B CCDC109B CCDC109B IMR90 Hi-C 24141950 CCDC109B 29639 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 31502 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr4 113172339 113172711 113172527 Y NEUROG2 AP1AR,TIFA NA NA NA NA AP1AR 21446 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 113956940 113957168 113957054 Y NA NA NA NA NA NA ANK2 219675 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 113979855 113980234 113980217 Y NA NA NA NA NA NA ANK2 242590 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 114104327 114104616 114104364 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA RNU1-138P 234863 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr4 119115424 119115493 119115457 Y NA NA NA NA NA NA SNHG8 82371 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 119629667 119629850 119629760 Y NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 25144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 120444503 120444790 120444647 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 70557 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 121812608 121812671 121812657 Y NA PRDM5 NA NA NA NA PRDM5 29354 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 125634465 125634726 125634691 Y NA ANKRD50 NA NA NA NA ANKRD50 2578 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 129244135 129244496 129244419 Y NA PGRMC2 PGRMC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 36151 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 129965980 129966229 129966106 Y NA C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA C4orf33 46243 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 130012970 130013118 130013063 Y PHF17,SCLT1,C4orf33 C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA SCLT1 206 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 136676289 136676491 136676390 Y NA NA NA NA NA NA RPS23P2 1690750 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 139182736 139183009 139182873 Y SLC7A11 SLC7A11,LINC00499 SLC7A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC7A11 21233 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr4 139313832 139314247 139314105 Y NA NA NA NA NA NA LINC00499 84967 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 139327385 139327721 139327507 Y SLC7A11 NA NA NA NA NA LINC00499 98520 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 140656102 140656508 140656327 Y MAML3 NA NA NA NA NA SETD7 130249 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 140897225 140897350 140897279 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 175988 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 141287573 141287758 141287638 Y NA RP11-425I13.1 NA NA NA NA RP11-425I13.1 1558 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 141862209 141862476 141862343 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D9 186935 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 145570882 145571097 145570988 Y NA HHIP,HHIP-AS1 NA NA NA NA HHIP 5709 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr4 146015172 146015244 146015208 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 1840 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 146024258 146024314 146024286 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ANAPC10 6565 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 148426409 148426782 148426596 Y NA EDNRA NA NA NA NA EDNRA 26340 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 148729482 148729491 148729487 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 78268 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 151146456 151146697 151146576 Y DCLK2 NA NA NA NA NA DCLK2 149030 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 151264145 151264674 151264371 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 266719 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 151405544 151405555 151405550 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 408118 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 152047125 152047385 152047255 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 28400 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 153265183 153265560 153265526 Y FBXW7 NA NA NA NA NA FBXW7 189693 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA MND1 92997 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 154347723 154347988 154347804 Y RNF175,KIAA0922 KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 37510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 154408922 154409996 154409474 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 23424 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 155239135 155239272 155239204 Y NA NA NA NA NA NA DCHS2 171658 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 157397521 157397868 157397695 Y NA NA GRIA2,PDGFC,GLRB IMR90 Hi-C 24141950 PDGFC 492678 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 157692679 157692824 157692748 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 197722 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 157718385 157718680 157718607 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 171866 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 157811355 157811573 157811537 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 78973 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 157860997 157861294 157861204 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 29252 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 157863056 157863372 157863345 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 27174 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr4 157866755 157867028 157866930 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 23518 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 157867687 157867968 157867878 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 22578 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr4 157889828 157890031 157889884 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 515 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr4 159103850 159104073 159103996 Y NA FAM198B NA NA NA NA FAM198B 11380 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr4 159742407 159742876 159742571 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 54117 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 160191202 160191310 160191258 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 502912 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr4 160195976 160196239 160196029 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 507686 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr4 160199508 160199928 160199727 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 511218 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 164471489 164471679 164471583 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 385416 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 165882303 165882624 165882495 Y CPE,C4orf39 RP11-366M4.2,NACA3P NA NA NA NA NACA3P 19861 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr4 169017252 169017480 169017407 Y ANXA10 NA NA NA NA NA DDX60 220478 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 169375795 169375933 169375918 Y NA PALLD NA NA NA NA PALLD 40284 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 170548136 170548389 170548218 Y NEK1,CLCN3 NEK1,CLCN3 C4orf27 IMR90 Hi-C 24141950 CLCN3 16352 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 170570348 170570457 170570384 Y NA NEK1,CLCN3 NA NA NA NA CLCN3 38564 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 172774003 172774328 172774166 Y GALNTL6 GALNTL6 NA NA NA NA GALNTL6 42598 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 173889872 173890124 173889998 Y NA NA NA NA NA NA GALNT7 197780 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 174112212 174112389 174112298 Y NA GALNT7 NA NA NA NA GALNT7 24308 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 174399736 174400115 174399926 Y NA HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2-AS1 46306 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 174443845 174444302 174443959 Y HAND2 HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2-AS1 2119 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr4 175281816 175282139 175281824 Y CEP44,CEP44,FBXO8 NA NA NA NA NA FBXO8 78401 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 176814255 176814522 176814389 Y GPM6A,GPM6A NA NA NA NA NA SPCS3 424593 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 178362238 178362457 178362307 Y NA AGA,RP11-130F10.1 NA NA NA NA AGA 581 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 183397757 183397986 183397872 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 333355 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 183439666 183439879 183439717 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 375264 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 183481652 183481875 183481779 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 355214 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 183568083 183568352 183568218 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 268737 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 183727349 183727751 183727542 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 109338 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 184042355 184042696 184042526 Y NA WWC2 NA NA NA NA WWC2 23909 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 184208528 184208558 184208557 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIP 155186 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 184643961 184644129 184644061 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC11 65541 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 184686793 184687036 184687011 Y NA NA ENPP6 IMR90 Hi-C 24141950 TRAPPC11 108373 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 277975 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 185338413 185338600 185338537 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 55134 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 185589829 185589977 185589872 Y ACSL1,IRF2 CASP3 NA NA NA NA CASP3 21166 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 185609676 185609967 185609740 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 41013 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 185613623 185613900 185613762 Y CCDC111 CASP3 NA NA NA NA CASP3 44960 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr4 187027199 187027350 187027289 Y SORBS2,FAM149A FAM149A NA NA NA NA FAM149A 3626 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 187591076 187591113 187591095 Y NA NA NA NA NA NA FAT1 54763 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 187834148 187834163 187834155 Y NA NA FAT1,LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 188272 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 190485123 190485226 190485156 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 93004 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr5 208612 208991 208802 Y PLEKHG4B CCDC127,SDHA NA NA NA NA CCDC127 7339 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 379590 379862 379712 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 61396 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 656184 656577 656381 Y SLC9A3,ZDHHC11,TPPP CEP72,TPPP NA NA NA NA TPPP 34933 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 671573 671920 671762 Y TPPP TPPP NA NA NA NA TPPP 19590 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA NKD2 NA NA NA NA NKD2 34652 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 1111223 1111556 1111501 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 1073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 1468056 1468058 1468057 Y NA NA NA NA NA NA LPCAT1 54034 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 3595085 3595457 3595281 Y NA IRX1 NA NA NA NA IRX1 917 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 5026027 5026363 5026168 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 392414 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 5423578 5423857 5423693 Y KIAA0947 KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 4801 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 7.01354792725943 chr5 8981221 8981557 8981405 Y NA NA SEMA5A IMR90 Hi-C 24141950 SEMA5A 562630 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 9681641 9681655 9681648 Y NA NA TAS2R1 IMR90 Hi-C 24141950 SNHG18 137329 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 10303912 10303996 10303954 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA CMBL 2142 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 10371627 10371888 10371758 Y NA MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 19812 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 14251046 14251256 14251151 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 109235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 15451801 15451916 15451863 Y NA FBXL7 FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXL7 46389 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 17157273 17157661 17157421 Y NA NA NA NA NA NA BASP1 93566 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 17224986 17225514 17225115 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 118211 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 24132806 24133151 24133050 Y NA NA NA NA NA NA CDH10 509936 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 24272966 24273308 24273185 Y NA NA NA NA NA NA CDH10 369779 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 24498008 24498123 24498090 Y NA NA NA NA NA NA CDH10 144964 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 29796154 29796219 29796166 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 1255453 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 32283224 32283342 32283283 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 27773 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 32592950 32593432 32593186 Y NA NA NA NA NA NA SUB1 63211 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 34949030 34949157 34949062 Y NA BRIX1,RAD1,DNAJC21 NA NA NA NA DNAJC21 21332 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 36273940 36274217 36274107 Y NA RANBP3L NA NA NA NA RANBP3L 25999 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 36277104 36277309 36277165 Y NA RANBP3L NA NA NA NA RANBP3L 22907 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 36277859 36278299 36278119 Y NA RANBP3L NA NA NA NA RANBP3L 21917 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP6 53296 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 37209037 37209204 37209072 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 38326 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 38446340 38446486 38446390 Y EGFLAM NA NA NA NA NA MIR3650 109177 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 38680372 38680698 38680535 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 73916 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 39399549 39400018 39399831 Y NA NA NA NA NA NA DAB2 60384 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 40499200 40499389 40499295 Y NA NA NA NA NA NA PTGER4 178211 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 40735267 40735522 40735406 Y NA TTC33 NA NA NA NA TTC33 18555 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 40754670 40754884 40754791 Y PTGER4 TTC33,PRKAA1 NA NA NA NA TTC33 593 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 40796420 40796758 40796693 Y NA TTC33,RPL37 NA NA NA NA PRKAA1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 42949793 42950117 42950048 Y ZNF131,C5orf39 NA LOC648987,LOC153684 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2035E11.3 66414 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 21185 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 43105884 43106284 43106088 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC153684,LOC100132356,ZNF131 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2201E18.3 40363 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 43498058 43498404 43498231 Y NA C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34 C5orf28 MCF7 ChIA-PET 22265404 C5orf34 14843 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 49989954 49990143 49990051 Y EMB,PARP8 PARP8 NA NA NA NA PARP8 30221 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 50263404 50263601 50263575 Y ISL1 NA NA NA NA NA PARP8 303671 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 52094372 52094720 52094546 Y NA ITGA1,PELO NA NA NA NA PELO 12598 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 53298305 53298413 53298402 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 305999 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 54731133 54731267 54731160 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 93262 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 54964345 54964561 54964453 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A9 102461 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 57112814 57113117 57112881 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 640970 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 57113843 57113952 57113898 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 640135 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 57117655 57118000 57117917 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 636087 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58134614 58134758 58134713 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 258566 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58232883 58233370 58233101 Y PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 356835 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 25.1797868208167 chr5 58316206 58316509 58316424 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 440158 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58317891 58318186 58317997 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 441843 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 58332286 58332474 58332297 Y PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 456238 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 483836 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 58375824 58376057 58376052 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 499776 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58400134 58400374 58400226 Y PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 524086 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr5 58408149 58408473 58408383 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 532101 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58418380 58418697 58418552 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 542332 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58420146 58420252 58420199 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 544098 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58421119 58421626 58421279 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 545071 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 58423311 58423752 58423511 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 547263 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58426345 58426806 58426483 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 550297 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58445128 58445519 58445324 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 569080 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58508843 58508938 58508881 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 632795 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 58575824 58576193 58576112 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 699776 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58798066 58798450 58798258 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 922018 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58874550 58874813 58874554 Y NA NA NA NA NA NA PART1 906727 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 58951498 58952014 58951831 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PART1 829526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 59042319 59042506 59042428 Y PDE4D NA NA NA NA NA PART1 739034 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 59056590 59056824 59056644 Y NA NA NA NA NA NA PART1 724716 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 59505321 59505489 59505391 Y NA NA NA NA NA NA PART1 276051 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 60258688 60258981 60258835 Y NA ERCC8,NDUFAF2 NA NA NA NA NDUFAF2 19732 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 64056126 64056496 64056311 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 6016 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 64062726 64062917 64062822 Y NA SREK1IP1 NA NA NA NA CWC27 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 64572544 64572695 64572620 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 203052 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 64710773 64711167 64710966 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 64580 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 65447669 65447962 65447814 Y SREK1,SREK1 SREK1 NA NA NA NA SREK1 13870 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 66016454 66016847 66016518 Y NA NA NA NA NA NA SREK1 582655 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 66117932 66118220 66117961 Y NA NA NA NA NA NA SREK1 684133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 67294770 67295126 67294965 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 214422 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 70772003 70772134 70772073 Y NA BDP1 NA NA NA NA BDP1 22561 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 71462643 71462861 71462688 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 61582 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 71597463 71597663 71597590 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA PTCD2 16531 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 71852331 71852540 71852377 Y NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 237858 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 71852712 71853181 71852905 Y TNPO1 NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 238239 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 74800476 74800595 74800536 Y NA POLK,COL4A3BP NA NA NA NA POLK 4986 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 76422152 76422524 76422338 Y NA ZBED3-AS1,ZBED3 NA NA NA NA ZBED3 41004 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 77147501 77147797 77147637 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 14807 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 77589539 77589820 77589680 Y AP3B1 AP3B1 NA NA NA NA AP3B1 960 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 77792703 77793028 77792954 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 138364 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 77837654 77837953 77837804 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2073O6.1 171952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 77843471 77844086 77843723 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA CTD-2073O6.1 165819 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 78744780 78744887 78744834 Y NA NA NA NA NA NA RP11-342F17.1 59370 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 78993167 78993488 78993350 Y THBS4,CMYA5 NA NA NA NA NA PAPD4 87224 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 79428091 79428419 79428255 Y SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 121479 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 80216788 80217158 80217017 Y NA NA RASGRF2,MSH3 IMR90 Hi-C 24141950 DHFR 267986 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 80989989 80990372 80990282 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 55244 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 81465137 81465359 81465307 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA RPS23 107037 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 81655341 81655441 81655346 Y NA NA VCAN,ATP6AP1L,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 82945 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 81934356 81934439 81934367 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 361960 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 82005927 82005935 82005931 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA XRCC4 365382 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 82664194 82664491 82664355 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA VCAN 100793 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 82769254 82769739 82769524 Y VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 3970 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 83018086 83018575 83018426 Y NA HAPLN1 NA NA NA NA HAPLN1 2654 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 83642905 83643068 83642987 Y NA CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 35177 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 86610420 86610785 86610768 Y NA RASA1 NA NA NA NA RASA1 48715 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 86662563 86662890 86662661 Y RASA1,RASA1 CCNH NA NA NA NA CCNH 43946 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 87956632 87957169 87956907 Y MEF2C,MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C 240753 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 87967371 87967797 87967486 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C 230125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 88125046 88125161 88125149 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C 72761 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 90354334 90354731 90354568 Y ARRDC3 NA NA NA NA NA RNU4-90P 209813 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 90772639 90772960 90772848 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 95463 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 91015868 91016069 91015978 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 338692 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 92914746 92915169 92914912 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 1874 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr5 92932600 92932748 92932677 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 15557 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 92932960 92933102 92933051 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 15917 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 10.8077623797113 chr5 92935260 92935353 92935337 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 18217 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 92949916 92950260 92950088 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 32873 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 92958001 92958327 92958133 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 40958 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 93304446 93304744 93304683 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 140660 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr5 93316390 93316647 93316523 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 128757 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 93434612 93434657 93434635 Y NA FAM172A NA NA NA NA FAM172A 10747 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 94049532 94049756 94049644 Y KIAA0825 NA NA NA NA NA KIAA0825 97223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr5 95427654 95427940 95427807 Y GLRX,ELL2 NA NA NA NA NA ELL2 131879 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB 72968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr5 103048573 103048840 103048666 Y NA NA NA NA NA NA NUDT12 152079 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 103465253 103465580 103465434 Y NA NA NA NA NA NA NUDT12 568759 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 103559627 103559775 103559695 Y NA NA NA NA NA NA NUDT12 663133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 10.8077623797113 chr5 106803068 106803432 106803267 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 201164 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 106803890 106804202 106804046 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 200394 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 106806041 106806198 106806107 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 198398 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 106878561 106878904 106878854 Y EFNA5 NA NA NA NA NA EFNA5 125692 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 106906858 106907181 106907119 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97415 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 107004755 107005118 107004922 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 159 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 107555103 107555441 107555272 Y NA NA NA NA NA NA FBXL17 160358 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 108071450 108071807 108071776 Y FER FER FER IMR90 Hi-C 24141950 FER 9716 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 110057836 110058086 110057958 Y NA SLC25A46 NA NA NA NA SLC25A46 13751 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr5 112383528 112383665 112383560 Y DCP2,YTHDC2 NA NA NA NA NA DCP2 73129 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 112585948 112586168 112586156 Y MCC NA NA NA NA NA MCC 236359 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 114623111 114623418 114623265 Y NA PGGT1B,CCDC112 NA NA NA NA CCDC112 7110 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 115420076 115420175 115420113 Y LOC644100 CTD-2287O16.1,COMMD10 NA NA NA NA COMMD10 1388 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 115794810 115794877 115794844 Y COMMD10,SEMA6A NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 101381 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 118592872 118593203 118593036 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 9184 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 118747776 118748171 118748023 Y NA HSD17B4 NA NA NA NA HSD17B4 37967 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 122181959 122182300 122182177 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 4825 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 122542890 122543069 122542980 Y NA NA NA NA NA NA PRDM6 120074 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 124006979 124007355 124007057 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 75145 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 124029260 124029627 124029444 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 52873 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 124042490 124042759 124042619 Y NA ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 39741 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 124077955 124078154 124078062 Y ZNF608 ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 4346 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 124593106 124593253 124593226 Y NA NA NA NA NA NA RP11-436H11.1 450180 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr5 124748569 124748778 124748675 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-436H11.1 605643 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr5 124835679 124835895 124835794 Y NA NA NA NA NA NA RP11-436H11.1 692753 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 124911723 124911866 124911795 Y NA NA NA NA NA NA RP11-436H11.1 768797 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr5 126094157 126094598 126094339 Y LMNB1,LMNB1 RP11-434D11.4,LMNB1 LMNB1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-434D11.4 15580 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 126708435 126708706 126708571 Y NA NA NA NA NA NA MEGF10 83912 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 127211761 127211779 127211769 Y NA NA SLC12A2,FLJ33630,PRRC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A2 205679 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 128959817 128960143 128960025 Y NA NA NA NA NA NA ISOC1 531373 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 130711215 130711396 130711236 Y NA NA NA NA NA NA CDC42SE2 132029 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 130730635 130730890 130730763 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 151449 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 130976279 130976499 130976398 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 7350 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 131430055 131430830 131430575 Y RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1 NA NA NA NA NA ACSL6 84119 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 131450160 131450175 131450167 Y NA NA IL3,ACSL6,CSF2,LOC553103,SLC22A4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL6 104224 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr5 131757211 131757329 131757283 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf56 12883 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 133470244 133470404 133470305 Y NA TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 21842 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 133802349 133802592 133802584 Y PPP2CA,SEC24A,UBE2B NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 56760 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr5 134727973 134728292 134728105 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 5312 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 135357182 135357477 135357330 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 5107 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 135943812 135943901 135943857 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 247416 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 136359479 136359669 136359574 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 168162 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 137785775 137785891 137785836 Y WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2 REEP2,EGR1 NA NA NA NA REEP2 13069 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr5 137908044 137908328 137908223 Y NA ETF1,HSPA9,CTNNA1 NA NA NA NA HSPA9 805 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 138248139 138248403 138248239 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 161141 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 138258617 138258897 138258757 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 171619 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 190951 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 138686401 138686737 138686569 Y NA PAIP2 NA NA NA NA PAIP2 11125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr5 138727034 138727338 138727139 Y LOC389333 SPATA24 NA NA NA NA SPATA24 10439 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr5 139598972 139599011 139598993 Y ANKHD1 NA NA NA NA NA PFDN1 81695 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr5 140457576 140457668 140457630 Y NA PCDHB2 NA NA NA NA PCDHB2 14559 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 140464698 140465034 140464866 Y SLC25A2,PCDHGC4,PCDHGC3,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGB6,PCDHGA9,PCDHGA7,PCDHGA2,PCDHB7,PCDHB6,PCDHB15,PCDHB12,PCDHB10,PCDHAC1,PCDHB1,PCDHB4 PCDHB2,PCDHB5 PCDHB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PCDHB2 7193 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 142157420 142157683 142157517 Y NA ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 9471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 142174878 142175359 142175023 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 26929 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 142315332 142315934 142315386 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 167383 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 142387990 142388251 142388074 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 240041 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 142721389 142721627 142721517 Y NR3C1,NR3C1 RPL7P21 NA NA NA NA RPL7P21 11219 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 142963114 142963248 142963167 Y NR3C1,NR3C1 NA NR3C1,ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 150037 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 145498086 145498488 145498483 Y NA NA NA NA NA NA LARS 61735 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 147777538 147777934 147777556 Y NA RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 16040 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 148869266 148869383 148869317 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 59624 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 149838456 149838698 149838517 Y SYNPO,ZNF300,SLC6A7 RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS14 11137 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr5 150108879 150109189 150109172 Y SYNPO RBM22,DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 27482 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 151943818 151943842 151943829 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 793725 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 154071115 154071211 154071188 Y NA LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90 Hi-C 24141950 LARP1 19251 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 154224391 154224774 154224575 Y NA CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 10339 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 154274946 154275114 154275030 Y NA CNOT8,GEMIN5,MRPL22 NA NA NA NA CNOT8 39833 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 156471573 156471840 156471835 Y NA NA NA NA NA NA HAVCR2 96040 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 156724834 156725095 156724964 Y NA CYFIP2 NA NA NA NA CYFIP2 33745 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 156814689 156815040 156814693 Y NA NA NA NA NA NA CYFIP2 123600 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 158385170 158385443 158385354 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA CTB-11I22.1 249486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr5 162483984 162483999 162483992 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 378333 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 163187606 163187815 163187725 Y NA NA NA NA NA NA MAT2B 259486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 163343940 163344177 163344063 Y NA NA NA NA NA NA MAT2B 415820 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 164820912 164821105 164821007 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 633211 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 167066911 167067143 167066981 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 649513 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 167088894 167089267 167088997 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 627389 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 170060615 170060931 170060764 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 225943 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 170378492 170378604 170378547 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 91618 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA TLX3 71942 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 171432610 171432692 171432660 Y NA FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 733 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 172283530 172283741 172283563 Y NA ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 24252 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 172710965 172711353 172711102 Y NA STC2 ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 STC2 43153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 173031200 173031306 173031275 Y NA BOD1 NA NA NA NA BOD1 10357 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 173125292 173125488 173125398 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1 83629 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 173280521 173280844 173280699 Y NA CPEB4 BOD1,CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 32439 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 173391031 173391183 173391109 Y HMP19 NA NA NA NA NA CPEB4 77748 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 173738914 173739193 173739170 Y HMP19 NA BOD1 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 410343 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr5 174612437 174612450 174612444 Y HRH2 NA NA NA NA NA SFXN1 289615 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 176543923 176544044 176544003 Y TSPAN17,PRR7,DBN1 FGFR4,NSD1 NA NA NA NA NSD1 13982 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 177541057 177541427 177541157 Y N4BP3 N4BP3,RMND5B,NHP2 NA NA NA NA N4BP3 2613 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 177647239 177647603 177647383 Y CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 17731 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 177913220 177913638 177913531 Y COL23A1 NA NA NA NA NA COL23A1 101918 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 178003802 178003988 178003851 Y ZNF454,ZFP2 COL23A1 NA NA NA NA COL23A1 11568 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 178985972 178986151 178986083 Y NA RUFY1 NA NA NA NA RUFY1 10413 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 179038504 179038699 179038602 Y NA HNRNPH1 NA NA NA NA HNRNPH1 21086 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 179453285 179453637 179453562 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 43481 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 179461499 179461900 179461782 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 35218 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 179465387 179465429 179465409 Y MAML1,MGAT4B,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 31689 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 179496400 179496705 179496553 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 413 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 179513863 179514025 179513944 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 16745 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 179517331 179517686 179517646 Y HNRNPH1,MAML1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 20213 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr5 179718006 179718384 179718320 Y NA MAPK9 NA NA NA NA CTB-129O4.1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr5 180616521 180617006 180616799 Y ZFP62,TRIM52,TRIM41 TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A NA NA NA NA CTC-338M12.5 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr5 180672693 180672910 180672808 Y NA TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1,CTC-338M12.9 NA NA NA NA GNB2L1 186 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 286457 287090 286788 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 2540 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 472688 472701 472695 Y HUS1B,EXOC2 NA NA NA NA NA IRF4 82949 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 501922 502087 502051 Y NA NA NA NA NA NA IRF4 112183 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 541825 541828 541827 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 149289 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 542839 543066 543064 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 148051 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 1003791 1004094 1003851 Y HUS1B NA NA NA NA NA FOXQ1 306581 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 1311552 1311897 1311757 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 877 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 1609094 1609758 1609395 Y FOXC1 FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 413 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 1953013 1953362 1953197 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 290564 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 2007495 2007675 2007591 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 236251 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 2081468 2081822 2081645 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 162104 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 2763251 2763536 2763387 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 2767771 2767941 2767856 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 4123 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 2818084 2818421 2818253 Y SERPINB9 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 21819 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 3072108 3072295 3072201 Y NA RIPK1,BPHL NA NA NA NA RIPK1 9883 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 3248062 3248427 3248198 Y SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B PSMG4,TUBB2B TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 TUBB2B 18098 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 3341734 3342066 3341935 Y NA NA NA NA NA NA TUBB2B 111770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA TUBB2B 126135 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 3385907 3386183 3386010 Y SLC22A23 NA NA NA NA NA TUBB2B 155943 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 3511713 3512018 3511866 Y NA NA PXDC1,SLC22A23 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB2B 281749 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 3797931 3798162 3798051 Y NA FAM50B SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 49458 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 4778036 4778769 4778420 Y CDYL NA NA NA NA NA CDYL 73643 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 5179288 5179492 5179391 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 79680 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 5246431 5246752 5246693 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA LYRM4 12420 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 5280343 5280601 5280557 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 21066 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 6000594 6000986 6000896 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 4214 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 6164416 6164764 6164590 Y F13A1 NA NA NA NA NA NRN1 159216 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.64445249716339 chr6 6742676 6742724 6742701 Y NA NA RREB1,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 363106 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 7074033 7074425 7074227 Y LY86,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 31405 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 7202193 7202713 7202370 Y RIOK1,SSR1,RREB1,RREB1 NA NA NA NA NA RREB1 96363 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 7591248 7591486 7591394 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 2816 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 9156165 9156451 9156310 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B3 722371 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 9710906 9711148 9711028 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 706744 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr6 9839255 9839267 9839261 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 578625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 10771427 10771996 10771700 Y ELOVL2,MAK TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA SYCP2L 25400 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 11243333 11243432 11243383 Y MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 137149 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 11270585 11270869 11270602 Y TMEM170B,MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 109712 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 11741947 11742326 11741953 Y HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 206009 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 11769423 11769725 11769659 Y HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 233485 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 11877263 11877653 11877414 Y TMEM170B NA ADTRP,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 129342 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 12232536 12232937 12232675 Y HIVEP1,EDN1 NA TMEM170B,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 55659 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 12234649 12234812 12234726 Y HIVEP1,EDN1 NA TMEM170B,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 53784 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 12265023 12265287 12265176 Y HIVEP1,EDN1 EDN1 TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 23309 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 12273843 12273861 12273852 Y NA EDN1 HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 14735 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 12285143 12285495 12285317 Y NA EDN1 TMEM170B,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 3101 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 12288471 12288892 12288524 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 12291396 12291672 12291434 Y NA EDN1 NA NA NA NA EDN1 2800 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 12485726 12485919 12485760 Y NA RPL15P3 EDN1,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 26423 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 13630387 13630831 13630754 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 16828 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 13636617 13636971 13636795 Y TBC1D7,GFOD1,CD83 NOL7 NA NA NA NA NOL7 23058 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr6 13651430 13651585 13651505 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 37871 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 13662469 13662838 13662724 Y NA NOL7,RANBP9 NA NA NA NA RANBP9 46958 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.14976195528843 chr6 14659204 14659944 14659341 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 543332 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 14826835 14827098 14826967 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 417429 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 15066743 15067555 15067031 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 176972 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 15569583 15569742 15569685 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 91547 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 15580663 15580900 15580755 Y JARID2 NA NA NA NA NA DTNBP1 80389 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 15614590 15614742 15614649 Y JARID2,DTNBP1 DTNBP1 NA NA NA NA DTNBP1 46547 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 16215873 16216103 16215954 Y MYLIP GMPR GMPR,JARID2,DTNBP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GMPR 20708 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 16413735 16414124 16414005 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 176924 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 16422379 16422759 16422608 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 185568 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 16474193 16474630 16474472 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 237382 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 16477089 16477316 16477218 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 240278 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 16636472 16636800 16636538 Y ATXN1 NA NA NA NA NA ATXN1 122922 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 16684658 16685097 16684682 Y ATXN1 NA NA NA NA NA ATXN1 74625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 16699529 16700051 16699938 Y ATXN1 NA NA NA NA NA ATXN1 59671 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 17015732 17016108 17015919 Y FLJ23152 NA ATXN1,GMPR IMR90 Hi-C 24141950 ATXN1 256010 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 17016303 17016440 17016335 Y NA NA ATXN1,GMPR IMR90 Hi-C 24141950 ATXN1 256581 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr6 17280388 17280785 17280395 Y CAP2,RBM24,RBM24,RBM24 RBM24 NA NA NA NA RBM24 811 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 17925685 17925969 17925835 Y NA NA NA NA NA NA KIF13A 59885 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 18148522 18148811 18148697 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B NHLRC1,TPMT,KDM1B NHLRC1 IMR90 Hi-C 24141950 TPMT 4494 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 18308493 18308879 18308567 Y NA DEK RNF144B IMR90 Hi-C 24141950 DEK 45439 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr6 18341418 18341503 18341461 Y NA RNF144B RNF144B MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF144B 25276 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 18342517 18342875 18342695 Y NA RNF144B RNF144B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNF144B 23904 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.95459532399033 chr6 18343795 18344357 18344138 Y RNF144B RNF144B RNF144B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNF144B 22422 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 18353568 18353841 18353735 Y RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 12938 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 20239005 20239080 20239045 Y NA MBOAT1 MBOAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MBOAT1 28335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 20978432 20978689 20978561 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 445744 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 21141154 21141340 21141254 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 450632 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 21589338 21589711 21589681 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2261 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 21667588 21667834 21667745 Y SOX4 NA NA NA NA NA SOX4 75616 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 21808482 21808727 21808539 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 216510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 22145253 22145497 22145375 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 553281 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 22148644 22148866 22148767 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 556672 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 22181735 22182137 22181931 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 589763 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 25352378 25352572 25352400 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 75072 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 25458860 25459089 25458879 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 181554 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.2541192345672 chr6 26016753 26016987 26016816 Y HIST1H1A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H1A 713 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 26169489 26169538 26169514 Y BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1 HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE NA NA NA NA HIST1H2BE 12420 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 26232920 26233434 26233137 Y NA HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI NA NA NA NA HIST1H1D 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 26550694 26551000 26550826 Y NA HCG11,HMGN4,ABT1 NA NA NA NA HMGN4 14061 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 27146789 27146995 27146901 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr6 27745023 27745278 27745151 Y OR2B6,OR2B2 HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J NA NA NA NA HIST1H2BL 28431 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 27798416 27798741 27798578 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H4K 1111 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 28099505 28099599 28099552 Y OR2B2,OR2B6,ZNF187,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 9167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 28101066 28101269 28101177 Y OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 10728 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 28102608 28102781 28102677 Y ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 12270 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA ZSCAN12,ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 5674 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr6 28715387 28715696 28715451 Y NA NA NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 89087 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 28834475 28834586 28834545 Y NA XXbac-BPG308K3.5,HCG14 NA NA NA NA HCG14 27721 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 30010922 30011054 30010960 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA ZNRD1 13622 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 30175844 30176213 30176153 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 2991 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 30177609 30178061 30177863 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 1143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 30276337 30276699 30276532 Y ATAT1,ATAT1 TRIM39,HCG18,RPP21 NA NA NA NA TRIM39 15557 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 30497672 30498068 30497880 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PBMUCL1,PPP1R10,ATAT1,ATAT1 RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 24595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 30901201 30901293 30901247 Y DDR1,DDR1,DDR1,DDR1 GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA VARS2 27182 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 31789098 31789184 31789146 Y TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 4328 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.72464293293265 chr6 32072186 32072277 32072232 Y C2,TNXB ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1 NA NA NA NA ATF6B 21753 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 32325803 32326070 32325937 Y NA NA NA NA NA NA HLA-DRA 79549 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 32427743 32428120 32427936 Y PRRT1 HLA-DRA NA NA NA NA HLA-DRA 22124 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 32789030 32789171 32789101 Y HSD17B8,PSMB8 TAP2,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 15386 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 32802290 32802518 32802510 Y NA TAP2,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 2039 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 33129390 33129479 33129402 Y NA SLC39A7,RXRB,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 36743 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 33216178 33216307 33216243 Y NA SLC39A7,RXRB,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,B3GALT4,PFDN6,WDR46,RGL2 NA NA NA NA HCG25 867 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 33392796 33393285 33393082 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 6949 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 33396313 33396709 33396628 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 10466 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 34760607 34760986 34760926 Y UHRF1BP1 SNRPC,UHRF1BP1 NA NA NA NA UHRF1BP1 2750 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 35017720 35018080 35017831 Y NA NA NA NA NA NA SCUBE3 162110 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 35159725 35159966 35159851 Y TAF11,DEF6 SCUBE3 UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11,TAF11 IMR90 Hi-C 24141950 SCUBE3 20224 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 35681097 35681517 35681302 Y FKBP5 FKBP5,ARMC12 NA NA NA NA FKBP5 12843 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 35875551 35875739 35875654 Y SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1 SRPK1 NA NA NA NA SRPK1 11380 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 36086314 36086741 36086595 Y SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3 MAPK13 NA NA NA NA MAPK13 6845 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20,PXT1 NA NA NA NA PXT1 591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 36628616 36629003 36628769 Y ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN1A 13302 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 36821118 36821514 36821315 Y NA CPNE5,C6orf89,PPIL1 CPNE5 IMR90 Hi-C 24141950 CPNE5 15340 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 37016531 37017062 37016596 Y NA NA NA NA NA NA MTCH1 64457 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr6 37077622 37078018 37077795 Y C6orf89,TBC1D22B,PIM1 NA PIM1,PPIL1,TMEM217,CPNE5,FGD2,C6orf89,TBC1D22B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 57961 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 37095912 37096089 37096014 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 39890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 37109258 37109689 37109648 Y PI16 PIM1 PIM1,C6orf89,FGD2,PPIL1,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,TMEM217 IMR90 Hi-C 24141950 PIM1 26290 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 37190361 37190574 37190538 Y NA TBC1D22B NA NA NA NA TBC1D22B 32974 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 37227057 37227393 37227190 Y FTSJD2,TMEM217,TBC1D22B,TMEM217 TBC1D22B NA NA NA NA TBC1D22B 3509 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 37424991 37425195 37425093 Y NA CCDC167 CCDC167 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC167 40503 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 37464858 37465170 37465019 Y NA CCDC167 NA NA NA NA CCDC167 528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 37750628 37750998 37750792 Y MDGA1 ZFAND3 BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND3 34277 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 38605801 38606040 38606032 Y NA NA NA NA NA NA BTBD9 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 39122561 39122673 39122617 Y NA SAYSD1 GLP1R,DNAH8 IMR90 Hi-C 24141950 SAYSD1 41596 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 40964017 40964029 40964023 Y NA NA UNC5CL,APOBEC2,C6orf130 IMR90 Hi-C 24141950 NFYA 74655 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 41238379 41238420 41238400 Y NA NA NA NA NA NA NFYA 199695 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 41512989 41513289 41513139 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 825 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 41612844 41613289 41612975 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 10224 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 41906927 41907077 41907010 Y CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20001 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42255073 42255501 42255249 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 71470 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42259187 42259201 42259195 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 75584 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42306418 42306926 42306742 Y UBR2,TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 110863 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42348376 42348588 42348501 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 69201 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42361651 42361664 42361659 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 56125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42361929 42362135 42362048 Y NA NA NA NA NA NA TRERF1 55654 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42369897 42370202 42370080 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 47587 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42375139 42375533 42375327 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 42256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 42409399 42409623 42409499 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 8166 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42413186 42413554 42413522 Y NA TRERF1 GUCA1B,MRPS10 IMR90 Hi-C 24141950 TRERF1 4235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr6 42515662 42516014 42516002 Y GUCA1A,MEA1,KIAA0240 UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 13786 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42694331 42694739 42694439 Y KLC4,KLC4,CUL9,TRERF1,C6orf226,PRPH2,TBCC ATP6V0CP3,TBCC NA NA NA NA ATP6V0CP3 1359 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr6 42722931 42723177 42723029 Y NA ATP6V0CP3,TBCC UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 10373 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 42944777 42944970 42944923 Y NA CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36 NA NA NA NA PEX6 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 43001164 43001472 43001318 Y NA MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA KLC4 5043 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 43977606 43978027 43977822 Y NA NA NA NA NA NA TMEM63B 114624 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 44026121 44027353 44026480 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 65298 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 44205272 44205504 44205346 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B NA NA NA NA HSP90AB1 7320 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 44205807 44206020 44205896 Y NA SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B NA NA NA NA HSP90AB1 6804 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 44490773 44490987 44490880 Y NA NA CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 137511 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 44887030 44887214 44887174 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 456476 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 44949602 44949944 44949774 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 393746 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 45092657 45092762 45092710 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 250928 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 45299468 45299716 45299591 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 43974 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 45322429 45322774 45322605 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 20916 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 45503698 45503963 45503769 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 160008 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 47214948 47215452 47215060 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF21 60189 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 47275760 47275938 47275849 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 119 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 48967422 48967791 48967607 Y MUT NA NA NA NA NA MUT 461113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 52404444 52404567 52404560 Y NA TRAM2 EFHC1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAM2 35146 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 52439625 52439825 52439764 Y TRAM2 NA NA NA NA NA TRAM2 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 52952230 52952503 52952367 Y NA FBXO9,ICK NA NA NA NA ICK 27630 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 53195071 53195341 53195324 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 16606 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 53199994 53200715 53200310 Y FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5 ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 11232 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 53205102 53205427 53205266 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 6520 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr6 54714400 54714688 54714559 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 1057105 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 57052407 57052730 57052411 Y NA BAG2,RAB23 NA NA NA NA BAG2 17283 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 57267458 57267955 57267680 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 89855 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 57327654 57327860 57327770 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 150051 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 57389697 57390070 57389732 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 212094 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 57408924 57409255 57409252 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 231321 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 63803405 63803823 63803791 Y NA NA NA NA NA NA FKBP1C 115528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr6 64398084 64398491 64398303 Y PHF3 NA NA NA NA NA PHF3 54359 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 64629183 64629230 64629207 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 285458 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 64810831 64811146 64811044 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 467106 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 64814643 64814659 64814650 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 470918 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.18454771504802 chr6 69353902 69354407 69354113 Y NA BAI3 NA NA NA NA BAI3 10643 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 69487592 69487966 69487779 Y BAI3 NA NA NA NA NA BAI3 144333 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 70489653 70490034 70489967 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 14969 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 72034617 72034728 72034673 Y NA OGFRL1 NA NA NA NA OGFRL1 38111 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 72179171 72179414 72179328 Y NA NA OGFRL1,MIR30C2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00472 50699 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 72712491 72712880 72712684 Y RIMS1 NA NA NA NA NA RIMS1 118085 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 73329727 73330142 73329822 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 207 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 103040 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 73981759 73981798 73981779 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 NA NA NA NA RP11-398K22.12 10821 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 76367901 76367953 76367944 Y NA NA NA NA NA NA SENP6 58676 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 76498619 76498787 76498703 Y NA MYO6 NA NA NA NA MYO6 41710 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 81134610 81134899 81134794 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 320246 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 81429960 81430117 81430036 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 615596 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 83590354 83590694 83590676 Y NA NA NA NA NA NA DOPEY1 184691 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 83793136 83793338 83793237 Y PRSS35,DOPEY1 DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 17751 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 86655114 86655471 86655235 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P27 139381 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 87800989 87801207 87801098 Y CGA RCN1P1 NA NA NA NA RCN1P1 29199 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 87881047 87881581 87881092 Y NA ZNF292 NA NA NA NA ZNF292 20496 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 89084006 89084236 89084119 Y NA NA NA NA NA NA ACTBP8 99298 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 89095880 89096050 89095968 Y NA NA NA NA NA NA ACTBP8 111172 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 89473318 89473558 89473438 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 197790 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 89755402 89755578 89755517 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNRC1 32892 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 90695509 90695956 90695679 Y BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA CASP8AP2 157896 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 90860237 90860588 90860527 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 144039 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr6 90994449 90994671 90994572 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 9956 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 325188 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 94018186 94018578 94018382 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 108687 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 99382979 99383150 99383065 Y NA FBXL4 NA NA NA NA FBXL4 10699 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 100007525 100007878 100007702 Y LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 6971 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 100051584 100051769 100051603 Y NA CCNC NA NA NA NA CCNC 36735 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 101965513 101965732 101965659 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 638265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 108169525 108169909 108169631 Y NA NA NA NA NA NA SEC63 107484 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 108239964 108240066 108240015 Y NA SEC63 NA NA NA NA SEC63 37327 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 108574394 108574619 108574507 Y NA SNX3,LACE1 NA NA NA NA SNX3 5845 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 109780095 109780443 109780296 Y CD164,SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24 SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24 NA NA NA NA MICAL1 4728 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 109852596 109852917 109852757 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB24 50156 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 110150540 110150563 110150552 Y NA NA NA NA NA NA FIG4 140041 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 110360700 110361043 110360911 Y GPR6 NA FIG4,AKD1,PPIL6,MICAL1,SMPD2,DDO,METTL24 IMR90 Hi-C 24141950 WASF1 138164 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 110456590 110456951 110456841 Y WASF1,CDC40,C6orf186 WASF1,CDC40 NA NA NA NA WASF1 42256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 110502951 110503352 110503102 Y FIG4,CDC40 WASF1,CDC40 NA NA NA NA CDC40 3607 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 111409580 111409942 111409703 Y AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10 SLC16A10 NA NA NA NA SLC16A10 2799 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 111675383 111675464 111675424 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1919 96832 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 111758931 111759246 111759206 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 43468 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 111873587 111873978 111873729 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2 51503 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 112163238 112163349 112163330 Y NA FYN NA NA NA NA FYN 29306 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 112618415 112618437 112618426 Y NA RFPL4B LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 RFPL4B 48095 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 113104974 113105145 113105060 Y NA NA FLJ34503,HDAC2,MARCKS,LOC285758 IMR90 Hi-C 24141950 RFPL4B 438442 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 113885832 113886201 113886017 Y MARCKS NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 290340 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 113975639 113976185 113975774 Y MARCKS NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 200356 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 114318333 114318559 114318390 Y NA RP3-399L15.3,HDAC2 NA NA NA NA HDAC2 11913 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 116395142 116395462 116395394 Y NA NT5DC1 FRK,TPI1P3,NT5DC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5DC1 24550 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 116550472 116550927 116550585 Y KPNA5,TSPYL4,TSPYL1 TSPYL4,DSE,RP3-486I3.4,TSPYL1 NA NA NA NA TSPYL4 22334 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 116708158 116708375 116708238 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA FAM26F 72158 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 116745242 116745485 116745336 Y ZUFSP,DSE,FAM26F FAM26F NA NA NA NA FAM26F 35048 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 117003694 117003845 117003770 Y TSPYL4,TSPYL1,DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA KPNA5 3344 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 118008335 118008695 118008355 Y NA NUS1 NA NA NA NA NUS1 13670 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 118009013 118009297 118009155 Y NA NUS1 NA NA NA NA NUS1 14348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 118964875 118965125 118965000 Y MCM9,C6orf204 NA NA NA NA NA CEP85L 64113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 119166106 119166505 119166300 Y NA ASF1A NA NA NA NA ASF1A 46879 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 119366243 119366474 119366359 Y NA NA NA NA NA NA FAM184A 102078 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 121396728 121397112 121396920 Y C6orf170 NA NA NA NA NA GJA1 357726 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 121530032 121530291 121530288 Y NA NA NA NA NA NA GJA1 224547 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 121759226 121759877 121759689 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 4388 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 121843500 121843932 121843669 Y GJA1 NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-35P 70233 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 122253904 122254092 122253993 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 HSF2 464599 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 122373442 122373685 122373622 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 HSF2 345006 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 125622252 125622475 125622321 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 970 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 126579500 126579620 126579560 Y NA NA NA NA NA NA CENPW 79700 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 127618608 127618885 127618797 Y NA RNF146,ECHDC1 NA NA NA NA RNF146 32853 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226557 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 128747260 128747445 128747404 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 92425 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 128816273 128816626 128816620 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 23244 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 128840669 128840970 128840936 Y PTPRK,PTPRK PTPRK NA NA NA NA PTPRK 799 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 129504822 129504957 129504926 Y NA NA NA NA NA NA LAMA2 302480 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 129667099 129667337 129667218 Y LAMA2 NA NA NA NA NA ARHGAP18 362033 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 129855341 129855708 129855581 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 173662 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 131592339 131592544 131592531 Y NA NA NA NA NA NA AKAP7 137533 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 133787838 133788115 133788090 Y NA NA NA NA NA NA EYA4 228102 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 133932660 133932952 133932806 Y NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 338356 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 134554333 134554655 134554499 Y SGK1,SGK1 NA NA NA NA NA SGK1 82595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 135344059 135344242 135344151 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 77952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 135352829 135352991 135352910 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 69203 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB NA NA NA NA NA HBS1L 81704 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 136788990 136789214 136789102 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 80743 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 136907576 136907759 136907659 Y NA MAP7 NA NA NA NA MAP7 37619 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 138027517 138027801 138027604 Y NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 158550 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 138098319 138098907 138098655 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 87444 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 138552516 138552583 138552548 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1244 71458 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 139625000 139625014 139625006 Y NA NA TXLNB,HECA IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 68743 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 139899473 139899647 139899531 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 205716 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr6 140069895 140070090 140070024 Y NA NA CITED2,LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-899B16.1 103897 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140085604 140086085 140085978 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-899B16.1 87902 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140203387 140203540 140203467 Y NA RP5-899B16.1 NA NA NA NA RP5-899B16.1 29400 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140299062 140299512 140299364 Y NA NA CITED2,HECA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-899B16.1 125075 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 140383051 140383491 140383322 Y NA NA CITED2,LOC100132735 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-899B16.1 209064 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140399868 140400230 140399986 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 225881 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140400470 140400745 140400517 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 226483 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr6 140807335 140807614 140807478 Y NA NA LOC100132735,CITED2 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-899B16.1 633348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140858396 140858527 140858462 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-899B16.1 684409 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140858869 140859245 140859045 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-899B16.1 684882 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140893217 140893627 140893519 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 719230 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 140920515 140920620 140920568 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 746528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140926275 140926589 140926526 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 752288 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140929042 140929323 140929183 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 755055 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 140930496 140930538 140930517 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 756509 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr6 140984884 140985153 140985121 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-899B16.1 810897 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 8.62321466466324 chr6 141722933 141723109 141722991 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 743258 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 141765105 141765268 141765171 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 701099 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 143134397 143134731 143134564 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 129607 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 143503002 143503176 143503018 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 123369 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 143516746 143517148 143516792 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 137113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 144474457 144475387 144474631 Y PLAGL1,STX11 TPT1P4 NA NA NA NA TPT1P4 44715 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 144644192 144644433 144644313 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 124090 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 147985018 147985058 147985038 Y NA NA NA NA NA NA SAMD5 156955 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 148424761 148425105 148424843 Y NA NA NA NA NA NA SASH1 166335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 148443958 148444368 148444103 Y NA NA SAMD5 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 147072 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 686 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 150200694 150201094 150200866 Y NA LRP11,RAET1G NA NA NA NA LRP11 16495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 150286198 150286452 150286311 Y ULBP1 RAET1G,ULBP1 NA NA NA NA ULBP1 3055 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 151090718 151090960 151090871 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA MTHFD1L 93725 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 151302311 151302568 151302430 Y PLEKHG1 RP1-99E18.2 NA NA NA NA RP1-99E18.2 48207 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 153132437 153132820 153132584 Y NA NA NA NA NA NA VIP 62504 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 155181312 155181660 155181451 Y TIAM2,TIAM2 TIAM2 TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 29481 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 155593046 155593119 155593050 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 17188 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 156748534 156748826 156748680 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 348237 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 157163922 157164341 157164233 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 66859 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 157176246 157176601 157176399 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 79183 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 157274060 157274135 157274104 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 176997 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 158525965 158526121 158526043 Y NA NA NA NA NA NA SERAC1 61191 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 158670119 158670409 158670245 Y NA NA TULP4,TMEM181 IMR90 Hi-C 24141950 GTF2H5 82735 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 25935 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 159525207 159525384 159525309 Y EZR,EZR,TAGAP NA TAGAP,RSPH3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FNDC1 63045 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 160395204 160395414 160395271 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 7073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 160409606 160409719 160409663 Y IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 21475 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 160837218 160837569 160837394 Y NA NA NA NA NA NA IGF2R 449087 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 161536644 161536718 161536688 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 125885 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 161545851 161546111 161545978 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 135092 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 161571430 161571737 161571637 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 121356 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 161650248 161650386 161650340 Y AGPAT4 AGPAT4 NA NA NA NA AGPAT4 42707 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 162602836 162603202 162603044 Y NA NA NA NA NA NA PACRG 542962 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 162808264 162808283 162808273 Y NA NA NA NA NA NA PACRG 337881 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 163098494 163098513 163098505 Y PARK2,PACRG,PACRG PACRG,PARK2 NA NA NA NA PACRG 47651 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 163784160 163784198 163784179 Y NA QKI PACRG IMR90 Hi-C 24141950 QKI 48834 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr6 164463312 164463618 164463465 Y NA NA NA NA NA NA QKI 630280 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 166078176 166078539 166078376 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 319552 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 167837583 167837890 167837668 Y FGFR1OP,UNC93A,MLLT4 NA SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 CCR6 314288 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr6 168216462 168216639 168216532 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 8963 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 SMOC2 469097 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr6 169542234 169542607 169542421 Y NA NA NA NA NA NA WDR27 557552 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 169569548 169569688 169569622 Y NA NA C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 530471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 170589556 170589600 170589578 Y WDR27,TCTE3,TBP DLL1,FAM120B NA NA NA NA DLL1 7961 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr6 170654095 170654292 170654195 Y FAM120B NA NA NA NA NA FAM120B 56304 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM20C 182125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr7 652642 652893 652768 Y PRKAR1B,ADAP1 NA NA NA NA NA PDGFA 94709 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 919141 919296 919237 Y NA GET4 NA NA NA NA GET4 4952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 1037816 1038118 1037953 Y NA ADAP1,COX19,GPR146 NA NA NA NA COX19 24581 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 1329910 1330257 1330187 Y NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 131515 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 1407991 1408135 1408052 Y NA NA NA NA NA NA MICALL2 89003 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 1416814 1417157 1416984 Y NA NA NA NA NA NA MICALL2 79981 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 1546424 1546775 1546565 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2935 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 1658452 1658596 1658524 Y ELFN1 PSMG3 NA NA NA NA PSMG3 49811 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 1708705 1709030 1708796 Y NA NA MAD1L1,KIAA1908 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG3 100064 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 1709256 1709641 1709356 Y NA NA MAD1L1,KIAA1908 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG3 100615 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 1965570 1966023 1965918 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 304855 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 2077835 2078163 2078150 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 192715 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 2101889 2102279 2102085 Y ELFN1 NA NA NA NA NA MAD1L1 168599 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 2827851 2827916 2827884 Y NA AC006028.11 NA NA NA NA AC006028.11 45339 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 2980860 2981267 2981182 Y NA NA NA NA NA NA GNA12 98902 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 3522204 3522406 3522287 Y NA NA NA NA NA NA SDK1 183124 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 4133088 4133284 4133186 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 548104 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr7 5471668 5472052 5471860 Y NA TNRC18 WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC18 8623 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.83961912846149 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 5609221 5609424 5609333 Y FBXL18 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 7806 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr7 5718052 5718263 5718155 Y USP42 NA NA NA NA NA FSCN1 87613 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 5733977 5734150 5734061 Y NA NA NA NA NA NA RNF216 85220 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 6422514 6422839 6422633 Y CCZ1 RAC1 NA NA NA NA RAC1 10360 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316,AC073343.13 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 AC073343.13,ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr7 7249464 7249811 7249639 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1 54899 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 7481152 7481527 7481340 Y NA NA NA NA NA NA MIOS 122976 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 7911710 7911812 7911761 Y NA NA NA NA NA NA GLCCI1 94613 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 8215934 8216623 8216095 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA AC007009.1 83240 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 8465802 8466184 8465978 Y NA NA NA NA NA NA ICA1 165485 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 8550473 8550803 8550530 Y NA NA NA NA NA NA ICA1 250156 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 10043571 10043672 10043621 Y NA NA NA NA NA NA HSPA8P8 445266 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 11832549 11832888 11832860 Y NA THSD7A NA NA NA NA THSD7A 36936 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 11859641 11859960 11859801 Y THSD7A THSD7A NA NA NA NA THSD7A 9864 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 13021746 13022072 13021909 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 297265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 13085757 13085829 13085793 Y NA NA ARL4A IMR90 Hi-C 24141950 ARL4A 361276 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 13700759 13700990 13700876 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 328060 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 13758700 13759051 13758876 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 269999 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 18865089 18865093 18865091 Y HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA TWIST1 290202 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 19186475 19186536 19186492 Y TWIST1,FERD3L TWIST1 NA NA NA NA TWIST1 31180 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 20009712 20010019 20009851 Y NA RPL21P75 NA NA NA NA RPL21P75 30327 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 20242848 20242947 20242898 Y NA NA NA NA NA NA ITGB8 125378 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 20488084 20488380 20488322 Y NA NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB8 119759 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 20524071 20524315 20524167 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 155746 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 21502446 21502711 21502550 Y SP4 SP4 NA NA NA NA SP4 36794 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 22122992 22123068 22123014 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 139290 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 22130088 22130317 22130208 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 146386 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 22861021 22861212 22861181 Y NA TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 551 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 23250227 23250417 23250322 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA GPNMB 23169 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 23410116 23410259 23410188 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 97827 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 23411315 23411579 23411447 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 96507 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.06957151951918 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 24739704 24740021 24739930 Y DFNA5,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 67223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 26317891 26318244 26318068 Y NA AC010677.5,SNX10 HNRNPA2B1,CBX3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AC010677.5 4076 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 26523285 26523306 26523295 Y NA NA NA NA NA NA AC004540.5 87072 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 26815721 26816027 26815980 Y SNX10,SNX10,SKAP2 NA NA NA NA NA SKAP2 216831 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 27143635 27143783 27143725 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3 NA NA NA NA HOXA-AS2 1613 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 27152655 27152825 27152741 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7 NA NA NA NA HOXA-AS2 7259 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 28195097 28195228 28195166 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 22713 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 28239024 28239196 28239110 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1 20662 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 29115131 29115317 29115226 Y NA CHN2 NA NA NA NA CHN2 44573 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 29163209 29163338 29163275 Y NA CHN2 NA NA NA NA CHN2 3319 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 30636092 30636194 30636111 Y NA GGCT,GARS NA NA NA NA GARS 3795 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 32264519 32264896 32264708 Y PDE1C NA NA NA NA NA LSM5 267999 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 32551548 32551619 32551584 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 18510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 32929600 32929824 32929751 Y NA KBTBD2 NA NA NA NA KBTBD2 1919 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 32944853 32945232 32945065 Y KBTBD2 KBTBD2,RP9P,FKBP9 NA NA NA NA KBTBD2 13110 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 36331807 36331936 36331811 Y NA NA NA NA NA NA ANLN 95479 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 38285257 38285450 38285342 Y TARP NA NA NA NA NA AC006033.22 63534 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 38426501 38426719 38426610 Y NA NA NA NA NA NA AC006033.22 77517 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 39774001 39774145 39774098 Y CDK13,RALA LINC00265 NA NA NA NA LINC00265 2770 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 40138099 40138142 40138120 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 150463 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 40580986 40581112 40581049 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 593350 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 41771654 41771750 41771721 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 503719 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 43683947 43684262 43684105 Y POLM,DBNL,STK17A NA NA NA NA NA STK17A 63590 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 43714128 43714419 43714274 Y NA NA NA NA NA NA BLVRA 81860 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 44436686 44437032 44436900 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2B 64510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 45633722 45633912 45633893 Y ADCY1 ADCY1 NA NA NA NA ADCY1 21983 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 46186512 46186858 46186578 Y IGFBP3 NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 227039 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 46842508 46842579 46842545 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 777577 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 47631233 47631542 47631345 Y C7orf69,TNS3 TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 11077 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 47981261 47981636 47981449 Y UPP1,UPP1 HUS1 NA NA NA NA HUS1 35542 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 48114005 48114152 48114079 Y NA UPP1 NA NA NA NA UPP1 12073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 50340633 50340761 50340699 Y IKZF1 NA IKZF1 IMR90 Hi-C 24141950 FIGNL1 175327 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 50615386 50615579 50615483 Y GRB10 NA NA NA NA NA FIGNL1 99298 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 50769181 50769534 50769358 Y NA NA NA NA NA NA GRB10 89625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 51377267 51377515 51377396 Y NA COBL NA NA NA NA COBL 5000 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 55245390 55245594 55245555 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 160676 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 108185 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr7 55604306 55604799 55604689 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 33882 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 55635235 55635573 55635336 Y NA VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 3108 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 55638699 55638887 55638779 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 18 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 57471842 57471971 57471867 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP12 202538 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr7 57639323 57639702 57639567 Y ZNF479,ZNF716 NA NA NA NA NA GUSBP12 370019 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 57706434 57706786 57706770 Y ZNF716 NA NA NA NA NA GUSBP12 437130 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-340I6.8 1389471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 63767130 63767234 63767166 Y NA ZNF736 NA NA NA NA ZNF736 1293 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 63775449 63776053 63775748 Y NA ZNF736 NA NA NA NA ZNF736 9612 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 66015251 66015629 66015440 Y NA NA NA NA NA NA GS1-124K5.4 58558 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 66159622 66159870 66159746 Y NA RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 14471 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 66206459 66206659 66206557 Y KCTD7,C7orf42,RABGEF1 NA NA NA NA NA RABGEF1 61308 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 66897123 66897210 66897167 Y NA NA NA NA NA NA PMS2P4 131229 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 69308115 69308415 69308239 Y AUTS2,AUTS2 NA NA NA NA NA AUTS2 246210 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 70125511 70125845 70125628 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 469310 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 70192009 70192182 70192113 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 402973 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 70793641 70793961 70793647 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 198486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 72929530 72929887 72929777 Y NA BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 4721 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 74138320 74138615 74138328 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 68326 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 75522158 75522529 75522343 Y RHBDD2 POR NA NA NA NA POR 3989 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 75675722 75675985 75675853 Y NA STYXL1,MDH2 NA NA NA NA MDH2 353 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR SRRM3 SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 SRRM3 33163 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 79776985 79777288 79777110 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 15714 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 80337478 80337851 80337650 Y NA NA SEMA3C IMR90 Hi-C 24141950 GNAT3 198142 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 80352083 80352704 80352185 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 196971 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 80360559 80360752 80360740 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 188923 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 80441834 80442054 80441993 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 107621 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 80836919 80837151 80837079 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 287244 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 80840847 80841237 80841156 Y SEMA3C NA NA NA NA NA SEMA3C 291172 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr7 81234008 81234151 81234026 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 HGF 163603 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr7 81234371 81234711 81234707 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 HGF 163043 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 81582871 81583219 81583134 Y NA NA NA NA NA NA HGF 185117 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 81590210 81590492 81590289 Y NA NA NA NA NA NA HGF 192456 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr7 81655164 81655347 81655329 Y NA NA NA NA NA NA HGF 257410 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 81851268 81851277 81851273 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 219837 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 81927516 81927685 81927601 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 143429 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 82014296 82014582 82014440 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 56532 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 82063702 82063952 82063837 Y CACNA2D1 CACNA2D1 NA NA NA NA CACNA2D1 7162 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 82596075 82596467 82596271 Y NA NA NA NA NA NA PCLO 193779 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 84119513 84119698 84119606 Y NA SEMA3A NA NA NA NA SEMA3A 342 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 84165433 84165798 84165584 Y NA SEMA3A NA NA NA NA SEMA3A 45393 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 84227562 84227721 84227642 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3A 107522 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 84613691 84613734 84613712 Y NA AC074183.4 NA NA NA NA AC074183.4 46130 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 84717663 84717972 84717818 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3D 96199 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 84814304 84814737 84814457 Y NA SEMA3D NA NA NA NA SEMA3D 133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 85450448 85450904 85450654 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3D 636277 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 9.19809564230746 chr7 86320673 86320677 86320675 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 366338 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 86534596 86534997 86534797 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 152018 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 90250368 90250899 90250569 Y NA NA CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 CDK14 156630 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 90253502 90253813 90253671 Y NA NA CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 CDK14 159764 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 92217809 92218139 92217980 Y NA FAM133B NA NA NA NA FAM133B 101 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 93208987 93209344 93209166 Y NA GNGT1 CALCR MCF7 ChIA-PET 22265404 GNGT1 9541 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 93231275 93231507 93231391 Y CCDC132 GNGT1 NA NA NA NA GNGT1 12390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr7 94557636 94557931 94557784 Y PPP1R9A PPP1R9A NA NA NA NA PPP1R9A 23122 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 96295796 96295968 96295882 Y FLJ42280 SHFM1 NA NA NA NA SHFM1 41235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 97761073 97761517 97761248 Y BRI3,LMTK2 LMTK2 NA NA NA NA LMTK2 26876 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 97913424 97913987 97913861 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 33733 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 98286893 98287005 98286947 Y NA NPTX2 NA NA NA NA NPTX2 42284 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 98724585 98724789 98724635 Y ZNF394,SMURF1 SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 14934 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 98739351 98739615 98739543 Y NA SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 108 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 98990795 98991133 98991082 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 13131 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr7 99020392 99020577 99020441 Y OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789 BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789 NA NA NA NA CPSF4 13968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 99178135 99178365 99178354 Y ZNF789 ZNF655,FAM200A NA NA NA NA FAM200A 23976 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 99966641 99967146 99966944 Y C7orf59,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 29110 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 100342957 100343164 100343095 Y NA POP7 NA NA NA NA POP7 41281 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 101613260 101613283 101613272 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 156301 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 101789481 101789757 101789558 Y NA NA NA NA NA NA PRKRIP1 212562 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.75942869269224 chr7 101930729 101931104 101930861 Y NA NA NA NA NA NA PRKRIP1 71215 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 102464517 102464880 102464701 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 77099 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 102958965 102959200 102958983 Y NA DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PMPCB 23096 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 102959356 102959407 102959404 Y PMPCB,DNAJC2 DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PSMC2 23294 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 104842983 104843396 104843385 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 191492 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 104857177 104857523 104857432 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 180232 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 105223133 105223294 105223281 Y NA EFCAB10 NA NA NA NA EFCAB10 16028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr7 105602769 105602970 105602871 Y NA NA NA NA NA NA CDHR3 87527 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 106838325 106838672 106838499 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 30919 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 107136125 107136576 107136361 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 65353 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 107554407 107554624 107554481 Y DLD DLD NA NA NA NA DLD 24992 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 107562078 107562130 107562088 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 32663 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 108118010 108118358 108118206 Y NA NRCAM NA NA NA NA NRCAM 22849 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 110874557 110874601 110874588 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 145495 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 110956734 110956926 110956906 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 227672 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 111421395 111421784 111421410 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 220822 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 111885477 111885635 111885572 Y NA DOCK4,ZNF277 NA NA NA NA ZNF277 40834 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 112414156 112414445 112414299 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 14202 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 116523983 116524309 116524052 Y NA NA NA NA NA NA ST7 66983 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 116793573 116793925 116793605 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 201185 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 116990120 116990313 116990215 Y NA NA NA NA NA NA CFTR 113525 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 120030311 120030667 120030374 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN12 465789 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 121008996 121009049 121009023 Y NA FAM3C NA NA NA NA FAM3C 25369 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 121951485 121951902 121951877 Y NA FEZF1-AS1,FEZF1 NA NA NA NA FEZF1 2740 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 123387168 123387479 123387315 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 47 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 123843194 123843309 123843252 Y TMEM229A NA GPR37,LOC154872 IMR90 Hi-C 24141950 WASL 456073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 127455662 127455822 127455742 Y NA NA NA NA NA NA SND1 165428 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 127663304 127663714 127663503 Y IMPDH1,GCC1,LRRC4 LRRC4 NA NA NA NA LRRC4 6446 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 127807416 127807928 127807646 Y LRRC4 NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC4 137256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 127808367 127808804 127808463 Y LRRC4 NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC4 138207 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 127841401 127841535 127841457 Y FAM71F2 NA SND1,MIR129-1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM28 140427 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 128094514 128094949 128094639 Y LEP,C7orf68 IMPDH1,HILPDA,METTL2B NA NA NA NA HILPDA 611 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr7 128500948 128501348 128501123 Y NA FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA ATP6V1F 68 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 129176186 129176414 129176275 Y NRF1 NA NA NA NA NA RNU1-72P 53841 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 129419118 129419176 129419138 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169563 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr7 129540244 129540548 129540396 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 50241 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 129589680 129589810 129589737 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 979 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 129590044 129590333 129590306 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 456 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 129650131 129650429 129650342 Y NRF1 ZC3HC1 NA NA NA NA ZC3HC1 38862 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 130151792 130152099 130151899 Y NA MEST,MIR335 NA NA NA NA MIR335 17840 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 130669444 130669692 130669631 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 123163 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 130692586 130692952 130692786 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 99903 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 131307786 131308102 131307944 Y NA NA PODXL MCF7 ChIA-PET 22265404 PODXL 66810 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 131919616 131920007 131919874 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA PODXL 678640 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 132441115 132441141 132441128 Y NA NA FLJ40288 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD3 323707 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 132488555 132488726 132488642 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 276122 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 132607236 132607300 132607268 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 157548 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 133148039 133148314 133148177 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 149872 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 133431716 133432104 133431827 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 377948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 133706471 133706698 133706584 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 103354 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 134845913 134846266 134846037 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 7281 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 137227927 137228294 137228111 Y PTN NA NA NA NA NA PTN 201316 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 137685065 137685809 137685664 Y TRIM24,CREB3L2 CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 252 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 138858843 138859133 138858995 Y SVOPL TTC26 NA NA NA NA TTC26 42353 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 139320398 139320629 139320471 Y LUC7L2 NA NA NA NA NA ERHP1 103412 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 139930411 139930852 139930521 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 168890 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 140807032 140807954 140807105 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-74P 56983 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 140947588 140947591 140947590 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-74P 197539 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 141574657 141574825 141574769 Y TAS2R38,CLEC5A NA MGAM IMR90 Hi-C 24141950 SSBP1 138536 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 148334506 148334940 148334775 Y NA NA NA NA NA NA CUL1 58066 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 149266694 149267035 149266833 Y NA NA NA NA NA NA ZNF767 52808 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 149323228 149323272 149323250 Y NA ZNF767 NA NA NA NA ZNF767 3385 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 4.2541192345672 chr7 149471511 149471709 149471700 Y ATP6V0E2,SSPO ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 2943 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 149745351 149745623 149745500 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V0E2-AS1 169652 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 150705271 150705459 150705364 Y GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542,KCNH2 KCNH2,ABCB8,SLC4A2,CDK5 NA NA NA NA ABCB8 18051 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 151192969 151193321 151193145 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21885 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 151502324 151502720 151502638 Y NA NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 69407 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 151547797 151548597 151548315 Y RHEB,PRKAG2,PRKAG2 PRKAG2-AS1,PRKAG2 NA NA NA NA PRKAG2-AS1 23530 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 151640969 151641067 151641018 Y NA NA PRKAG2,GALNTL5,GALNT11 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAG2 68759 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 151986893 151987163 151987026 Y MLL3 NA NA NA NA NA FABP5P3 144817 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28735 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 29368 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.06957151951918 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 154746550 154746681 154746616 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 46113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 155105447 155105513 155105480 Y NA INSIG1 NA NA NA NA INSIG1 17961 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 155260612 155260850 155260792 Y CNPY1 NA NA NA NA NA INSIG1 173126 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 NA NA NA NA NA RBM33 158338 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA SHH NA NA NA NA SHH 22517 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 156290432 156290782 156290467 Y RNF32 NA SHH,LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 RNF32 140193 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 156412276 156412413 156412345 Y NA RNF32,C7orf13 NA NA NA NA RNF32 18562 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 157112606 157112849 157112710 Y NA DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAJB6 13226 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr7 157338058 157338440 157338352 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 211983 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 157476988 157477433 157477353 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 350913 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr7 157956905 157957265 157957085 Y PTPRN2 NA NA NA NA NA NCAPG2 538255 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr7 158613624 158614053 158613981 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 6891 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 158656529 158657066 158657015 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA WDR60 9260 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr7 158905033 158905150 158905046 Y NA NA NA NA NA NA WDR60 257764 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 479972 480137 480087 Y NA NA NA NA NA NA FBXO25 125544 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 852604 852763 852684 Y NA NA NA NA NA NA ERICH1 166498 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 1321281 1321540 1321454 Y NA NA DLGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLN8 380404 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.919809564230746 chr8 1994506 1994882 1994694 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 74462 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 3007689 3007702 3007698 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 1087645 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 3643658 3643668 3643663 Y NA NA NA NA NA NA PAICSP4 999186 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 4154196 4154240 4154219 Y NA NA NA NA NA NA PAICSP4 488614 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 6405382 6405492 6405403 Y NA NA NA NA NA NA MCPH1 143269 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 6481206 6481441 6481325 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 82289 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 6575644 6576065 6575803 Y MCPH1,AGPAT5 CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 11766 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 9764051 9764441 9764391 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 145337 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 9791185 9791439 9791249 Y MSRA NA LOC157627,MSRA IMR90 Hi-C 24141950 MSRA 118339 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 10192260 10192787 10192448 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 282482 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 10358887 10359102 10358991 Y MSRA NA PRSS55 IMR90 Hi-C 24141950 PINX1 336292 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 10676875 10677241 10677058 Y NA PINX1 NA NA NA NA PINX1 18153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 11013396 11013600 11013498 Y NA XKR6 NA NA NA NA XKR6 43275 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 11032163 11032532 11032339 Y NA XKR6 NA NA NA NA XKR6 24343 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 11690057 11690160 11690110 Y NA SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB NA NA NA NA RP11-297N6.4 31980 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 15443006 15443379 15443076 Y NA NA NA NA NA NA TUSC3 170282 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 16981456 16981640 16981548 Y NA ZDHHC2 NA NA NA NA ZDHHC2 29898 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 19236420 19236600 19236592 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 67292 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NPM2 NA NA NA NA NPM2 11718 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,REEP4,LGI3,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 22300361 22300587 22300487 Y BIN3,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 4029 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 22469003 22469432 22469219 Y NA PDLIM2 NA NA NA NA PDLIM2 35211 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 22522684 22522941 22522886 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 1720 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 22872750 22872814 22872762 Y NA RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 29820 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 23353842 23353942 23353892 Y TNFRSF10C,SLC25A37 ENTPD4,SLC25A37 NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A37 30376 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NEFM,NEFL NA NA NA NA NEFL 12906 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 25356816 25356840 25356828 Y NA KCTD9,CDCA2 NA NA NA NA CDCA2 42303 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr8 28886327 28886717 28886347 Y HMBOX1,HMBOX1,DUSP4 CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 24735 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 29948448 29949236 29948548 Y TMEM66,LEPROTL1 TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA LEPROTL1 1678 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr8 30892240 30892587 30892393 Y UBXN8 PURG,WRN NA NA NA NA WRN 2923 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 32553058 32553329 32553194 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 775611 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 33051592 33051837 33051715 Y NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 277103 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 33087510 33087852 33087681 Y NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 241088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 34908939 34908961 34908949 Y NA NA NA NA NA NA UNC5D 182014 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 35102956 35103087 35103023 Y NA UNC5D NA NA NA NA UNC5D 11981 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 35119361 35119644 35119503 Y UNC5D UNC5D NA NA NA NA UNC5D 28386 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 35156288 35156553 35156421 Y NA NA NA NA NA NA UNC5D 65313 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 35238175 35238554 35238365 Y UNC5D NA NA NA NA NA LSM12P1 142727 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 35270986 35270995 35270991 Y UNC5D NA NA NA NA NA LSM12P1 110286 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr8 37889292 37889604 37889448 Y NA EIF4EBP1 NA NA NA NA EIF4EBP1 3433 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 37992032 37992208 37992120 Y NA ASH2L,BAG4,LSM1 NA NA NA NA ASH2L 31272 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 38160807 38161004 38160956 Y NA PPAPDC1B NA NA NA NA PPAPDC1B 36046 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 38216773 38217155 38217067 Y WHSC1L1,LETM2 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA WHSC1L1 20635 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 38226082 38226528 38226264 Y TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA WHSC1L1 11262 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 38242599 38242872 38242674 Y TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 874 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 38433561 38433907 38433734 Y NA RNF5P1 FGFR1,LETM2,RNF5P1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF5P1 22811 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 38491506 38491745 38491628 Y FGFR1 RNF5P1 FGFR1,C8orf86,LETM2,WHSC1L1,PPAPDC1B,RNF5P1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF5P1 34788 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 38627692 38628125 38628027 Y LETM2,LETM2,C8orf86,PLEKHA2,TACC1 TACC1 NA NA NA NA TACC1 43988 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 38757431 38758061 38757845 Y C8orf86,TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 678 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 38762883 38763134 38762941 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 6130 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 38816649 38817007 38816807 Y NA HTRA4,TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA HTRA4 12676 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 38867572 38867594 38867583 Y C8orf86 HTRA4,TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 15184 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 38895649 38895937 38895811 Y TACC1,PLEKHA2,HTRA4 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 43261 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 38926192 38926523 38926358 Y NA NA NA NA NA NA ADAM9 73804 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 39918999 39919284 39919148 Y C8orf4 NA C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 89705 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 40032102 40032537 40032342 Y IDO1 C8orf4 NA NA NA NA C8orf4 23113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 40056491 40056661 40056575 Y C8orf4 C8orf4 GOLGA7,ZMAT4,IDO2 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 47502 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 41160567 41160649 41160637 Y NA SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 4367 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 41851790 41851810 41851800 Y NA NA NA NA NA NA KAT6A 55698 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 41886687 41887061 41886965 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 20447 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 41997279 41998522 41997937 Y NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP3M2 9942 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr8 42149533 42149606 42149596 Y NA RP11-231D20.2,IKBKB,POLB NA NA NA NA IKBKB 22713 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 42184337 42184357 42184347 Y NA POLB NA NA NA NA POLB 9615 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 42749479 42749732 42749583 Y NA MIR4469,HOOK3,RNF170 NA NA NA NA MIR4469 61 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA POTEA 52184 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 48242793 48242802 48242797 Y NA NA PRKDC IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA5P12 168300 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr8 48294076 48294490 48294332 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 208681 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 48343978 48344357 48344119 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 158814 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 48424795 48425379 48425168 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 77792 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 48814148 48814416 48814291 Y NA NA NA NA NA NA PRKDC 56327 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 49426742 49426952 49426814 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-567J20.1 104626 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-567J20.1 104250 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 49427546 49427722 49427633 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-567J20.1 103856 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 49470061 49470124 49470086 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-567J20.1 61454 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 49529507 49529870 49529689 Y NA RP11-567J20.1 SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-567J20.1 1708 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 49611840 49612006 49611979 Y SNAI2 EFCAB1 NA NA NA NA EFCAB1 33864 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 52747281 52747589 52747434 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD1 62146 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 52797055 52797111 52797083 Y NA PCMTD1,RP11-110G21.1 NA NA NA NA PCMTD1 12624 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 52809491 52809887 52809877 Y PCMTD1 NA NA NA NA NA PCMTD1,RP11-110G21.1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 54658367 54658716 54658684 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 95402 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 54720057 54720661 54720376 Y ATP6V1H,ATP6V1H ATP6V1H,RGS20 NA NA NA NA ATP6V1H 33457 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 55914655 55915024 55914840 Y NA NA NA NA NA NA SOX17 546160 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 59470194 59470547 59470220 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 6711 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 59476129 59476409 59476167 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 12646 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 59491466 59491801 59491581 Y UBXN2B,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 27983 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 59710658 59710976 59710817 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 14135 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 59717237 59717517 59717381 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 7594 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 59871523 59871872 59871698 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-50P 146412 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 59921030 59921384 59921260 Y NA NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 108215 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.41450010610571 chr8 59949464 59949741 59949603 Y TOX NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 79858 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 59980234 59980420 59980383 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 49179 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr8 59983682 59983838 59983818 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 45761 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr8 59995784 59996163 59995974 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 33436 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 60042677 60043119 60042763 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA TOX 12910 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 61824831 61825142 61824996 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CLVS1 142575 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CLVS1 116963 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CLVS1 116526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 63576156 63576334 63576245 Y NKAIN3 NA NA NA NA NA GGH 373396 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 65176402 65176460 65176431 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 1097290 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 66742209 66742357 66742281 Y NA PDE7A NA NA NA NA PDE7A 10200 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 66893726 66894034 66893791 Y PDE7A NA DNAJC5B IMR90 Hi-C 24141950 PDE7A 141169 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 68075038 68075412 68075329 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 81020 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 68098646 68098899 68098873 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 104628 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 71188678 71189062 71188836 Y NA NA NA NA NA NA NCOA2 124978 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA RP11-382J12.1 3798 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 71569342 71569635 71569535 Y NA LACTB2,XKR9 NA NA NA NA LACTB2 9774 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 72143679 72143939 72143809 Y NA NA NA NA NA NA EYA1 128528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 72187885 72188197 72188041 Y EYA1 NA NA NA NA NA EYA1 84270 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 72194927 72195300 72195185 Y NA NA NA NA NA NA EYA1 77167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 72468731 72468984 72468768 Y EYA1,EYA1 RP11-1102P16.1 NA NA NA NA RP11-1102P16.1 33276 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr8 72469578 72469890 72469801 Y EYA1,EYA1 RP11-1102P16.1 NA NA NA NA RP11-1102P16.1 32370 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 72917567 72918022 72917791 Y NA NA NA NA NA NA MSC 162864 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 73008234 73008433 73008334 Y NA NA TRPA1,LOC100132891 IMR90 Hi-C 24141950 MSC 253531 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 73559096 73559368 73559359 Y KCNB2 NA NA NA NA NA TERF1 359731 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 73690966 73691186 73691160 Y NA NA NA NA NA NA TERF1 227913 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 75135577 75135926 75135753 Y NA NA NA NA NA NA GDAP1 95439 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 76035291 76035498 76035400 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 140541 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 76131324 76131607 76131526 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 236574 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 77515612 77515766 77515691 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 75688 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 79000264 79000479 79000281 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 425895 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 79578942 79579038 79579012 Y IL7,FAM164A NA NA NA NA NA PKIA 152568 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 80216218 80216356 80216290 Y NA NA NA NA NA NA STMN2 304693 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18244 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 81041762 81041917 81041834 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 99550 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 81050951 81051119 81051010 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 90348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 81059132 81059394 81059212 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 82073 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 81400222 81400395 81400296 Y ZBTB10 ZBTB10 NA NA NA NA ZBTB10 4368 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 81639602 81640013 81639931 Y ZNF704 NA NA NA NA NA ZBTB10 243748 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 81695028 81695405 81695288 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 299174 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 81742521 81742946 81742703 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 279357 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 81893837 81894122 81894063 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 128181 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 81926658 81927068 81927016 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 95235 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 81933989 81934508 81934361 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 87795 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 81962809 81963138 81963038 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 59165 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 82019096 82019493 82019305 Y PAG1 PAG1 NA NA NA NA PAG1 2810 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 82046824 82047197 82047011 Y NA PAG1 NA NA NA NA PAG1 24521 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 82061220 82061392 82061249 Y ZNF704,PMP2 PAG1 PAG1 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 38917 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 82217003 82217352 82217179 Y NA FABP5,RP11-363E6.3 NA NA NA NA RP11-363E6.3 25322 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 87475103 87475472 87475288 Y NA CPNE3,SLC2A3P4 NA NA NA NA CPNE3 19587 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA SLC2A3P4 160140 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 90787257 90787620 90787439 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 19282 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 90942619 90942853 90942786 Y RIPK2,NBN,OSGIN2 OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 30532 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 94928107 94928427 94928252 Y NA NA NA NA NA NA PDP1 60072 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 95031220 95031355 95031288 Y NA NA CDH17,RAD54B,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 163185 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 95254172 95254606 95254439 Y GEM KB-1247B1.1,GEM CDH17 IMR90 Hi-C 24141950 GEM 17972 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 97173806 97174188 97174149 Y NA GDF6 NA NA NA NA GDF6 2786 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 97272793 97273157 97272974 Y NA UQCRB,MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 850 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 97873455 97873860 97873757 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 369876 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 98865970 98866240 98866105 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 9042 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 99411965 99412163 99412094 Y NIPAL2,KCNS2 NA NIPAL2,STK3,POP1,KCNS2 IMR90 Hi-C 24141950 NIPAL2 107344 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 99637150 99637421 99637401 Y NA NA NA NA NA NA STK3 315634 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 99952283 99952358 99952318 Y OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 697 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 247 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 100461450 100461455 100461453 Y NA NA NA NA NA NA VPS13B 437956 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 100594115 100594434 100594137 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 309856 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 101385316 101385524 101385421 Y NA RNF19A MIR4471 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19A 38870 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 101428409 101428827 101428524 Y RNF19A,RNF19A NA SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19A 81963 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 35564 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 102149452 102149813 102149564 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 66608 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 103249003 103249378 103249091 Y UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B KB-431C1.4 NA NA NA NA RRM2B 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 103401606 103401938 103401841 Y NA UBR5 NA NA NA NA UBR5 21131 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 103422542 103423104 103422992 Y NA NA NA NA NA NA UBR5 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 103669922 103670289 103670129 Y ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3792 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 103822630 103823284 103823186 Y NA NA NA NA NA NA KB-1507C5.2 51244 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 103933096 103933543 103933196 Y NA AZIN1 AZIN1,ATP6V1C1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 29004 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 105087342 105087776 105087510 Y NA NA NA NA NA NA DPYS 389505 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 105598029 105598284 105598149 Y TM7SF4,LRP12 LRP12 NA NA NA NA LRP12 968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 105655226 105655568 105655399 Y TM7SF4,LRP12 NA LRP12 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 55974 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 105716523 105716766 105716665 Y NA NA LRP12,DPYS IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 117271 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 106444510 106444790 106444650 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 115590 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 106764019 106764032 106764026 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 435099 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 108452941 108453080 108453009 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 55203 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 109222483 109222836 109222544 Y NA NA NA NA NA NA RSPO2 128570 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA RSPO2 136816 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 111947421 111947490 111947466 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2544L4.1 381784 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 112739475 112739733 112739604 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2544L4.1 1173838 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 114877856 114878270 114878128 Y NA NA NA NA NA NA CSMD3 430528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr8 116439816 116440252 116439936 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 379647 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 116441706 116441935 116441732 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 377964 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr8 116450341 116450508 116450425 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 369391 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 116454411 116454736 116454628 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 365163 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 116474696 116474834 116474765 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 345065 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 116641527 116641923 116641875 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 177976 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 116678291 116678885 116678654 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 141014 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 116858162 116858607 116858322 Y TRPS1 TRPS1 NA NA NA NA TRPS1 38263 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 117049380 117049760 117049565 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 229481 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 117484091 117484236 117484201 Y C8orf85 NA NA NA NA NA UTP23 292506 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 117711370 117711748 117711590 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 64994 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 117891197 117891487 117891378 Y UTP23,RAD21 MIR3610,RAD21 NA NA NA NA RAD21 6092 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 117990895 117991108 117991002 Y NA NA NA NA NA NA RAD21 105790 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 118100487 118100851 118100669 Y NA NA NA NA NA NA RAD21 215382 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 118801002 118801354 118801210 Y NA NA NA NA NA NA MED30 270050 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 119013126 119013396 119013387 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 108696 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 119323544 119323883 119323714 Y SAMD12 NA NA NA NA NA EXT1 201452 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 119339236 119339376 119339324 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 217144 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 119395540 119395777 119395661 Y EXT1 NA NA NA NA NA EXT1 273448 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 121718841 121719032 121718948 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 263199 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 123050237 123050548 123050394 Y NA NA NA NA NA NA DERL1 1002115 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 124207430 124207528 124207479 Y NA C8orf76 NA NA NA NA C8orf76 44110 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 124337288 124337362 124337325 Y NA NA NA NA NA NA ZHX1 51507 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 124363606 124363931 124363783 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2 62659 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 124407455 124407786 124407574 Y FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2 ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 18804 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 124462485 124463022 124462596 Y NA ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA WDYHV1 35520 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 124731207 124731322 124731265 Y NA FAM91A1 NA NA NA NA FAM91A1 47374 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 124816728 124816894 124816751 Y NA FAM91A1 NA NA NA NA FAM91A1 38032 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 124916792 124917079 124916936 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 138096 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 NA NA NA NA NA TMEM65 80121 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 125357334 125357543 125357438 Y NA TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 25390 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 125382714 125382961 125382953 Y NA NA NA NA NA NA TMEM65 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 125617182 125617613 125617525 Y ZNF572,RNF139 NA NA NA NA NA TATDN1 67483 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 125984707 125984742 125984718 Y ZNF572 ZNF572,SQLE NA NA NA NA ZNF572 1167 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 126037665 126038021 126037843 Y NA SQLE NA NA NA NA SQLE 28926 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 126187682 126188060 126187888 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA NA NA NA NA KIAA0196 85600 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 126232781 126233016 126232896 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 130699 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 126372255 126372562 126372409 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 68001 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 126400704 126400965 126400873 Y NA TRIB1 TRIB1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIB1 39598 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr8 126984156 126984525 126984411 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 543593 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 127489107 127489187 127489147 Y FAM84B NA NA NA NA NA FAM84B 79451 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 530819 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr8 128171088 128171312 128171255 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 574368 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 128182261 128182424 128182343 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 563256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 128237300 128237732 128237515 Y NA NA LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 507948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 128319902 128320220 128320122 Y NA NA NA NA NA NA MYC 425460 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 128888912 128889201 128889088 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 84133 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 128923296 128923609 128923453 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 97248 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 128948050 128948240 128948055 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 72617 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 128989961 128990273 128990255 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 30584 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 129888455 129888974 129888966 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 867598 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 130150064 130150272 130150167 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 877103 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 130284402 130285105 130284786 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 742270 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 130577839 130578110 130577974 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 449265 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 130897837 130898360 130898140 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 129015 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 131080516 131080850 131080671 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 53141 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 131148484 131148822 131148654 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 121109 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 131201084 131201473 131201279 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 173709 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 131206055 131206375 131206165 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 178680 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 131260848 131261137 131260957 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 192769 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 131291188 131291588 131291505 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 162318 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 131364558 131364729 131364627 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 89177 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 131612100 131612112 131612106 Y NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 158194 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 132828459 132829599 132829218 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 84736 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 133231946 133232036 133231991 Y KCNQ3,KCNQ3 NA NA NA NA NA EFR3A 317611 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 133277594 133278051 133277778 Y NA NA NA NA NA NA EFR3A 363259 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 133562041 133562364 133562205 Y HHLA1,KCNQ3,KCNQ3 NA NA NA NA NA LRRC6 123474 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 133624238 133624582 133624369 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 61256 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 120293 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr8 136247051 136247262 136247121 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 220438 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 139756041 139756387 139756229 Y COL22A1 NA NA NA NA NA COL22A1 167862 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 141108529 141108796 141108710 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 357882 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 141108929 141109987 141109387 Y KCNK9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 356691 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 141110302 141110773 141110688 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 355905 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 141800912 141801386 141801027 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA PTK2 208929 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr8 142424633 142425265 142424919 Y NA PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 24540 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 143271196 143271387 143271352 Y BAI1 NA NA NA NA NA TSNARE1 211214 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA TSNARE1 128783 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 143532398 143532722 143532656 Y LYNX1,LYNX1,LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA BAI1 3607 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 143533998 143534621 143534303 Y LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 BAI1 BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 BAI1 5207 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chr8 143696778 143697162 143696893 Y NA ARC NA NA NA NA ARC 1945 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 144629463 144629732 144629564 Y SPATC1,GRINA ZC3H3,NAPRT1,TIGD5,EEF1D NA NA NA NA ZC3H3 7840 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 144785317 144785390 144785376 Y NA ZNF707,MAPK15,FAM83H NA NA NA NA MAPK15 11039 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr8 144820199 144820570 144820386 Y RHPN1,C8orf73,FAM83H MAPK15,FAM83H NA NA NA NA FAM83H 6228 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr8 145826020 145826191 145826170 Y NA NA NA NA NA NA C8orf82 73504 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 145911932 145912089 145912059 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 2738 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 146058579 146058595 146058588 Y ARHGAP39 ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5 NA NA NA NA ZNF7 7730 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 226208 226591 226300 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 241700 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 972038 972418 972053 Y NA NA NA NA NA NA DMRT1 132348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr9 2141799 2141979 2141843 Y NA NA NA NA NA NA VLDLR 477855 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 2241944 2242239 2242031 Y NA NA NA NA NA NA VLDLR 377595 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr9 3450123 3450354 3450276 Y NA NA NA NA NA NA RFX3 73650 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 3470131 3470258 3470195 Y NA NA NA NA NA NA RFX3 53746 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 4510954 4511309 4511045 Y SLC1A1 SLC1A1 NA NA NA NA SLC1A1 22510 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 5086081 5086478 5086137 Y CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2 NA NA NA NA NA JAK2 103048 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 5844710 5844756 5844733 Y RANBP6 ERMP1 ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 ERMP1 13593 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.26473815081728 chr9 6958089 6958102 6958095 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 239226 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 8576629 8576984 8576673 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 134327 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr9 8676177 8676347 8676262 Y NA RP11-134K1.2 NA NA NA NA RP11-134K1.2 34964 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 8771816 8771826 8771822 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 60505 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 8867276 8867393 8867335 Y NA RP11-75C9.1 NA NA NA NA RP11-75C9.1 11146 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr9 14347993 14348154 14348106 Y NFIB NFIB NA NA NA NA NFIB 48828 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 14575436 14575689 14575562 Y ZDHHC21 NA NA NA NA NA ZDHHC21 115780 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 14958123 14958476 14958300 Y NA LDHAP4 NA NA NA NA LDHAP4 37791 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 16025511 16025884 16025698 Y NA NA BNC2,C9orf93,CNTLN IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 499830 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 16526132 16526493 16526417 Y BNC2 NA NA NA NA NA BNC2 342348 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 16666623 16666991 16666807 Y BNC2 NA NA NA NA NA BNC2 201850 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 16710736 16710820 16710819 Y NA NA NA NA NA NA BNC2 158021 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 16729817 16729878 16729869 Y BNC2 NA NA NA NA NA BNC2 138963 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 246525 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 19231297 19231777 19231673 Y PLIN2 NA DENND4C IMR90 Hi-C 24141950 PLIN2 84009 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 19757840 19758157 19758155 Y NA NA NA NA NA NA ACER2 350915 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr9 21984231 21984381 21984318 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 8919 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr9 22012524 22012846 22012594 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 2370 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 22026827 22027085 22026888 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 16673 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 27591202 27591627 27591327 Y C9orf72,C9orf72 C9orf72 NA NA NA NA C9orf72 19338 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1472709 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 29825337 29825639 29825488 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 861464 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 32004800 32005157 32005020 Y NA NA NA NA NA NA ACO1 377461 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 32535541 32535857 32535751 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11219 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 33023891 33023961 33023926 Y NA APTX,DNAJA1 NA NA NA NA DNAJA1 682 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 33151008 33151398 33151341 Y NA B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 13956 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 33436336 33436688 33436507 Y NA AQP3,NOL6 NA NA NA NA AQP3 8921 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 33931170 33931493 33931332 Y UBAP1,UBE2R2 NA NA NA NA NA UBAP2 115454 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 33953868 33954185 33954034 Y UBE2R2,UBAP1 NA NA NA NA NA UBAP2 92762 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 34179799 34180083 34180009 Y UBE2R2,UBAP1 UBAP1,RP11-571F15.3 NA NA NA NA UBAP1 2796 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 34588619 34588889 34588721 Y NA CNTFR,DCTN3,SIGMAR1 NA NA NA NA CNTFR 498 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 34886249 34886595 34886399 Y NA NA ATP8B5P,KIAA1045,VCP IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB5 101043 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2 NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 36166552 36166755 36166690 Y CREB3,TLN1 GLIPR2,CLTA NA NA NA NA CLTA 22098 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 36621370 36621719 36621545 Y NA NA NA NA NA NA MELK 50511 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 37032033 37032396 37032120 Y ZCCHC7,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 86140 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 37035783 37036025 37035954 Y ZCCHC7,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 82511 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 37197498 37198123 37197885 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78962 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr9 37859471 37859543 37859507 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 60037 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 37924173 37924321 37924247 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 124739 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 38074399 38074817 38074731 Y NA RP11-613M10.9,SHB DCAF10,MCART1,SHB IMR90 Hi-C 24141950 SHB 7189 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1,IGFBPL1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBPL1 15126 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 66843628 66843847 66843730 Y NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-764K9.4 1609528 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 68377347 68377469 68377407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 75906 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.03478575975959 chr9 72612607 72612791 72612699 Y NA MAMDC2 MAMDC2 IMR90 Hi-C 24141950 MAMDC2 43706 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 72653472 72653608 72653542 Y NA MAMDC2 MAMDC2 IMR90 Hi-C 24141950 MAMDC2 2889 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.41450010610571 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 73036465 73036957 73036835 Y KLF9 KLF9 TRPM3,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8925 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 74515794 74516103 74515949 Y NA C9orf85 NA NA NA NA C9orf85 8323 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 75978047 75978446 75978247 Y NA NA NA NA NA NA ANXA1 213374 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 80354506 80354684 80354595 Y NA NA NA NA NA NA GNAQ 289690 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 81003152 81003350 81003249 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 93093 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 81329740 81329936 81329769 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 419681 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 82185317 82185693 82185378 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 629 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 84989090 84989102 84989097 Y FAM75D1 NA NA NA NA NA SNORD95 487257 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 85888522 85888919 85888721 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 431590 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 86271805 86271878 86271876 Y NA RP11-522I20.3,UBQLN1 NA NA NA NA RP11-522I20.3 48631 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 88264467 88264715 88264594 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 90229 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 90115567 90115708 90115625 Y DAPK1 DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA DAPK1 5424 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 90279667 90279982 90279701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 141450 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 92004867 92005103 92005008 Y NA NA NA NA NA NA SECISBP2 73446 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 92047808 92047987 92047898 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4D 63058 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 94068286 94068635 94068479 Y NA NA NA NA NA NA AUH 53560 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 94993084 94993195 94993158 Y NA NA NA NA NA NA IARS 60843 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 95383874 95384172 95384023 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 46375 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 95973709 95973758 95973734 Y NA NA NA NA NA NA NINJ1 79139 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 96723182 96723238 96723197 Y NA BARX1,RP11-231K24.2 BARX1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-231K24.2 7303 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chr9 97622499 97622697 97622598 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 135516 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 97895370 97895760 97895554 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 182231 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 97950881 97951234 97951005 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 126757 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 98054647 98055067 98054952 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 22924 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 98075518 98075673 98075591 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 2318 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 98273818 98274186 98273872 Y NA PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3153 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 98486890 98487110 98487000 Y PTCH1,PTCH1 NA C9orf102,SLC35D2,LINC00476,HSD17B3,LINC00092,LOC158435,LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00476 149149 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 98888830 98888946 98888888 Y NA EIF4BP3 FANCC,FBP1,LOC158435,C9orf102 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4BP3 17343 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 99132173 99132333 99132255 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367 NA NA NA NA SLC35D2 11659 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 99213129 99213681 99213680 Y ZNF510,CDC14B,HABP4 RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA HABP4 2646 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 100432763 100433089 100432926 Y TSTD2,XPA NCBP1,TSTD2,XPA NA NA NA NA XPA 24550 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 100747732 100748046 100747912 Y NA ANP32B NA NA NA NA ANP32B 4089 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 101557390 101557800 101557457 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA ANKS6 143 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 101836611 101836660 101836639 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 27660 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 102007294 102007527 102007424 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 24948 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 102621794 102622137 102621866 Y NA RP11-554F20.1,NR4A3,STX17 NA NA NA NA NR4A3 39657 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 104004490 104004540 104004515 Y NA NA NA NA NA NA MRPL50 154356 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 105248809 105248820 105248818 Y NA NA NA NA NA NA GRIN3A 749947 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 109627297 109627657 109627483 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 415761 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 111872786 111872983 111872905 Y NA NA NA NA NA NA CTNNAL1 98977 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 112578065 112578653 112578312 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37296 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 112793164 112793205 112793171 Y NA RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 7526 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 112802389 112802506 112802448 Y NA RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 16751 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 114705587 114705765 114705623 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 48541 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 114783014 114783329 114783192 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 125968 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 117131457 117132230 117131898 Y DFNB31,DFNB31,AKNA NA NA NA NA NA DFNB31 133500 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 117845711 117845781 117845750 Y TNFSF15 NA NA NA NA NA C9orf91 474225 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 118953256 118953446 118953306 Y PAPPA NA NA NA NA NA TRIM32 494135 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 119311432 119311888 119311785 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 135693 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 120507373 120507587 120507563 Y NA NA NA NA NA NA ASTN2 332025 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 124031340 124031517 124031432 Y GSN RAB14 NA NA NA NA RAB14 48048 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 124260871 124261375 124261091 Y GSN GGTA1P NA NA NA NA GGTA1P 565 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.41450010610571 chr9 125654025 125654372 125654281 Y NA RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1 NA NA NA NA RC3H2 11248 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 126002195 126002288 126002252 Y OR1L6,RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,GPR21,STRBP,STRBP STRBP NA NA NA NA STRBP 26567 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 126154038 126154354 126154284 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 125183 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 126419320 126419718 126419519 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 270713 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 126624648 126624917 126624783 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 65514 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 126630393 126630526 126630439 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 59905 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 126632279 126632299 126632291 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 58132 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 126780014 126780240 126780127 Y NA LHX2 NA NA NA NA LHX2 18065 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 126780358 126780798 126780587 Y NA LHX2 NA NA NA NA LHX2 18409 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 127045133 127045416 127045344 Y NEK6,NEK6 NEK6 NA NA NA NA NEK6 27248 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 127266277 127266534 127266531 Y NA NA NA NA NA NA PSMB7 90554 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 127433186 127433516 127433351 Y NR6A1 MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 14440 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 127457265 127457441 127457351 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 38519 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 127509473 127509808 127509481 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 21781 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 6.66861934067291 chr9 128298527 128298744 128298662 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 168769 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 128299092 128299304 128299184 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 168209 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 128530354 128530667 128530385 Y NA PBX3 NA NA NA NA PBX3 22730 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 128597374 128597723 128597549 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 89750 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 129190864 129191177 129190996 Y ZBTB34 NA NA NA NA NA LMX1B 183545 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 129466839 129467134 129467067 Y NA NA NA NA NA NA LMX1B 92117 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 129484571 129485188 129484881 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 80097 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 129485609 129485808 129485757 Y FAM125B,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 79477 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 129767664 129767889 129767775 Y NA NA NA NA NA NA RALGPS1 92611 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 130179463 130179679 130179569 Y NA SLC2A8,ZNF79,SNORA65,RPL12,LRSAM1 NA NA NA NA ZNF79 4982 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 130834459 130834744 130834726 Y NA SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 5974 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 130844598 130844860 130844677 Y NA SLC25A25,NAIF1,PTGES2 NA NA NA NA NAIF1 16113 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 132145857 132146151 132146146 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,K562,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 IER5L 207317 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 226118 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chr9 132312044 132312247 132312152 Y NA NA DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 90197 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 132330921 132331424 132331168 Y IER5L,C9orf50 NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71020 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 132331590 132331738 132331651 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 70706 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 133235256 133235504 133235379 Y NA NA NCS1,ASS1,FUBP3 IMR90 Hi-C 24141950 ASS1 82812 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chr9 133619181 133619471 133619230 Y NA ABL1 NA NA NA NA ABL1 31848 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 133736245 133736518 133736410 Y ABL1 NA NA NA NA NA FIBCD1 76155 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.95459532399033 chr9 134316967 134317380 134317020 Y NA PRRC2B NA NA NA NA PRRC2B 49487 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 134581500 134581783 134581703 Y RAPGEF1 RAPGEF1 PRRC2B,UCK1,POMT1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF1 31678 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 134608936 134609538 134609242 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3923 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 134770006 134770262 134770128 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 156545 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 134950793 134951083 134950938 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 2212 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1,GFI1B NA NA NA NA GFI1B 306 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 137030495 137030803 137030732 Y NA WDR5 NA NA NA NA WDR5 32008 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 137221069 137221192 137221119 Y RXRA RXRA NA NA NA NA RXRA 14125 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 137718262 137718824 137718799 Y NA NA NA NA NA NA COL5A1 186642 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 138666183 138666357 138666270 Y NA NA NA NA NA NA KCNT1 74152 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 139591698 139592004 139591952 Y C8G EGFL7,AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA AGPAT2 11823 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chr9 139595835 139596071 139595988 Y SEC16A,LCNL1,FUT7,C9orf142,ANAPC2,ABCA2 EGFL7,AGPAT2,FAM69B,SNHG7 SNORA43,SNHG7 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM69B 8951 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 11.8425481394708 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B NA NA NA NA RNF208 3555 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.37971434634612 chr9 140301516 140301688 140301630 Y CACNA1B,NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 14026 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 140312019 140312179 140312116 Y LCNL1,ABCA2,FAM166A,C9orf173 EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 3535 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 140487255 140487495 140487481 Y CACNA1B,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7 MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA ZMYND19 4313 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 3466817 3466948 3466883 Y NA NA ARSF,MXRA5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKX 162701 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 3591324 3591658 3591618 Y NA PRKX NA NA NA NA PRKX 37991 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 3629342 3629771 3629444 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chrX 7896783 7897141 7896963 Y VCX PNPLA4 NA NA NA NA PNPLA4 3003 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 9536624 9537203 9536862 Y TBL1X,TBL1X NA NA NA NA NA TBL1X 107289 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 10135057 10135251 10135239 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 12033 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 10161663 10162021 10162010 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 38639 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 10585706 10585772 10585735 Y NA NA NA NA NA NA MID1 264001 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 10586151 10586408 10586285 Y NA NA NA NA NA NA MID1 263365 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 10712546 10712862 10712704 Y NA NA NA NA NA NA MID1 136911 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 13318186 13318365 13318276 Y NA NA NA NA NA NA GPX1P1 77094 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chrX 13958141 13958523 13958388 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 87489 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.804833368701902 chrX 18904504 18904672 18904535 Y NA NA NA NA NA NA PHKA2 96044 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 18904688 18905149 18904995 Y PHKA2 NA NA NA NA NA PHKA2 95567 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 19407416 19407434 19407425 Y NA PDHA1 NA NA NA NA PDHA1 47405 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 19701008 19701387 19701257 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA MAP3K15 169629 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 19743756 19744188 19744006 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 159531 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 20281516 20281702 20281609 Y SH3KBP1,SH3KBP1,RPS6KA3 RPS6KA3 NA NA NA NA RPS6KA3 1821 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 20614538 20614705 20614621 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA3 331015 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 23922308 23922544 23922448 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 1513 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 30592460 30592673 30592598 Y GK,CXorf21 NA NA NA NA NA FTLP2 53742 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 30744406 30744763 30744585 Y CXorf21,GK NA NA NA NA NA GK 74930 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 38165166 38165490 38165328 Y RPGR RPGR NA NA NA NA RPGR 19327 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 39680161 39680842 39680511 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 34771 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chrX 39958407 39958722 39958627 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 75860 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.574880977644216 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 40013089 40013254 40013186 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 21328 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chrX 40014046 40014813 40014331 Y BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 19769 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chrX 40028554 40028949 40028781 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 5633 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chrX 40137982 40138558 40138324 Y MED14 NA BCOR K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 103400 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 40691770 40692090 40691930 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 73147 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 40749971 40750359 40750172 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 RP11-77G22.2 USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-77G22.2 14878 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chrX 41301456 41301878 41301579 Y NA NA DDX3X K562 ChIA-PET 22265404 DDX3X 110805 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 41413588 41413590 41413589 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 222937 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 41480372 41480697 41480463 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 289721 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA EFHC2 311830 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 44142740 44143017 44142882 Y NA NA NA NA NA NA EFHC2 57901 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 44168721 44168911 44168853 Y NA EFHC2 NA NA NA NA EFHC2 32007 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 44834978 44835378 44835063 Y NA NA NA NA NA NA KDM6A 104221 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 45667037 45667329 45667199 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 41591 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 45667637 45667718 45667664 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 41202 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 45702877 45703292 45703236 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 5628 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 46148096 46148185 46148140 Y NA NA NA NA NA NA GAPDHP65 149964 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 47016809 47017199 47017004 Y NA RBM10,NDUFB11,UBA1 NA NA NA NA NDUFB11 13906 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 47142532 47142862 47142593 Y NA NA NA NA NA NA USP11 52443 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 47221089 47221361 47221213 Y NA NA USP11,ZNF157,UBA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF41 118984 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 47382833 47383145 47382966 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 ARAF 35371 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 47438054 47438403 47438273 Y CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1,SYN1 NA NA NA NA TIMP1 1309 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 47880817 47881226 47880903 Y SYN1 ZNF182,ZNF630 NA NA NA NA ZNF182 19440 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 48748801 48749222 48749175 Y NA PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2 NA NA NA NA PQBP1 3973 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 48782253 48782568 48782411 Y NA PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1 NA NA NA NA PIM2 7952 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chrX 53172968 53173150 53172985 Y NA NA NA NA NA NA LINC01155 51641 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA RIBC1 18958 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chrX 64520324 64520642 64520384 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 232013 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 145914 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA RNU1-56P,SNX12,FOXO4 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NLGN3 NA NA NA NA NLGN3 39172 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chrX 71635914 71636037 71635976 Y HDAC8 NA NA NA NA NA RPS4X 140764 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 73236075 73236382 73236224 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 73916 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 73250242 73250558 73250399 Y NA NA NA NA NA NA JPX 88083 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 73350281 73350820 73350789 Y RLIM USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 40905 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1,MAGEE2 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chrX 78179273 78179494 78179384 Y P2RY10 NA NA NA NA NA ITM2A 441670 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 78400687 78400811 78400726 Y NA NA NA NA NA NA ITM2A 220353 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.49469054187496 chrX 85404728 85405017 85404880 Y DACH2 NA NA NA NA NA CHM 104162 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA NA NA NA NA NA NAP1L3 447089 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 97535019 97535198 97535109 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 1597357 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 100664036 100664412 100664274 Y NA RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4 NA NA NA NA HNRNPH2 2753 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 100670556 100670756 100670646 Y NA RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4 NA NA NA NA ARMCX4 519 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 GPRASP1 NA NA NA NA GPRASP1 10490 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 2.18454771504802 chrX 102063503 102063615 102063509 Y NA RP11-522L3.5 NA NA NA NA RP11-522L3.5 12179 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235155 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 106693156 106693529 106693316 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 176208 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.689857173173059 chrX 107070299 107070693 107070500 Y MID2 MID2 NA NA NA NA MID2 3314 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 109017105 109017471 109017326 Y NA ACSL4 NA NA NA NA ACSL4 42473 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 110566693 110566855 110566742 Y PAK3,DCX,DCX,DCX NA NA NA NA NA EIF4BP7 295862 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 111187632 111187918 111187775 Y ZCCHC16,TRPC5 NA NA NA NA NA ALG13 280589 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 118816365 118816526 118816445 Y NKRF,RPL39,RNF113A,SEPT6 SEPT6 NA NA NA NA SEPT6 8807 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 119276319 119276451 119276385 Y FAM70A NA NA NA NA NA NKAPP1 100671 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 123735078 123735231 123735154 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 643016 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 1.6096667374038 chrX 128238716 128238747 128238732 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 416730 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 129065451 129065820 129065554 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 27354 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 129066097 129066492 129066260 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 28000 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.459904782115373 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 130751126 130751587 130751253 Y NA NA NA NA NA NA IGSF1 219449 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA CCDC160 62912 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 135275239 135275595 135275317 Y CT45A6,MMGT1,FHL1,FHL1 NA NA NA NA NA MAP7D3 61046 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 139858514 139858763 139858620 Y NA NA NA NA NA NA SOX3 273289 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 149533685 149533896 149533780 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 5996 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 149862815 149863170 149863006 Y MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3380 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 150047001 150047063 150047035 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 18226 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.229952391057686 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA PNMA3 95010 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 153947015 153947152 153947113 Y TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3 GAB3,DKC1 NA NA NA NA GAB3 30706 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 154029933 154030114 154030065 Y EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1 DKC1,MPP1 NA NA NA NA MPP1 17168 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrX 154561539 154561735 154561651 Y NA NA NA NA NA NA RAB39B 69665 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA DDX3Y 193325 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.34492858658653 chrY 17567835 17568213 17567863 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 818859 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843 chrY 28555183 28555400 28555298 Y NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5819572 CAGE DMS 144 hg19 FANTOM5 0.114976195528843